ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Schizomeris leibleinii chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015645	TATT	3	653	664	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015645	TATT	3	1009	1020	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015645	AAAC	3	2474	2485	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015645	CTTT	3	2551	2562	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015645	TTTA	3	3222	3233	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015645	TTAA	3	3751	3762	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015645	TTAA	3	3822	3833	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015645	TAAA	3	3958	3968	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_015645	TTTA	3	3999	4009	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015645	CTTT	3	4018	4028	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015645	AAAT	3	4231	4242	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015645	TTAT	3	4344	4355	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015645	TAAA	3	5378	5389	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015645	TTAA	3	9477	9488	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015645	AAAC	3	11525	11536	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
16	NC_015645	ATGG	3	12887	12897	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	33616962
17	NC_015645	TTAT	3	14376	14387	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015645	TTTA	3	14613	14623	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015645	AAAT	3	15419	15429	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_015645	AAAG	3	15917	15927	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015645	TTTA	3	15996	16007	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015645	ATTT	3	17605	17616	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33616960
23	NC_015645	TTAT	3	19394	19405	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015645	AATT	3	20338	20349	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
25	NC_015645	AAAG	3	21500	21512	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	33616959
26	NC_015645	GAAA	3	21628	21639	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	33616959
27	NC_015645	ATTT	3	23358	23368	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
28	NC_015645	TTGT	3	25156	25166	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
29	NC_015645	TGTT	3	26039	26050	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	33616959
30	NC_015645	TGTT	3	31982	31993	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	33616959
31	NC_015645	TATT	4	32797	32811	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	33616959
32	NC_015645	GTTT	3	34034	34045	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	33616959
33	NC_015645	TTTA	3	34306	34317	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33616959
34	NC_015645	GTTT	3	34656	34666	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
35	NC_015645	AAAC	3	36195	36205	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	33616959
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37	NC_015645	CAAA	3	37213	37224	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33616959
38	NC_015645	TGTT	3	38658	38668	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
39	NC_015645	ATTT	3	39197	39207	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
40	NC_015645	TATT	3	39734	39744	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
41	NC_015645	CAAA	3	39750	39760	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	33616959
42	NC_015645	TATT	3	42106	42117	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33616959
43	NC_015645	TTAA	3	42170	42181	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
44	NC_015645	ATTT	3	42672	42682	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
45	NC_015645	TACA	3	44669	44679	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33616959
46	NC_015645	TAAA	3	46597	46607	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33616959
47	NC_015645	TTAA	4	52198	52212	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33616959
48	NC_015645	CTTT	3	52324	52334	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	33616959
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50	NC_015645	AAAG	3	57979	57989	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33616959
51	NC_015645	AGAA	3	59817	59828	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	33616959
52	NC_015645	CAAA	3	60583	60594	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33616959
53	NC_015645	TCAA	3	61599	61610	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	33616959
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55	NC_015645	AAAC	3	62153	62164	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33616959
56	NC_015645	TTAA	3	62257	62268	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
57	NC_015645	ATTT	3	63800	63811	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33616959
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59	NC_015645	TAAA	3	66332	66343	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33616959
60	NC_015645	TTAT	3	67706	67716	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
61	NC_015645	AATT	3	72178	72188	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33616959
62	NC_015645	TTTG	3	73192	73202	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
63	NC_015645	CAAA	3	75523	75534	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33616959
64	NC_015645	ATTT	3	76216	76227	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33616959
65	NC_015645	AAAG	3	77408	77418	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33616959
66	NC_015645	GAAA	3	81831	81841	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33616959
67	NC_015645	AAAC	3	82125	82135	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	33616959
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70	NC_015645	GTTT	3	83250	83260	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
71	NC_015645	TTAT	3	84342	84352	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
72	NC_015645	TTTA	3	84416	84426	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
73	NC_015645	ATTT	3	86006	86016	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
74	NC_015645	AATT	3	87168	87179	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
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104	NC_015645	ATAA	3	123011	123022	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33616956
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109	NC_015645	ATTT	3	127380	127390	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616956
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114	NC_015645	TTTG	3	132329	132339	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616956
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119	NC_015645	AATT	3	139507	139518	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
120	NC_015645	AATT	3	140408	140418	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33616959
121	NC_015645	ATTA	3	140930	140940	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33616959
122	NC_015645	AATT	3	141863	141874	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
123	NC_015645	AATT	3	142146	142157	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
124	NC_015645	CTTT	3	142651	142661	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	33616959
125	NC_015645	GAAA	3	144196	144206	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33616959
126	NC_015645	AAAG	3	144210	144220	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33616959
127	NC_015645	ATAA	3	145471	145481	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33616959
128	NC_015645	AAAT	3	145652	145663	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33616959
129	NC_015645	TTTG	3	146638	146648	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
130	NC_015645	CAAA	3	146798	146810	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	33616959
131	NC_015645	TAAA	3	150098	150109	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_015645	AAGA	3	151208	151218	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_015645	AATT	3	151840	151850	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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135	NC_015645	AATT	3	153910	153921	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616960
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163	NC_015645	AATT	3	182633	182644	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Schizomeris leibleinii chloroplast