ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Abidama producta mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015799	AATT	3	308	320	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33990637
2	NC_015799	ATT	4	382	392	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990637
3	NC_015799	ATA	4	465	476	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990637
4	NC_015799	AAT	4	740	751	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990637
5	NC_015799	ATA	5	816	830	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33990637
6	NC_015799	ATTT	3	833	844	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33990637
7	NC_015799	AAT	4	899	909	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33990637
8	NC_015799	TCA	4	1011	1022	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33990637
9	NC_015799	AAATTA	3	1080	1097	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	33990637
10	NC_015799	ATTAT	3	1443	1457	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	33990637
11	NC_015799	AGG	4	2061	2072	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	33990637
12	NC_015799	ATC	4	2856	2868	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	33990637
13	NC_015799	TAATTA	3	3083	3100	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33990637
14	NC_015799	AATT	3	3207	3219	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33990637
15	NC_015799	AT	7	3713	3725	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_015799	TAT	4	4040	4051	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990638
17	NC_015799	ATT	4	4160	4172	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990638
18	NC_015799	AAT	5	4536	4550	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33990638
19	NC_015799	AAT	4	4721	4732	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990638
20	NC_015799	CAAA	3	4737	4747	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	33990638
21	NC_015799	ATTA	3	4769	4779	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990638
22	NC_015799	AAT	5	5475	5488	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33990638
23	NC_015799	ATA	4	5524	5535	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990638
24	NC_015799	TAA	4	5842	5853	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015799	TAAA	3	6171	6183	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_015799	AAAGAA	3	6481	6499	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	33990638
27	NC_015799	TTAA	3	6797	6807	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990638
28	NC_015799	A	18	6809	6826	18	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33990638
29	NC_015799	AAAT	3	7206	7217	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33990638
30	NC_015799	AAGCAA	3	7470	7488	19	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	10 %	33990638
31	NC_015799	ATATA	3	7650	7663	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	33990638
32	NC_015799	AAAT	3	7860	7872	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	33990638
33	NC_015799	A	15	7875	7889	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33990638
34	NC_015799	TAA	4	8046	8057	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990638
35	NC_015799	ATA	4	8081	8093	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33990638
36	NC_015799	AAAAT	3	8159	8172	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33990638
37	NC_015799	ATAA	4	8805	8820	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	33990638
38	NC_015799	A	13	8823	8835	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33990638
39	NC_015799	AT	6	8839	8849	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990638
40	NC_015799	A	15	9006	9020	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33990638
41	NC_015799	A	23	9310	9332	23	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33990638
42	NC_015799	ATA	4	9483	9493	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33990638
43	NC_015799	AATAAA	3	9498	9515	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	33990638
44	NC_015799	AT	10	9585	9605	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990638
45	NC_015799	ATA	4	9771	9782	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990638
46	NC_015799	TAA	4	9808	9818	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33990638
47	NC_015799	TAA	5	10018	10032	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33990638
48	NC_015799	ATT	4	10613	10623	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990638
49	NC_015799	TATTAA	3	11142	11159	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33990638
50	NC_015799	TTA	4	11256	11266	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990638
51	NC_015799	TTAA	3	11396	11408	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_015799	AT	6	11575	11586	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33990638
53	NC_015799	A	14	11630	11643	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33990638
54	NC_015799	TAAA	3	11951	11962	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33990638
55	NC_015799	TAAAA	3	12101	12114	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33990638
56	NC_015799	TAAA	3	12407	12417	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33990638
57	NC_015799	AAAT	3	12497	12507	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_015799	AAT	4	12751	12763	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_015799	ATA	4	12875	12886	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015799	ATTC	3	12992	13003	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_015799	AAAAT	4	13238	13257	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
62	NC_015799	TAA	4	13259	13271	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_015799	TTAA	3	13526	13536	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_015799	AAAT	3	13624	13635	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015799	AAAT	3	13667	13678	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_015799	ATA	4	14006	14017	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_015799	TAA	4	14227	14238	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_015799	AATT	3	14708	14719	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_015799	CAAAA	3	15074	15088	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Abidama producta mitochondrion