ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ageratina adenophora chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015621	TCT	4	819	829	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33470178
2	NC_015621	TAC	4	1943	1955	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_015621	ATT	4	2016	2028	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_015621	TTC	4	2204	2215	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470178
5	NC_015621	GAA	4	3009	3020	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470178
6	NC_015621	ACA	4	6152	6163	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33470178
7	NC_015621	CTT	4	12627	12638	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015621	GGA	4	16711	16722	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	33470179
9	NC_015621	GAA	4	16758	16768	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33470179
10	NC_015621	TTA	4	17705	17716	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470179
11	NC_015621	GTT	5	24860	24874	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	33470179
12	NC_015621	TGT	4	28458	28469	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33470179
13	NC_015621	TAA	4	32131	32142	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015621	GAG	4	33928	33938	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	33470179
15	NC_015621	TTC	4	34658	34669	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33470179
16	NC_015621	CTT	4	35741	35752	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015621	ATG	4	38211	38221	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33470180
18	NC_015621	GCA	4	40109	40120	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470180
19	NC_015621	AGA	4	44627	44638	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015621	TTA	4	45265	45276	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015621	TTC	4	51305	51315	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_015621	TAG	4	53769	53780	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470180
23	NC_015621	TAA	5	58880	58895	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_015621	ATA	5	60271	60284	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_015621	ATA	4	66523	66534	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015621	TCT	4	73440	73451	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470178
27	NC_015621	CTG	4	78887	78899	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	33470178
28	NC_015621	GAT	4	86752	86762	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33470178
29	NC_015621	GAA	4	99117	99128	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470182
30	NC_015621	GAA	5	108253	108267	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	33470182
31	NC_015621	GAA	5	108954	108968	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	33470182
32	NC_015621	CTT	4	109307	109317	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33470182
33	NC_015621	TCT	4	109687	109697	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33470182
34	NC_015621	ATT	4	113451	113462	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470182
35	NC_015621	AGA	5	116898	116912	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	33470182
36	NC_015621	ACT	4	121454	121464	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33470182
37	NC_015621	TAT	4	122595	122606	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470182
38	NC_015621	CTT	4	124570	124581	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470182
39	NC_015621	TTC	4	136372	136383	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470182
40	NC_015621	ATA	4	150670	150680	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ageratina adenophora chloroplast