ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phyllostachys edulis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015817	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34003400
2	NC_015817	CTT	4	4535	4546	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003400
3	NC_015817	TAA	4	6397	6407	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_015817	CTT	4	6800	6810	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015817	AGT	4	6914	6925	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015817	GAA	4	9010	9021	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015817	TTG	4	11324	11334	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34003401
8	NC_015817	TAA	4	16003	16014	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015817	TAT	4	16044	16054	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015817	TAA	4	18118	18128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015817	TAT	4	18812	18822	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015817	ATA	4	20877	20887	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015817	CTA	4	21218	21229	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015817	ATT	4	21326	21336	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015817	AGA	4	22309	22320	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003401
16	NC_015817	AAC	4	24955	24966	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	34003401
17	NC_015817	AAT	5	26643	26657	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	34003401
18	NC_015817	GAA	4	30137	30148	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003401
19	NC_015817	ATT	4	31911	31923	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_015817	AGA	4	32401	32411	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	34003402
21	NC_015817	GTT	5	33594	33608	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	34003402
22	NC_015817	TGC	4	34567	34578	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	34003402
23	NC_015817	AAG	4	44715	44726	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003402
24	NC_015817	AGT	4	45124	45134	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34003402
25	NC_015817	TAG	4	46027	46037	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	34003402
26	NC_015817	TAT	4	46766	46776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015817	CTT	4	50363	50374	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015817	TTC	4	62913	62924	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	34003403
29	NC_015817	TCT	4	63340	63350	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015817	ATA	4	65276	65286	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_015817	TTA	4	65755	65766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015817	TTC	4	67664	67675	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_015817	ATA	4	68092	68102	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_015817	AGA	4	76899	76910	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003409
35	NC_015817	TAT	4	77957	77967	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	34003409
36	NC_015817	TTC	4	81488	81500	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34003409
37	NC_015817	TCT	4	83139	83152	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	34003409
38	NC_015817	TTC	4	84241	84251	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	34003409
39	NC_015817	ATA	4	90898	90908	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	34003409
40	NC_015817	TAC	4	92714	92725	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	34003409
41	NC_015817	AAG	4	106509	106520	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	34003407
42	NC_015817	CAA	4	111942	111952	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	34003407
43	NC_015817	TAT	5	112806	112819	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_015817	GTT	4	116218	116228	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	34003407
45	NC_015817	TAA	4	118173	118183	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_015817	GTA	4	130168	130179	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phyllostachys edulis chloroplast