ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phytophthora ipomoeae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015622	TAT	4	110	120	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015622	TTAA	3	2819	2830	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015622	ATT	4	2944	2955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015622	ATT	5	2973	2987	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015622	A	12	3310	3321	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33628721
6	NC_015622	CATA	3	3363	3373	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33628721
7	NC_015622	AATT	4	3697	3713	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33628721
8	NC_015622	ATT	5	4040	4054	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33628721
9	NC_015622	TAA	4	4066	4077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33628721
10	NC_015622	ATTT	3	4478	4488	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015622	TA	6	4818	4828	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015622	TTA	4	5124	5134	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015622	TAAAA	3	6230	6243	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_015622	TTTA	3	6543	6554	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015622	AAATT	3	6847	6860	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_015622	AATTTA	3	6909	6926	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_015622	TTAA	3	6934	6945	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015622	TTTTAT	4	7007	7030	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	33628721
19	NC_015622	TTAA	3	7187	7198	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33628721
20	NC_015622	TTTA	3	7502	7514	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015622	A	15	7827	7841	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33628721
22	NC_015622	TAAA	3	8373	8383	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33628721
23	NC_015622	AT	6	8419	8429	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33628721
24	NC_015622	TAT	4	8460	8470	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33628721
25	NC_015622	TTAAA	3	8576	8590	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_015622	TAT	4	8957	8968	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628721
27	NC_015622	TTAG	3	9590	9601	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	33628721
28	NC_015622	TTAT	3	9874	9884	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33628721
29	NC_015622	AAAT	3	10077	10088	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33628721
30	NC_015622	TAA	4	10572	10584	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_015622	ATTA	3	10882	10893	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33628721
32	NC_015622	ATAA	5	11162	11181	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	33628721
33	NC_015622	AATT	3	11196	11207	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_015622	CTT	4	11495	11506	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33628722
35	NC_015622	ATT	4	11593	11604	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628722
36	NC_015622	TTTTTA	3	11957	11975	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	33628722
37	NC_015622	GTTA	3	12219	12229	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	33628722
38	NC_015622	T	15	12315	12329	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33628722
39	NC_015622	TAT	4	12417	12427	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_015622	ATTAA	3	12451	12464	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_015622	CTA	4	13739	13749	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33628722
42	NC_015622	ACA	7	13837	13857	21	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33628722
43	NC_015622	ATAA	4	14579	14594	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	33628722
44	NC_015622	TAA	4	14635	14647	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33628722
45	NC_015622	ATA	4	15650	15660	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628722
46	NC_015622	TAAA	3	15721	15732	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015622	AT	9	16153	16170	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33628722
48	NC_015622	TTGAAT	3	16519	16537	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	33628722
49	NC_015622	AT	8	16903	16917	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33628722
50	NC_015622	TA	7	17479	17492	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_015622	TAT	4	17623	17633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33628722
52	NC_015622	ATA	4	17697	17707	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628722
53	NC_015622	TAAT	3	18686	18697	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33628722
54	NC_015622	TAT	5	18701	18715	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33628722
55	NC_015622	AAAAT	3	18915	18928	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33628722
56	NC_015622	TTAA	3	18942	18952	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33628722
57	NC_015622	ATT	4	19118	19129	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_015622	A	16	19835	19850	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33628722
59	NC_015622	AAAT	3	20169	20180	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33628722
60	NC_015622	TTTAA	3	20245	20258	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33628722
61	NC_015622	A	17	20360	20376	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	33628722
62	NC_015622	ATT	5	20635	20648	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33628722
63	NC_015622	ACA	5	20673	20686	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	33628722
64	NC_015622	T	15	21266	21280	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33628722
65	NC_015622	TAT	4	21392	21403	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628722
66	NC_015622	ACA	4	21438	21448	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33628722
67	NC_015622	TTG	4	21487	21498	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33628722
68	NC_015622	TGG	4	21528	21538	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	33628722
69	NC_015622	T	16	21817	21832	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33628723
