ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phytophthora phaseoli mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015616	TAT	4	110	120	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015616	TTAA	3	2819	2830	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015616	ATT	4	2944	2955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015616	ATT	5	2973	2987	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015616	A	12	3310	3321	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470169
6	NC_015616	CATA	3	3363	3373	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33470169
7	NC_015616	AATT	4	3697	3713	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470170
8	NC_015616	ATT	5	4040	4054	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33470170
9	NC_015616	TAA	4	4066	4077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470170
10	NC_015616	ATTT	3	4493	4503	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015616	TA	6	4828	4838	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015616	TAT	4	4980	4990	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015616	ATAAAA	3	5020	5037	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_015616	ATAA	4	5047	5061	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_015616	TTA	4	5147	5157	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015616	TTTA	3	6566	6577	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015616	AAATT	3	6871	6884	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_015616	AATTTA	3	6933	6950	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_015616	TTAA	3	6958	6969	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015616	TTTATT	3	7033	7050	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	33470170
21	NC_015616	TTAA	3	7212	7223	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470170
22	NC_015616	TTTA	3	7522	7534	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_015616	A	15	7847	7861	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470170
24	NC_015616	ATT	4	7956	7966	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470170
25	NC_015616	TAAA	3	8393	8403	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470170
26	NC_015616	AT	6	8439	8449	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470170
27	NC_015616	TAT	4	8480	8490	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470170
28	NC_015616	TTAAA	3	8595	8609	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_015616	TAT	4	8976	8987	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470170
30	NC_015616	TTAG	3	9609	9620	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	33470170
31	NC_015616	TTAT	3	9893	9903	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470170
32	NC_015616	A	12	10569	10580	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_015616	TTTA	3	10581	10591	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_015616	ATAA	5	11180	11199	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	33470170
35	NC_015616	T	13	11517	11529	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33470170
36	NC_015616	ATT	4	11611	11622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470170
37	NC_015616	TTTTTA	3	11975	11993	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	33470170
38	NC_015616	GTTA	3	12237	12247	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	33470170
39	NC_015616	T	15	12333	12347	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470170
40	NC_015616	TAT	4	12430	12440	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_015616	CTA	4	13753	13763	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33470170
42	NC_015616	ACA	7	13851	13871	21	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33470170
43	NC_015616	ATAA	4	14594	14609	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	33470170
44	NC_015616	TAA	4	14650	14662	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33470170
45	NC_015616	ATA	4	15665	15675	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470170
46	NC_015616	AT	9	16168	16185	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470171
47	NC_015616	TTGAAT	3	16534	16552	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	33470171
48	NC_015616	AT	8	16918	16932	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33470171
49	NC_015616	TA	7	17494	17507	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_015616	TAT	4	17638	17648	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470171
51	NC_015616	ATA	4	17712	17722	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470171
52	NC_015616	TAAT	3	18701	18712	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470171
53	NC_015616	TAT	5	18716	18730	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33470171
54	NC_015616	AAAAT	3	18930	18943	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33470171
55	NC_015616	ATT	4	19133	19144	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_015616	AAATAA	3	19269	19287	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	33470171
57	NC_015616	A	16	19850	19865	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470171
58	NC_015616	AAAT	3	20184	20195	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470171
59	NC_015616	TTTAA	3	20260	20273	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33470171
60	NC_015616	A	17	20375	20391	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	33470171
61	NC_015616	ATT	5	20650	20663	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470171
62	NC_015616	ACA	5	20688	20701	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	33470171
63	NC_015616	T	15	21281	21295	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470171
64	NC_015616	TAT	4	21407	21418	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470171
65	NC_015616	ACA	4	21453	21463	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33470171
66	NC_015616	TTG	4	21502	21513	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33470171
67	NC_015616	TGG	4	21543	21553	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	33470171
68	NC_015616	T	16	21832	21847	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470171
69	NC_015616	TA	6	22274	22284	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470171
