ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Schizomeris leibleinii chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015645	A	13	127	139	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_015645	TATT	3	653	664	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015645	TTTTA	3	865	878	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_015645	TATT	3	1009	1020	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015645	AAAC	3	2474	2485	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015645	CTTT	3	2551	2562	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015645	T	15	2661	2675	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_015645	T	13	2930	2942	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015645	TTTA	3	3222	3233	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015645	T	13	3534	3546	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_015645	T	12	3715	3726	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015645	TAA	4	3733	3743	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015645	TTAA	3	3751	3762	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015645	T	12	3786	3797	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015645	TAA	4	3804	3814	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015645	TTAA	3	3822	3833	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015645	TAAA	3	3958	3968	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015645	TTA	4	3982	3992	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015645	TTTA	3	3999	4009	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_015645	CTTT	3	4018	4028	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015645	AAAT	3	4231	4242	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015645	TTAT	3	4344	4355	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015645	CTT	4	5000	5010	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015645	TAAA	3	5378	5389	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015645	TA	6	5517	5527	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015645	TTAA	3	9477	9488	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_015645	AAAC	3	11525	11536	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015645	AT	7	12397	12410	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_015645	AT	8	12631	12645	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33616962
30	NC_015645	ATGG	3	12887	12897	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	33616962
31	NC_015645	TTAT	3	14376	14387	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015645	TTTA	3	14613	14623	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015645	TTA	4	15065	15076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_015645	AAAT	3	15419	15429	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_015645	ATT	4	15855	15867	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33616958
36	NC_015645	AAAG	3	15917	15927	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_015645	TTTA	3	15996	16007	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015645	TCT	4	16285	16296	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_015645	T	15	16667	16681	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_015645	GTT	4	16707	16718	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015645	A	13	16734	16746	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_015645	AGA	4	17145	17156	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_015645	CGT	4	17591	17601	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	33616960
44	NC_015645	ATTT	3	17605	17616	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33616960
45	NC_015645	T	12	17669	17680	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_015645	TTC	5	18541	18555	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	33616956
47	NC_015645	ATT	4	19312	19322	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_015645	TTAT	3	19394	19405	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015645	AAAAT	3	19409	19423	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_015645	AATT	3	20338	20349	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
51	NC_015645	AAAG	3	21500	21512	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	33616959
52	NC_015645	GAAA	3	21628	21639	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	33616959
53	NC_015645	ATTT	3	23358	23368	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
54	NC_015645	TA	6	23589	23600	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
55	NC_015645	GTTTA	6	23954	23984	31	20 %	60 %	20 %	0 %	9 %	33616959
56	NC_015645	TTGT	3	25156	25166	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
57	NC_015645	TGTT	3	26039	26050	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	33616959
58	NC_015645	ATTTTT	3	27021	27039	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	33616959
59	NC_015645	ATT	4	27474	27485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
60	NC_015645	TTTCT	3	30715	30728	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	33616959
61	NC_015645	TAA	4	31569	31579	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
62	NC_015645	TGTT	3	31982	31993	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	33616959
63	NC_015645	ATA	4	32287	32298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
64	NC_015645	TATT	4	32797	32811	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	33616959
65	NC_015645	AG	7	32821	32834	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	33616959
66	NC_015645	T	13	33049	33061	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33616959
67	NC_015645	TAAAA	3	33705	33719	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	33616959
68	NC_015645	TGT	4	33733	33743	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
69	NC_015645	ACA	4	33758	33768	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33616959
70	NC_015645	GTTT	3	34034	34045	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	33616959
71	NC_015645	TTTA	3	34306	34317	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33616959
72	NC_015645	GTTT	3	34656	34666	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
73	NC_015645	AGA	4	34958	34969	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
74	NC_015645	AAAC	3	36195	36205	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	33616959
75	NC_015645	T	16	36518	36533	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33616959
76	NC_015645	TTAA	3	36594	36605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
77	NC_015645	TAAATA	4	36741	36765	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
78	NC_015645	CAAA	3	37213	37224	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33616959
79	NC_015645	AAT	5	38235	38249	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33616959
80	NC_015645	TAT	4	38431	38443	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33616959
81	NC_015645	CTT	4	38449	38459	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33616959
82	NC_015645	TGTT	3	38658	38668	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33616959
