ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phytophthora andina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015619	TAT	4	110	120	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015619	ATT	4	2944	2955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015619	ATT	5	2973	2987	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015619	ATT	5	4040	4054	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33470174
5	NC_015619	TAA	4	4066	4077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470174
6	NC_015619	TAT	4	8446	8456	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470174
7	NC_015619	TAT	4	8943	8954	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470174
8	NC_015619	ATT	4	11579	11590	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470174
9	NC_015619	ATA	4	12402	12412	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015619	CTA	4	13717	13727	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33470174
11	NC_015619	ACA	7	13815	13835	21	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33470174
12	NC_015619	TAA	4	14614	14626	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33470175
13	NC_015619	ATA	4	15629	15639	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470175
14	NC_015619	TAT	4	17602	17612	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470175
15	NC_015619	ATA	4	17676	17686	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470175
16	NC_015619	TAT	5	18680	18694	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33470175
17	NC_015619	ATT	4	19097	19108	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015619	ATT	5	20614	20627	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470175
19	NC_015619	ACA	5	20652	20665	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	33470175
20	NC_015619	TAT	4	21371	21382	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470175
21	NC_015619	TTG	4	21466	21477	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33470175
22	NC_015619	TGG	4	21507	21517	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	33470175
23	NC_015619	TTA	4	22794	22804	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015619	ATT	4	24912	24924	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470176
25	NC_015619	TTA	4	24925	24936	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470176
26	NC_015619	ATT	4	25152	25164	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470176
27	NC_015619	TAT	4	25587	25597	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470176
28	NC_015619	TAA	4	25988	25999	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470176
29	NC_015619	CTG	4	26074	26085	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470176
30	NC_015619	ATA	5	26167	26181	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33470176
31	NC_015619	TCT	4	27160	27170	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33470176
32	NC_015619	TAT	4	27851	27862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470176
33	NC_015619	TTA	4	28516	28527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470176
34	NC_015619	ATA	4	29437	29449	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_015619	TAA	4	32779	32790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470177
36	NC_015619	TAA	5	32878	32892	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33470177
37	NC_015619	TAA	5	34021	34034	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33470177
38	NC_015619	TAA	4	34188	34198	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470177
39	NC_015619	TAT	4	36297	36308	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470177
40	NC_015619	TAG	4	36360	36370	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33470177
41	NC_015619	TAA	4	36528	36539	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470177
42	NC_015619	TAA	4	36864	36874	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470177
43	NC_015619	TAA	4	37096	37106	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470177
44	NC_015619	ATA	4	37367	37377	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470177
45	NC_015619	TAA	4	37500	37510	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470177

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phytophthora andina mitochondrion