70	NC_015616	TTA	4	22830	22840	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_015616	TA	6	23168	23178	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470171
72	NC_015616	ATATT	3	23203	23216	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33470171
73	NC_015616	TCAA	3	24541	24551	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33470171
74	NC_015616	ATT	4	24960	24972	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470171
75	NC_015616	TTA	4	24973	24984	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470171
76	NC_015616	TTAT	4	24999	25014	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	33470171
77	NC_015616	ATT	4	25200	25212	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470172
78	NC_015616	T	12	25614	25625	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470172
79	NC_015616	TAT	4	25635	25645	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470172
80	NC_015616	A	13	25685	25697	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470172
81	NC_015616	AATTT	3	25895	25909	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_015616	ATATT	3	26000	26014	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_015616	CTG	4	26114	26125	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470172
84	NC_015616	AAAAT	3	26181	26194	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33470172
85	NC_015616	ATA	4	26207	26218	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470172
86	NC_015616	AAAT	3	26523	26534	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470172
87	NC_015616	TTCAGC	3	26681	26698	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	33470172
88	NC_015616	CCAA	3	26936	26946	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	33470172
89	NC_015616	TCT	4	27200	27210	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33470172
90	NC_015616	TA	6	27570	27580	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470172
91	NC_015616	TAT	4	27891	27902	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470172
92	NC_015616	TTA	4	28556	28567	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470172
93	NC_015616	ATA	4	29477	29489	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_015616	AATT	3	30055	30065	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470172
95	NC_015616	ATTTT	3	30066	30081	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	33470172
96	NC_015616	TATT	3	30108	30119	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33470172
97	NC_015616	ATTT	3	30187	30198	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33470172
98	NC_015616	AT	7	30287	30300	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470172
99	NC_015616	T	14	30720	30733	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470172
100	NC_015616	T	13	31057	31069	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470172
101	NC_015616	TTTA	3	31214	31225	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33470172
102	NC_015616	TTAA	3	31373	31385	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470172
103	NC_015616	A	15	32360	32374	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470172
104	NC_015616	TTAA	3	32430	32441	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470172
105	NC_015616	A	16	32612	32627	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470172
106	NC_015616	TAA	4	32818	32829	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470172
107	NC_015616	TA	7	32832	32845	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470172
108	NC_015616	AT	6	32904	32914	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470172
109	NC_015616	AAT	4	32918	32929	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470172
110	NC_015616	A	16	33008	33023	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470172
111	NC_015616	TAAATT	3	33387	33405	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470172
112	NC_015616	AAAT	3	34011	34021	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470173
113	NC_015616	TAA	5	34060	34073	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33470173
114	NC_015616	TAA	4	34227	34237	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470173
115	NC_015616	AATA	3	34566	34576	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470173
116	NC_015616	T	12	34703	34714	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470173
117	NC_015616	A	14	34777	34790	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33470173
118	NC_015616	AATT	3	34905	34915	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470173
119	NC_015616	AAT	4	34980	34990	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470173
120	NC_015616	TA	6	35536	35546	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470173
121	NC_015616	A	12	35819	35830	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	33470173
122	NC_015616	AATTAA	3	36215	36232	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	33470173
123	NC_015616	TAG	4	36398	36408	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33470173
124	NC_015616	AAAT	3	36534	36545	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470173
125	NC_015616	A	16	36553	36568	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470173
126	NC_015616	TAA	4	36566	36577	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470173
127	NC_015616	TTTA	3	36587	36597	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470173
128	NC_015616	AAAT	3	36635	36646	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470173
129	NC_015616	TAAA	3	36728	36739	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470173
130	NC_015616	TAA	4	36902	36912	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470173
131	NC_015616	ACAA	3	37035	37047	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	33470173
132	NC_015616	TAA	4	37134	37144	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470173
133	NC_015616	GAAA	3	37287	37297	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33470173
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142	NC_015616	A	15	37900	37914	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470173

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phytophthora phaseoli mitochondrion