ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olea europaea subsp. maroccana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015623	AGT	4	422	433	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015623	AAG	4	3032	3043	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470186
3	NC_015623	GAA	4	3062	3073	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470186
4	NC_015623	GTT	4	5162	5172	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015623	CAA	4	9781	9792	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015623	CAA	4	29807	29818	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015623	TTG	4	36492	36502	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	33470188
8	NC_015623	TTC	4	36937	36948	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470188
9	NC_015623	TAA	4	38102	38112	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015623	GAT	4	40475	40486	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470188
11	NC_015623	GCA	4	42374	42385	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470188
12	NC_015623	TAA	4	44067	44077	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015623	GTA	4	46453	46463	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_015623	GTT	4	46664	46674	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015623	TAT	4	48233	48245	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_015623	TTA	4	52828	52839	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015623	AGA	4	53048	53059	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015623	TTA	4	53635	53646	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_015623	ATA	4	56580	56590	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470189
20	NC_015623	TTA	4	59346	59358	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015623	TAA	4	61545	61557	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_015623	ATA	4	69399	69410	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015623	TTG	4	70988	70998	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015623	ATT	4	74710	74720	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_015623	TCT	4	76483	76494	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470191
26	NC_015623	TTC	4	85168	85179	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470192
27	NC_015623	GAT	4	87201	87211	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33470192
28	NC_015623	GAT	4	88583	88593	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015623	GAT	4	91613	91624	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470193
30	NC_015623	TGA	4	93307	93318	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470193
31	NC_015623	TTC	4	101146	101157	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015623	AGA	4	112394	112404	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33470193
33	NC_015623	TAA	4	113484	113495	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470193
34	NC_015623	AAG	4	113709	113720	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470193
35	NC_015623	TAT	4	113898	113908	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470193
36	NC_015623	GAA	4	114470	114481	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470193
37	NC_015623	AGA	4	117328	117339	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015623	CTT	4	129420	129432	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	33470194
39	NC_015623	GAA	4	141363	141374	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015623	ATC	4	150896	150907	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33470195
41	NC_015623	ATC	4	153927	153937	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_015623	ATC	4	155309	155319	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33470195

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olea europaea subsp. maroccana chloroplast