ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phytophthora andina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015619	TAT	4	110	120	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015619	TTAA	3	2819	2830	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015619	ATT	4	2944	2955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015619	ATT	5	2973	2987	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015619	AATTCA	3	3166	3184	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	33470174
6	NC_015619	A	12	3310	3321	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470174
7	NC_015619	CATA	3	3363	3373	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33470174
8	NC_015619	AATT	4	3697	3713	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470174
9	NC_015619	ATT	5	4040	4054	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33470174
10	NC_015619	TAA	4	4066	4077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470174
11	NC_015619	AAATAT	3	4443	4461	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_015619	TA	6	4831	4841	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015619	TAAAA	3	6237	6250	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_015619	TTTA	3	6550	6561	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015619	AAATT	3	6845	6858	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_015619	AATTTA	3	6907	6924	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_015619	TTAA	3	6932	6943	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015619	TTAA	3	7170	7181	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470174
19	NC_015619	A	15	7813	7827	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470174
20	NC_015619	TAAA	3	8359	8369	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470174
21	NC_015619	AT	6	8405	8415	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470174
22	NC_015619	TAT	4	8446	8456	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470174
23	NC_015619	TTAAA	3	8562	8576	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_015619	TAT	4	8943	8954	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470174
25	NC_015619	TTAG	3	9576	9587	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	33470174
26	NC_015619	TTAT	3	9860	9870	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470174
27	NC_015619	A	12	10537	10548	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015619	TTTA	3	10549	10559	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015619	AATT	3	10867	10878	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470174
30	NC_015619	ATAA	5	11148	11167	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	33470174
31	NC_015619	AATT	3	11182	11193	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015619	T	13	11485	11497	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33470174
33	NC_015619	ATT	4	11579	11590	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470174
34	NC_015619	TTTTTA	3	11943	11961	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	33470174
35	NC_015619	GTTA	3	12205	12215	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	33470174
36	NC_015619	T	15	12301	12315	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470174
37	NC_015619	ATA	4	12402	12412	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_015619	ATTAA	3	12437	12450	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_015619	TTTA	3	12502	12512	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470174
40	NC_015619	CTA	4	13717	13727	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33470174
41	NC_015619	ACA	7	13815	13835	21	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33470174
42	NC_015619	ATAA	4	14558	14573	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	33470175
43	NC_015619	TAA	4	14614	14626	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33470175
44	NC_015619	ATA	4	15629	15639	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470175
45	NC_015619	TAAA	3	15700	15711	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015619	AT	9	16132	16149	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470175
47	NC_015619	TTGAAT	3	16498	16516	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	33470175
48	NC_015619	AT	6	16882	16893	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470175
49	NC_015619	TA	7	17458	17471	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_015619	TAT	4	17602	17612	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470175
51	NC_015619	ATA	4	17676	17686	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470175
52	NC_015619	TAAT	3	18665	18676	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470175
53	NC_015619	TAT	5	18680	18694	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33470175
54	NC_015619	AAAAT	3	18894	18907	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33470175
55	NC_015619	TTAA	3	18921	18931	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470175
56	NC_015619	ATT	4	19097	19108	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_015619	A	16	19814	19829	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470175
58	NC_015619	AAAT	3	20148	20159	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470175
59	NC_015619	TTTAA	3	20224	20237	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33470175
60	NC_015619	A	17	20339	20355	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470175
61	NC_015619	ATT	5	20614	20627	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470175
62	NC_015619	ACA	5	20652	20665	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	33470175
63	NC_015619	T	15	21245	21259	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470175
64	NC_015619	TAT	4	21371	21382	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470175
65	NC_015619	TTG	4	21466	21477	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33470175
66	NC_015619	TGG	4	21507	21517	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	33470175
67	NC_015619	T	16	21796	21811	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470175
