ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phytophthora ipomoeae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015622	TAT	4	110	120	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015622	ATT	4	2944	2955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015622	ATT	5	2973	2987	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015622	ATT	5	4040	4054	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33628721
5	NC_015622	TAA	4	4066	4077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33628721
6	NC_015622	TTA	4	5124	5134	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_015622	TAT	4	8460	8470	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33628721
8	NC_015622	TAT	4	8957	8968	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628721
9	NC_015622	TAA	4	10572	10584	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_015622	CTT	4	11495	11506	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33628722
11	NC_015622	ATT	4	11593	11604	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628722
12	NC_015622	TAT	4	12417	12427	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015622	CTA	4	13739	13749	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33628722
14	NC_015622	ACA	7	13837	13857	21	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33628722
15	NC_015622	TAA	4	14635	14647	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33628722
16	NC_015622	ATA	4	15650	15660	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628722
17	NC_015622	TAT	4	17623	17633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33628722
18	NC_015622	ATA	4	17697	17707	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628722
19	NC_015622	TAT	5	18701	18715	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33628722
20	NC_015622	ATT	4	19118	19129	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015622	ATT	5	20635	20648	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33628722
22	NC_015622	ACA	5	20673	20686	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	33628722
23	NC_015622	TAT	4	21392	21403	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628722
24	NC_015622	ACA	4	21438	21448	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33628722
25	NC_015622	TTG	4	21487	21498	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33628722
26	NC_015622	TGG	4	21528	21538	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	33628722
27	NC_015622	ATT	4	24924	24936	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33628723
28	NC_015622	TTA	4	24937	24948	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628723
29	NC_015622	ATT	4	25164	25176	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33628723
30	NC_015622	TAT	4	25599	25609	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33628723
31	NC_015622	CTG	4	26074	26085	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33628723
32	NC_015622	ATA	5	26167	26181	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33628723
33	NC_015622	TCT	4	27160	27170	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33628723
34	NC_015622	TAT	4	27851	27862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628723
35	NC_015622	TTA	4	28516	28527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628723
36	NC_015622	ATA	4	29437	29449	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_015622	TAA	4	32779	32790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33628724
38	NC_015622	TAA	5	32878	32892	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33628724
39	NC_015622	TAA	5	34021	34034	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33628724
40	NC_015622	TAA	4	34188	34198	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628724
41	NC_015622	TAG	4	36358	36368	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33628724
42	NC_015622	TAA	4	36526	36537	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33628724
43	NC_015622	TAA	4	36862	36872	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628724
44	NC_015622	TAA	4	37094	37104	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628724
45	NC_015622	ATA	4	37365	37375	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628725
46	NC_015622	TAA	4	37498	37508	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628725

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phytophthora ipomoeae mitochondrion