83	NC_015645	ATTT	3	39197	39207	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
84	NC_015645	TATT	3	39734	39744	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
85	NC_015645	CAAA	3	39750	39760	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	33616959
86	NC_015645	TAA	4	40673	40684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
87	NC_015645	AGA	4	41426	41437	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
88	NC_015645	TTG	4	41959	41970	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33616959
89	NC_015645	TATT	3	42106	42117	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33616959
90	NC_015645	T	13	42140	42152	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33616959
91	NC_015645	ATA	5	42155	42169	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33616959
92	NC_015645	TTAA	3	42170	42181	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
93	NC_015645	ATTT	3	42672	42682	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33616959
94	NC_015645	T	14	42805	42818	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33616959
95	NC_015645	TACA	3	44669	44679	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33616959
96	NC_015645	GAT	4	45822	45832	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
97	NC_015645	TAAA	3	46597	46607	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33616959
98	NC_015645	A	19	46869	46887	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	33616959
99	NC_015645	GAA	4	49250	49260	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33616959
100	NC_015645	ATT	4	50388	50398	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616959
101	NC_015645	TAA	5	51136	51150	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33616959
102	NC_015645	TAA	4	51263	51273	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33616959
103	NC_015645	T	19	51304	51322	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	33616959
104	NC_015645	AT	6	51796	51807	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
105	NC_015645	TTATT	3	51873	51887	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	33616959
106	NC_015645	TTAA	4	52198	52212	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33616959
107	NC_015645	ATT	4	52255	52265	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33616959
108	NC_015645	CTTT	3	52324	52334	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	33616959
109	NC_015645	AAAAT	3	54507	54520	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33616959
110	NC_015645	A	15	54531	54545	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33616959
111	NC_015645	AAAT	3	55422	55432	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33616959
112	NC_015645	TA	6	55553	55563	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33616959
113	NC_015645	AT	6	55566	55576	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33616959
114	NC_015645	TAA	4	55829	55840	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33616959
115	NC_015645	ATT	8	55893	55917	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
116	NC_015645	ATA	4	56077	56089	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33616959
117	NC_015645	AT	9	56184	56200	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33616959
118	NC_015645	TAAAAA	4	56505	56528	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
119	NC_015645	A	12	56847	56858	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	33616959
120	NC_015645	AAAG	3	57979	57989	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33616959
121	NC_015645	TCT	4	58920	58931	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33616959
122	NC_015645	AAATT	3	59733	59748	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	33616959
123	NC_015645	AGAA	3	59817	59828	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	33616959
124	NC_015645	AAAAT	3	60567	60582	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	33616959
125	NC_015645	CAAA	3	60583	60594	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33616959
126	NC_015645	TTCTA	3	60793	60807	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	33616959
127	NC_015645	TCAA	3	61599	61610	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	33616959
128	NC_015645	AAAC	3	62096	62107	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33616959
129	NC_015645	AAAC	3	62153	62164	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33616959
130	NC_015645	TTAA	3	62257	62268	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33616959
131	NC_015645	ATTT	3	63800	63811	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33616959
132	NC_015645	TAT	4	65786	65798	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33616959
133	NC_015645	TTCT	3	66016	66026	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	33616959
134	NC_015645	TAAA	3	66332	66343	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33616959
135	NC_015645	ATT	4	66907	66918	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33616959
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261	NC_015645	ATAA	3	123011	123022	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33616956
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270	NC_015645	AAAT	3	127339	127350	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33616956
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277	NC_015645	AAAT	3	131611	131622	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33616956
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281	NC_015645	CTTT	3	132474	132485	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	33616956
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386	NC_015645	GAAA	3	176249	176260	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
387	NC_015645	TTTA	3	176323	176334	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
388	NC_015645	TTAT	3	176684	176696	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	33616961
389	NC_015645	TTTA	3	177262	177273	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33616961
390	NC_015645	ACA	4	177576	177587	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	33616961
391	NC_015645	A	13	177765	177777	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
392	NC_015645	TCTT	3	179161	179171	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
393	NC_015645	AAGAA	3	179517	179530	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
394	NC_015645	TTTTC	3	180311	180326	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
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396	NC_015645	AT	6	180711	180722	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
397	NC_015645	A	13	180984	180996	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
398	NC_015645	TTA	4	181149	181159	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
399	NC_015645	ATA	4	181160	181170	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
400	NC_015645	AGGAAA	3	182580	182597	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
401	NC_015645	AATT	3	182633	182644	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Schizomeris leibleinii chloroplast