ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Olea europaea subsp. maroccana chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015623TCAA43243381550 %25 %0 %25 %6 %Non-Coding
2NC_015623CTTT3359370120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
3NC_015623AAGT3124412541150 %25 %25 %0 %9 %33470186
4NC_015623CATT3414941601225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
5NC_015623AAAT3523752481275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_015623AAAT3685268631275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_015623TAAA3931493291675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_015623TTTA3995899691225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_015623AAAT313465134751175 %25 %0 %0 %9 %33470187
10NC_015623ATTT315399154091125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
11NC_015623TATT316710167221325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_015623TGTT31705817068110 %75 %25 %0 %9 %33470187
13NC_015623GAAT323877238871150 %25 %25 %0 %9 %33470187
14NC_015623CCTA325683256931125 %25 %0 %50 %9 %33470188
15NC_015623GTAT332999330111325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
16NC_015623ATGA333475334851150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
17NC_015623TTCT33401834029120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
18NC_015623GAAA336087360981275 %0 %25 %0 %8 %33470188
19NC_015623GAAT339780397901150 %25 %25 %0 %9 %33470188
20NC_015623ATTT343696437071225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_015623CATA350201502111150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
22NC_015623CTTT35045050462130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
23NC_015623TAAA353904539141175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_015623TATT356950569601125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_015623TGCA358251582631325 %25 %25 %25 %7 %33470189
26NC_015623GTTA459149591631525 %50 %25 %0 %6 %Non-Coding
27NC_015623TAGA361499615101250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
28NC_015623TGAA362777627871150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
29NC_015623GAAA363015630261275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
30NC_015623TTTC36749467505120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
31NC_015623GAAA370441704521275 %0 %25 %0 %8 %33470190
32NC_015623TGAA371562715731250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
33NC_015623TTTC37159671608130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
34NC_015623GGTT37611276123120 %50 %50 %0 %8 %33470191
35NC_015623CAAA576757767751975 %0 %0 %25 %10 %Non-Coding
36NC_015623CAAT385241852511150 %25 %0 %25 %9 %33470192
37NC_015623TTTC38626586275110 %75 %0 %25 %9 %33470192
38NC_015623ATCG391038910501325 %25 %25 %25 %7 %33470193
39NC_015623AATA394172941841375 %25 %0 %0 %7 %33470193
40NC_015623TATG396571965821225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
41NC_015623ATCC31047571047681225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
42NC_015623TCTA31051521051631225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
43NC_015623AAGG31052901053001150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
44NC_015623GAGG31080111080221225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
45NC_015623AGGT31082241082351225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
46NC_015623TAAG31093441093541150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
47NC_015623ATTT31104061104161125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
48NC_015623GGAA31114241114341150 %0 %50 %0 %9 %33470193
49NC_015623AAAT31205901206011275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
50NC_015623TCTA31224271224381225 %50 %0 %25 %8 %33470194
51NC_015623AATC31228621228731250 %25 %0 %25 %8 %33470194
52NC_015623TTTG3126442126453120 %75 %25 %0 %8 %33470194
53NC_015623TTTA31265131265241225 %75 %0 %0 %8 %33470194
54NC_015623CATT31273861273971225 %50 %0 %25 %8 %33470194
55NC_015623AAAG31289641289741175 %0 %25 %0 %9 %33470194
56NC_015623CTTT3129858129868110 %75 %0 %25 %9 %33470194
57NC_015623TTCC3131086131096110 %50 %0 %50 %9 %33470194
58NC_015623ATAA41321021321161575 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
59NC_015623CTTA31331661331761125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
60NC_015623CCTT3137220137230110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
61NC_015623GGAT31377521377631225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
62NC_015623TATT31483361483481325 %75 %0 %0 %7 %33470195
63NC_015623TGAT31493471493591325 %50 %25 %0 %7 %33470195
64NC_015623CGAT31514701514821325 %25 %25 %25 %7 %33470195
65NC_015623ATTT31521001521111225 %75 %0 %0 %8 %33470195