68	NC_015619	TTA	4	22794	22804	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_015619	TAAA	3	22837	22848	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015619	TATT	3	22926	22937	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015619	TA	6	23120	23130	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470176
72	NC_015619	ATATT	3	23155	23168	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33470176
73	NC_015619	TCAA	3	24493	24503	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33470176
74	NC_015619	ATT	4	24912	24924	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470176
75	NC_015619	TTA	4	24925	24936	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470176
76	NC_015619	ATT	4	25152	25164	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470176
77	NC_015619	T	12	25566	25577	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470176
78	NC_015619	TAT	4	25587	25597	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470176
79	NC_015619	A	13	25637	25649	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470176
80	NC_015619	TAAA	3	25729	25740	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	33470176
81	NC_015619	AATTT	3	25840	25854	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_015619	TAA	4	25988	25999	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470176
83	NC_015619	CTG	4	26074	26085	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470176
84	NC_015619	AAAAT	3	26141	26154	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33470176
85	NC_015619	ATA	5	26167	26181	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33470176
86	NC_015619	AAAT	3	26483	26494	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470176
87	NC_015619	TTCAGC	3	26641	26658	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	33470176
88	NC_015619	CCAA	3	26896	26906	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	33470176
89	NC_015619	TCT	4	27160	27170	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33470176
90	NC_015619	AATC	3	27360	27371	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	33470176
91	NC_015619	TA	6	27530	27540	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470176
92	NC_015619	TAT	4	27851	27862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470176
93	NC_015619	TTA	4	28516	28527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470176
94	NC_015619	ATA	4	29437	29449	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_015619	TATT	3	30068	30079	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33470176
96	NC_015619	ATTT	3	30147	30158	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33470176
97	NC_015619	AT	7	30247	30260	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470176
98	NC_015619	T	14	30681	30694	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470176
99	NC_015619	T	12	31019	31030	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470176
100	NC_015619	TTTA	3	31175	31186	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33470176
101	NC_015619	TTAA	3	31334	31346	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470176
102	NC_015619	A	15	32321	32335	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470176
103	NC_015619	TTAA	3	32391	32402	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470176
104	NC_015619	A	16	32573	32588	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470176
105	NC_015619	TAA	4	32779	32790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470177
106	NC_015619	TA	7	32793	32806	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470177
107	NC_015619	AT	6	32865	32875	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470177
108	NC_015619	TAA	5	32878	32892	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33470177
109	NC_015619	A	13	32969	32981	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33470177
110	NC_015619	TAAATT	3	33348	33366	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470177
111	NC_015619	AAAT	3	33972	33982	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470177
112	NC_015619	TAA	5	34021	34034	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33470177
113	NC_015619	TAA	4	34188	34198	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470177
114	NC_015619	AATA	3	34527	34537	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470177
115	NC_015619	AAAATA	3	34545	34562	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	33470177
116	NC_015619	T	12	34664	34675	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470177
117	NC_015619	A	14	34738	34751	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33470177
118	NC_015619	TTTA	3	34969	34979	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470177
119	NC_015619	TA	6	35500	35511	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470177
120	NC_015619	A	12	35782	35793	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	33470177
121	NC_015619	TAT	4	36297	36308	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470177
122	NC_015619	TAG	4	36360	36370	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33470177
123	NC_015619	AAAT	3	36496	36507	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470177
124	NC_015619	A	18	36513	36530	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	33470177
125	NC_015619	TAA	4	36528	36539	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470177
126	NC_015619	ATTT	3	36548	36558	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470177
127	NC_015619	AAAT	3	36597	36608	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470177
128	NC_015619	TAAA	3	36690	36701	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470177
129	NC_015619	TAA	4	36864	36874	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470177
130	NC_015619	ACAA	3	36997	37009	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	33470177
131	NC_015619	TAA	4	37096	37106	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470177
132	NC_015619	GAAA	3	37249	37259	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33470177
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140	NC_015619	A	13	37862	37874	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33470177

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phytophthora andina mitochondrion