ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Schizomeris leibleinii chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015645	TAA	4	3733	3743	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015645	TAA	4	3804	3814	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015645	TTA	4	3982	3992	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_015645	CTT	4	5000	5010	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015645	TTA	4	15065	15076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015645	ATT	4	15855	15867	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33616958
7	NC_015645	TCT	4	16285	16296	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015645	GTT	4	16707	16718	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015645	AGA	4	17145	17156	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015645	CGT	4	17591	17601	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	33616960
11	NC_015645	TTC	5	18541	18555	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	33616956
12	NC_015645	ATT	4	19312	19322	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015645	ATT	4	27474	27485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
14	NC_015645	TAA	4	31569	31579	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
15	NC_015645	ATA	4	32287	32298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
16	NC_015645	TGT	4	33733	33743	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
17	NC_015645	ACA	4	33758	33768	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33616959
18	NC_015645	AGA	4	34958	34969	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
19	NC_015645	AAT	5	38235	38249	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33616959
20	NC_015645	TAT	4	38431	38443	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33616959
21	NC_015645	CTT	4	38449	38459	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33616959
22	NC_015645	TAA	4	40673	40684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
23	NC_015645	AGA	4	41426	41437	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
24	NC_015645	TTG	4	41959	41970	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
25	NC_015645	ATA	5	42155	42169	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33616959
26	NC_015645	GAT	4	45822	45832	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
27	NC_015645	GAA	4	49250	49260	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
28	NC_015645	ATT	4	50388	50398	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616959
29	NC_015645	TAA	5	51136	51150	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33616959
30	NC_015645	TAA	4	51263	51273	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
31	NC_015645	ATT	4	52255	52265	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616959
32	NC_015645	TAA	4	55829	55840	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
33	NC_015645	ATT	8	55893	55917	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
34	NC_015645	ATA	4	56077	56089	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33616959
35	NC_015645	TCT	4	58920	58931	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33616959
36	NC_015645	TAT	4	65786	65798	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33616959
37	NC_015645	ATT	4	66907	66918	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
38	NC_015645	ATA	5	69748	69762	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33616959
39	NC_015645	TCT	4	70005	70016	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33616959
40	NC_015645	AAT	4	71022	71033	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
41	NC_015645	AAC	4	71444	71455	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33616959
42	NC_015645	AAT	4	72143	72155	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33616959
43	NC_015645	TAA	4	72591	72601	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
44	NC_015645	ATA	5	72932	72945	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33616959
45	NC_015645	ATA	4	73071	73081	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
46	NC_015645	AGA	5	78813	78827	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	33616959
47	NC_015645	TTA	4	79922	79932	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616959
48	NC_015645	TAT	4	80313	80324	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
49	NC_015645	TAA	4	83129	83140	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
50	NC_015645	AAC	4	83351	83361	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33616959
51	NC_015645	TAT	4	83887	83898	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
52	NC_015645	TAA	4	84901	84912	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
53	NC_015645	ATA	4	85083	85094	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
54	NC_015645	TAA	4	86116	86126	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
55	NC_015645	GAA	4	86398	86408	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
56	NC_015645	AGA	4	87811	87822	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
57	NC_015645	TAT	4	88108	88119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
58	NC_015645	CAA	5	89560	89573	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	33616959
59	NC_015645	TAT	5	93368	93381	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33616959
60	NC_015645	TGC	4	93739	93750	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33616959
61	NC_015645	TAA	4	95711	95722	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
62	NC_015645	GGT	4	97674	97685	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	33616959
63	NC_015645	TAT	4	97963	97975	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33616959
64	NC_015645	TGT	4	99423	99434	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
65	NC_015645	ATT	4	100031	100041	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616959
66	NC_015645	TGT	4	102061	102072	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
67	NC_015645	TTC	4	102534	102544	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33616959
68	NC_015645	TAT	4	102897	102908	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
69	NC_015645	ATT	4	103407	103418	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33616959
70	NC_015645	ATT	4	103569	103580	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
71	NC_015645	ATT	4	103940	103950	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616959
72	NC_015645	AAC	4	104751	104762	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33616959
73	NC_015645	CAA	4	105946	105956	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33616959
74	NC_015645	ATT	4	107198	107209	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
75	NC_015645	TTA	4	108947	108958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
76	NC_015645	AAC	4	110166	110177	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33616959
77	NC_015645	AAT	4	110729	110739	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
78	NC_015645	CTT	4	111033	111044	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33616959
79	NC_015645	AAG	4	111406	111416	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
80	NC_015645	ATA	4	113238	113248	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
81	NC_015645	GAA	4	115388	115399	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
82	NC_015645	TTC	4	116660	116670	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33616959
83	NC_015645	TAT	4	117314	117325	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
84	NC_015645	TAT	5	120097	120111	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33616959
85	NC_015645	CAC	4	120897	120908	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	33616956
86	NC_015645	TAA	4	121994	122006	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33616956
87	NC_015645	GAA	4	123431	123442	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33616956
88	NC_015645	TTG	4	124532	124543	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33616956
89	NC_015645	TAT	4	125419	125430	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616956
90	NC_015645	TAT	8	129771	129792	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616956
91	NC_015645	ATA	4	130424	130435	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616956
92	NC_015645	TAA	4	131789	131801	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33616956
93	NC_015645	ACA	4	132137	132148	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33616956
94	NC_015645	ACT	4	133679	133690	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33616959
95	NC_015645	TTA	4	135900	135911	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
96	NC_015645	TAT	4	136030	136040	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616959
97	NC_015645	TAA	5	136148	136161	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33616959
98	NC_015645	TTG	4	137867	137878	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
99	NC_015645	TAA	5	141545	141558	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33616959
100	NC_015645	GTT	5	142554	142568	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	33616959
101	NC_015645	CAG	4	145814	145825	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33616959
102	NC_015645	AGA	4	145862	145872	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
103	NC_015645	TAT	4	148509	148520	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
104	NC_015645	TAA	4	148977	148987	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
105	NC_015645	AAT	4	149284	149295	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_015645	AGA	4	149357	149367	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_015645	TAA	5	149951	149964	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_015645	ATA	4	150963	150974	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_015645	CAA	4	152264	152274	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
110	NC_015645	ATA	4	152359	152369	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616960
111	NC_015645	ACA	4	153176	153187	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33616960
112	NC_015645	AGA	5	153637	153651	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	33616960
113	NC_015645	GAA	4	155660	155670	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33616960
114	NC_015645	AAT	4	156861	156872	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616960
115	NC_015645	TAA	4	158634	158646	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_015645	TAA	5	160259	160273	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015645	CAG	4	169168	169178	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	33616957
118	NC_015645	GCT	5	169852	169866	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	33616957
119	NC_015645	TAA	4	170057	170068	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616957
120	NC_015645	AAG	4	172140	172151	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33616957
121	NC_015645	GAA	5	173518	173532	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_015645	TAA	4	173999	174009	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_015645	ATT	4	174915	174925	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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126	NC_015645	ATA	4	181160	181170	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Schizomeris leibleinii chloroplast