ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phialocephala subalpina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015789	TAA	4	31	42	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015789	TAT	5	920	934	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33990623
3	NC_015789	TAT	6	1172	1189	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	33990623
4	NC_015789	TTA	4	2238	2250	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_015789	TTA	4	3665	3676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015789	ATA	5	5187	5201	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33990624
7	NC_015789	TTA	4	5932	5942	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990623
8	NC_015789	TAT	4	6068	6079	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015789	TTA	4	7595	7606	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990623
10	NC_015789	ATT	5	8704	8717	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990623
11	NC_015789	AAT	5	10946	10961	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_015789	CTT	4	12564	12575	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015789	ATT	4	15730	15741	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015789	TAT	4	16249	16259	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990624
15	NC_015789	TTA	4	16587	16599	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990624
16	NC_015789	TAA	4	16874	16885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990624
17	NC_015789	ATA	4	16939	16950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990624
18	NC_015789	TAT	4	17594	17604	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015789	TTA	4	18996	19007	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990624
20	NC_015789	AGA	4	19451	19462	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015789	AGA	4	19475	19486	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015789	TTA	4	25122	25132	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015789	TTA	4	25616	25627	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015789	ATA	5	25631	25645	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_015789	TAA	4	25795	25806	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015789	ATA	4	26038	26048	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015789	ATA	9	26296	26321	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015789	TAT	4	28090	28101	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_015789	ATA	4	28114	28125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015789	TAT	4	28827	28839	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990623
31	NC_015789	TAT	4	29194	29206	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990623
32	NC_015789	TAT	4	30439	30451	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990623
33	NC_015789	ATA	4	30930	30942	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_015789	TAA	4	30992	31003	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015789	ATT	5	31042	31057	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_015789	AAT	4	31071	31083	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_015789	ATT	4	31471	31481	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990622
38	NC_015789	TTA	4	32140	32150	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_015789	TAA	4	32472	32482	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_015789	ATA	5	32572	32586	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015789	GAT	4	33873	33884	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33990624
42	NC_015789	AGA	4	34375	34385	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_015789	TGA	4	34389	34400	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_015789	TTA	4	34466	34476	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_015789	ATA	4	34994	35006	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_015789	ATT	4	35542	35553	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990624
47	NC_015789	TAT	4	40199	40209	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990624
48	NC_015789	ATT	5	40409	40422	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990624
49	NC_015789	TAT	5	41446	41460	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phialocephala subalpina mitochondrion