ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phialocephala subalpina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015789	TAA	4	31	42	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015789	GAAAG	3	397	411	15	60 %	0 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015789	TATAA	3	432	445	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_015789	TAT	5	920	934	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33990623
5	NC_015789	TAT	6	1172	1189	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	33990623
6	NC_015789	TTTG	3	1444	1454	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33990623
7	NC_015789	TTA	4	2238	2250	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_015789	TTA	4	3665	3676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015789	AAAAC	3	4010	4024	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
10	NC_015789	AT	6	4029	4040	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33990624
11	NC_015789	AAATAA	3	4609	4626	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	33990624
12	NC_015789	ATA	5	5187	5201	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33990624
13	NC_015789	TTA	4	5932	5942	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990623
14	NC_015789	TAT	4	6068	6079	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015789	TTAG	3	6271	6281	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015789	TTA	4	7595	7606	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990623
17	NC_015789	TA	6	7605	7615	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015789	TA	6	7646	7656	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015789	AAAC	3	7901	7911	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_015789	TAAT	5	8231	8251	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015789	TACT	3	8366	8378	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	33990623
22	NC_015789	TTTA	3	8497	8508	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33990623
23	NC_015789	ATTT	3	8514	8526	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	33990623
24	NC_015789	ATT	5	8704	8717	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990623
25	NC_015789	AAAGCA	3	9937	9954	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
26	NC_015789	TCTT	3	10082	10093	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_015789	AAT	5	10946	10961	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_015789	AT	6	11827	11838	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_015789	AT	6	11858	11868	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015789	TATAT	3	11881	11894	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_015789	CTATAG	3	12391	12408	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
32	NC_015789	CTT	4	12564	12575	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_015789	A	27	12635	12661	27	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_015789	TTAA	3	13269	13280	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_015789	AATG	3	13745	13755	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_015789	TA	6	14662	14672	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_015789	T	12	15691	15702	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015789	ATT	4	15730	15741	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_015789	TAT	4	16249	16259	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990624
40	NC_015789	TTA	4	16587	16599	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990624
41	NC_015789	TAA	4	16874	16885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990624
42	NC_015789	ATA	4	16939	16950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33990624
43	NC_015789	TAAAT	4	16964	16982	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	33990624
44	NC_015789	TTCTT	3	17199	17214	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
45	NC_015789	TAAA	4	17490	17506	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_015789	TAT	4	17594	17604	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_015789	T	14	17618	17631	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_015789	ACTA	3	17713	17725	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	33990623
49	NC_015789	TTA	4	18996	19007	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990624
50	NC_015789	TTAA	3	19080	19092	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33990624
51	NC_015789	AGA	4	19451	19462	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_015789	AGA	4	19475	19486	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_015789	TTTA	3	19616	19628	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_015789	TATAAA	3	19631	19649	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_015789	TAAT	5	20041	20061	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_015789	ATTT	3	20111	20121	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_015789	AAGAA	3	21281	21295	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	33990624
58	NC_015789	GAAA	3	21676	21686	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33990624
59	NC_015789	AAACTA	3	21752	21768	17	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	33990624
60	NC_015789	TA	6	22600	22610	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_015789	AAGAA	3	22729	22743	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_015789	TAAT	3	23986	23996	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_015789	A	15	24003	24017	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_015789	CTAT	3	24982	24993	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_015789	TTA	4	25122	25132	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_015789	TTA	4	25616	25627	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_015789	ATA	5	25631	25645	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_015789	TAA	4	25795	25806	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_015789	ATA	4	26038	26048	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_015789	TAAT	3	26249	26261	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_015789	ATTA	3	26285	26296	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015789	ATA	9	26296	26321	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_015789	AT	6	27000	27010	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_015789	TA	7	27635	27647	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_015789	AT	8	27653	27667	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_015789	ATTTT	3	27737	27750	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_015789	TAT	4	28090	28101	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_015789	ATA	4	28114	28125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_015789	T	15	28680	28694	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_015789	TAT	4	28827	28839	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990623
81	NC_015789	AT	6	29014	29025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33990623
82	NC_015789	TAT	4	29194	29206	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990623
83	NC_015789	TTTA	4	29904	29918	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	33990623
84	NC_015789	TAT	4	30439	30451	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990623
85	NC_015789	T	12	30530	30541	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	33990623
86	NC_015789	ATA	4	30930	30942	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_015789	TAA	4	30992	31003	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015789	ATT	5	31042	31057	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_015789	AAT	4	31071	31083	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_015789	TTAA	3	31176	31187	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33990622
91	NC_015789	TAATAT	3	31437	31454	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33990622
92	NC_015789	ATT	4	31471	31481	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990622
93	NC_015789	TTA	4	32140	32150	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_015789	A	14	32174	32187	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_015789	T	15	32429	32443	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_015789	TATAA	3	32455	32470	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_015789	TAA	4	32472	32482	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_015789	ATA	5	32572	32586	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015789	AAAAT	4	33558	33576	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	33990624
100	NC_015789	GAT	4	33873	33884	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33990624
101	NC_015789	AGA	4	34375	34385	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_015789	TGA	4	34389	34400	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_015789	TTA	4	34466	34476	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_015789	A	14	34495	34508	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_015789	TGTTT	3	34805	34819	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_015789	ATA	4	34994	35006	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_015789	ATT	4	35542	35553	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33990624
108	NC_015789	TA	6	35623	35635	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33990624
109	NC_015789	A	17	37138	37154	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
110	NC_015789	TTTA	3	38737	38749	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	33990624
111	NC_015789	TTTA	3	39301	39311	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33990624
112	NC_015789	TTTAA	3	39550	39563	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33990624
113	NC_015789	TTAT	3	39630	39640	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33990624
114	NC_015789	TAT	4	40199	40209	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33990624
115	NC_015789	ATT	5	40409	40422	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33990624
116	NC_015789	AGTTT	3	41209	41222	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_015789	TAT	5	41446	41460	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_015789	TTTG	3	41704	41715	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_015789	TTTA	3	42850	42861	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33990623
120	NC_015789	T	15	43456	43470	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phialocephala subalpina mitochondrion