70	NC_015622	AAAAT	3	22791	22806	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_015622	TAAA	3	22857	22868	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015622	AT	7	22883	22895	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_015622	AT	10	22899	22917	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_015622	TA	6	23132	23142	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33628723
75	NC_015622	ATATT	3	23167	23180	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33628723
76	NC_015622	TCAA	3	24505	24515	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33628723
77	NC_015622	ATT	4	24924	24936	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33628723
78	NC_015622	TTA	4	24937	24948	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628723
79	NC_015622	ATT	4	25164	25176	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33628723
80	NC_015622	T	12	25578	25589	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33628723
81	NC_015622	TAT	4	25599	25609	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33628723
82	NC_015622	A	13	25649	25661	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33628723
83	NC_015622	TAAAAC	3	25753	25770	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
84	NC_015622	AATTT	3	25861	25875	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_015622	CTG	4	26074	26085	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33628723
86	NC_015622	AAAAT	3	26141	26154	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33628723
87	NC_015622	ATA	5	26167	26181	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33628723
88	NC_015622	AAAT	3	26483	26494	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33628723
89	NC_015622	TCT	4	27160	27170	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33628723
90	NC_015622	TA	6	27530	27540	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33628723
91	NC_015622	TAT	4	27851	27862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628723
92	NC_015622	TTA	4	28516	28527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33628723
93	NC_015622	ATA	4	29437	29449	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_015622	TATT	3	30068	30079	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33628723
95	NC_015622	ATTT	3	30147	30158	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33628723
96	NC_015622	AT	7	30247	30260	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33628723
97	NC_015622	T	14	30681	30694	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33628723
98	NC_015622	T	12	31019	31030	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33628723
99	NC_015622	TTTA	3	31175	31186	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33628723
100	NC_015622	TTAA	3	31334	31346	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33628723
101	NC_015622	A	15	32321	32335	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33628724
102	NC_015622	TTAA	3	32391	32402	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33628724
103	NC_015622	A	16	32573	32588	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33628724
104	NC_015622	TAA	4	32779	32790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33628724
105	NC_015622	TA	7	32793	32806	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33628724
106	NC_015622	TAA	5	32878	32892	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33628724
107	NC_015622	A	14	32968	32981	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33628724
108	NC_015622	TAAATT	3	33348	33366	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33628724
109	NC_015622	A	14	33909	33922	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33628724
110	NC_015622	AAAT	3	33972	33982	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33628724
111	NC_015622	TAA	5	34021	34034	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33628724
112	NC_015622	TAA	4	34188	34198	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628724
113	NC_015622	AATA	3	34527	34537	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33628724
114	NC_015622	T	12	34664	34675	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33628724
115	NC_015622	A	14	34738	34751	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33628724
116	NC_015622	TTTA	3	34969	34979	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33628724
117	NC_015622	TA	6	35497	35507	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33628724
118	NC_015622	A	12	35780	35791	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	33628724
119	NC_015622	AATTAA	3	36175	36192	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	33628724
120	NC_015622	TAG	4	36358	36368	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33628724
121	NC_015622	AAAT	3	36494	36505	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33628724
122	NC_015622	A	18	36511	36528	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	33628724
123	NC_015622	TAA	4	36526	36537	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33628724
124	NC_015622	ATTT	3	36546	36556	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33628724
125	NC_015622	AAAT	3	36595	36606	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33628724
126	NC_015622	TAAA	3	36688	36699	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33628724
127	NC_015622	TAA	4	36862	36872	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628724
128	NC_015622	ACAA	3	36995	37007	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	33628724
129	NC_015622	TAA	4	37094	37104	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628724
130	NC_015622	GAAA	3	37247	37257	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33628725
131	NC_015622	ATA	4	37365	37375	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628725
132	NC_015622	ATTT	3	37390	37400	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33628725
133	NC_015622	TAA	4	37498	37508	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33628725
134	NC_015622	AAAAT	3	37577	37590	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33628725
135	NC_015622	AAAT	3	37599	37609	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33628725
136	NC_015622	AAAT	3	37761	37772	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33628725
137	NC_015622	ATTTAA	3	37829	37846	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33628725
138	NC_015622	A	13	37860	37872	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33628725

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phytophthora ipomoeae mitochondrion