ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phyllostachys edulis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015817	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34003400
2	NC_015817	AAGT	3	786	796	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34003400
3	NC_015817	TCTTT	3	2602	2616	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	34003400
4	NC_015817	A	22	3556	3577	22	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
5	NC_015817	TTTA	3	4500	4511	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015817	CTT	4	4535	4546	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003400
7	NC_015817	TCTCT	3	4684	4697	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	34003400
8	NC_015817	TTCT	3	5143	5153	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34003400
9	NC_015817	TTAT	3	5868	5878	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015817	TTTAA	3	5981	5994	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_015817	A	13	6150	6162	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_015817	TAA	4	6397	6407	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015817	CTT	4	6800	6810	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_015817	AGT	4	6914	6925	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015817	TTGAC	3	6984	6998	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
16	NC_015817	GAA	4	9010	9021	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015817	AAAT	3	9313	9323	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015817	GAAA	3	10919	10930	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34003401
19	NC_015817	TTG	4	11324	11334	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34003401
20	NC_015817	AG	6	12041	12051	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015817	AAGT	3	12334	12344	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_015817	CGTAG	3	12927	12940	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
23	NC_015817	CTTT	6	13250	13273	24	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015817	AATCT	3	13846	13859	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
25	NC_015817	CCTT	3	14726	14737	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015817	AAGA	3	14882	14893	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_015817	TAA	4	16003	16014	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015817	TAT	4	16044	16054	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015817	ATTT	3	16468	16478	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015817	GTAT	3	17400	17410	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_015817	TGAAT	3	17920	17934	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_015817	TAA	4	18118	18128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015817	ACTTCT	3	18218	18235	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
34	NC_015817	ATAC	4	18277	18292	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
35	NC_015817	TAT	4	18812	18822	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_015817	TTTC	3	18874	18884	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_015817	AAAT	3	18914	18925	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015817	TAAGAA	3	19086	19102	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_015817	AAAG	3	19380	19390	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_015817	ATCA	3	19567	19577	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_015817	ATGA	3	19925	19936	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_015817	ATA	4	20877	20887	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_015817	CTA	4	21218	21229	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_015817	ATT	4	21326	21336	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_015817	TTTC	3	22283	22295	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	34003401
46	NC_015817	AGA	4	22309	22320	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003401
47	NC_015817	AAAAG	3	23078	23091	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	34003401
48	NC_015817	AAC	4	24955	24966	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	34003401
49	NC_015817	AAT	5	26643	26657	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34003401
50	NC_015817	AGAA	3	26871	26882	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34003401
51	NC_015817	AT	6	27942	27952	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34003401
52	NC_015817	TTCA	3	29612	29622	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	34003401
53	NC_015817	AGAAAG	3	29839	29855	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	34003401
54	NC_015817	GAA	4	30137	30148	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003401
55	NC_015817	ATTT	3	31750	31761	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_015817	ATTTTA	3	31799	31817	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_015817	TTAA	3	31841	31852	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_015817	ATT	4	31911	31923	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_015817	A	14	31954	31967	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_015817	A	17	31995	32011	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_015817	AGA	4	32401	32411	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34003402
62	NC_015817	AT	6	32860	32870	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_015817	GTT	5	33594	33608	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34003402
64	NC_015817	AT	6	34061	34071	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_015817	TGC	4	34567	34578	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34003402
66	NC_015817	CTTT	3	34834	34844	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_015817	A	13	35858	35870	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	34003402
68	NC_015817	AAAAG	3	36131	36144	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	34003402
69	NC_015817	AAAT	3	36640	36651	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34003402
70	NC_015817	TTTC	3	38470	38480	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_015817	AAAAC	3	39281	39294	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
72	NC_015817	AAGA	3	41771	41782	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	34003402
73	NC_015817	TG	6	42612	42622	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	34003402
74	NC_015817	CTAG	3	42714	42726	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	34003402
75	NC_015817	T	13	44089	44101	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015817	AAG	4	44715	44726	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003402
77	NC_015817	ATCA	3	44758	44768	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	34003402
78	NC_015817	AGT	4	45124	45134	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34003402
79	NC_015817	TCCT	3	45173	45184	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	34003402
80	NC_015817	T	13	45271	45283	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34003402
81	NC_015817	TAG	4	46027	46037	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34003402
82	NC_015817	A	27	46256	46282	27	100 %	0 %	0 %	0 %	3 %	34003402
83	NC_015817	TAT	4	46766	46776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_015817	AAAG	3	47239	47249	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_015817	GGGGAA	3	47323	47341	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
86	NC_015817	TA	6	48152	48162	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_015817	ATCTTA	3	48431	48449	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
88	NC_015817	TTTTG	3	48798	48811	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_015817	A	14	48894	48907	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_015817	G	16	48958	48973	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_015817	TTGA	3	49219	49231	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_015817	CTT	4	50363	50374	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
93	NC_015817	TATT	3	50492	50503	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015817	CAGA	3	50986	50996	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	34003403
95	NC_015817	T	14	52097	52110	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34003403
96	NC_015817	TAGG	4	54161	54176	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_015817	AATT	3	56298	56309	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_015817	AATA	4	58628	58644	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_015817	T	12	59509	59520	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_015817	TTGAA	3	60746	60760	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_015817	T	13	60905	60917	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_015817	TCTT	3	61754	61765	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	34003403
103	NC_015817	ATTC	3	61928	61938	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_015817	TTC	4	62913	62924	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003403
105	NC_015817	TGTT	3	63106	63116	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_015817	TCT	4	63340	63350	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_015817	ATA	4	65276	65286	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_015817	TTA	4	65755	65766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_015817	TAAA	3	65961	65972	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_015817	TTGAA	3	66082	66096	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	34003404
111	NC_015817	AAAG	3	66685	66695	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_015817	CGTT	3	67034	67045	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
113	NC_015817	TATT	3	67608	67618	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_015817	TTC	4	67664	67675	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_015817	AAAT	3	67936	67947	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	34003404
116	NC_015817	AT	7	68074	68086	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_015817	ATA	4	68092	68102	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_015817	T	12	68176	68187	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015817	AGAA	3	70957	70968	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	34003409
120	NC_015817	T	13	70989	71001	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	34003409
121	NC_015817	TTTA	3	74287	74298	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	34003409
122	NC_015817	A	19	74330	74348	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	34003409
123	NC_015817	GAAA	4	74400	74415	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	34003409
124	NC_015817	T	12	74534	74545	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	34003409
125	NC_015817	TCTT	5	76143	76161	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	34003409
126	NC_015817	TTTC	3	76868	76878	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34003409
127	NC_015817	AGA	4	76899	76910	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003409
128	NC_015817	TAT	4	77957	77967	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34003409
129	NC_015817	AGAA	3	78826	78836	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34003409
130	NC_015817	T	12	79130	79141	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	34003409
131	NC_015817	T	12	79148	79159	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	34003409
132	NC_015817	TTTTC	3	79733	79747	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	34003409
133	NC_015817	TTC	4	81488	81500	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34003409
134	NC_015817	TCT	4	83139	83152	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34003409
135	NC_015817	T	15	83219	83233	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	34003409
136	NC_015817	AGAAT	3	83612	83625	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	34003409
137	NC_015817	AATG	3	83626	83636	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	34003409
138	NC_015817	TTC	4	84241	84251	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34003409
139	NC_015817	TA	6	87530	87541	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34003409
140	NC_015817	TCAAAA	4	88574	88597	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	8 %	34003409
141	NC_015817	ATA	4	90898	90908	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34003409
142	NC_015817	TTTGTT	3	91817	91835	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	34003409
143	NC_015817	TTCT	3	91956	91966	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	34003409
144	NC_015817	TAC	4	92714	92725	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34003409
145	NC_015817	AAAC	3	96844	96856	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	34003407
146	NC_015817	ATCC	3	96978	96989	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	34003407
147	NC_015817	CTAT	3	97366	97377	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
148	NC_015817	ACGG	3	100236	100247	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
149	NC_015817	AGGT	3	100520	100531	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_015817	AACG	3	101845	101856	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015817	AAAG	4	103182	103197	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
152	NC_015817	GAAT	3	104799	104809	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_015817	AAGG	3	104811	104822	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
154	NC_015817	AAAG	3	105143	105153	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34003407
155	NC_015817	GTTA	3	105304	105316	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	34003407
156	NC_015817	AAG	4	106509	106520	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003407
157	NC_015817	CAAA	3	108443	108454	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	34003407
158	NC_015817	CAA	4	111942	111952	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	34003407
159	NC_015817	ATAA	4	112481	112497	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
160	NC_015817	TAT	5	112806	112819	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
161	NC_015817	TTTA	3	113305	113316	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
162	NC_015817	AAAT	3	115693	115704	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	34003407
163	NC_015817	GTT	4	116218	116228	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34003407
164	NC_015817	TC	6	117653	117664	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	34003408
165	NC_015817	ATTC	3	118084	118094	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
166	NC_015817	TAA	4	118173	118183	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
167	NC_015817	AAAT	3	118498	118508	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
168	NC_015817	CTTT	4	119696	119711	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
169	NC_015817	TCGT	3	121036	121047	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015817	CTTA	3	121243	121253	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
171	NC_015817	CCGT	3	122646	122657	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
172	NC_015817	AGGA	3	125680	125691	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34003408
173	NC_015817	GGAT	3	125904	125915	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	34003408
174	NC_015817	ATAAGC	3	126506	126523	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
175	NC_015817	GTA	4	130168	130179	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
176	NC_015817	AGAA	3	130927	130937	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	34003408
177	NC_015817	GAAAA	3	131486	131501	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
178	NC_015817	TTTTGA	4	134296	134319	24	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
179	NC_015817	TGAA	3	136449	136460	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
180	NC_015817	CATT	3	139257	139267	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
181	NC_015817	ATTCT	3	139268	139281	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
182	NC_015817	A	14	139665	139678	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phyllostachys edulis chloroplast