ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chilo suppressalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015612	TAT	4	129	139	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015612	TTTAA	3	223	237	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_015612	TTTA	3	238	248	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_015612	TTTTA	4	249	267	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	33436212
5	NC_015612	TTTTTA	4	286	309	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	33436212
6	NC_015612	TACT	3	438	449	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	33436212
7	NC_015612	TAT	5	665	678	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33436212
8	NC_015612	TTA	4	680	690	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33436212
9	NC_015612	TTA	4	937	948	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33436212
10	NC_015612	ATT	4	1032	1044	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33436212
11	NC_015612	T	14	1253	1266	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33436212
12	NC_015612	TAA	7	1402	1423	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015612	ATT	4	2073	2084	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33436213
14	NC_015612	TGG	4	2163	2174	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	33436213
15	NC_015612	ATT	4	2938	2948	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33436213
16	NC_015612	AAAT	3	3484	3494	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33436213
17	NC_015612	AATT	3	3770	3780	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33436213
18	NC_015612	TA	6	3908	3918	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015612	TAT	5	4907	4921	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33436213
20	NC_015612	T	13	5038	5050	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33436213
21	NC_015612	ATTATA	3	5217	5235	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	33436213
22	NC_015612	TTTAAT	3	5598	5614	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_015612	ATTT	3	5875	5886	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33436213
24	NC_015612	TAT	4	5906	5917	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33436213
25	NC_015612	ATTA	7	5971	5996	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33436213
26	NC_015612	TTA	12	5984	6019	36	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_015612	TA	24	6032	6077	46	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015612	TTTA	3	6398	6408	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015612	TAAA	3	6527	6538	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	33436213
30	NC_015612	ATT	4	6546	6558	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33436213
31	NC_015612	TAAA	3	6672	6682	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33436213
32	NC_015612	TTA	4	6920	6931	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33436213
33	NC_015612	ATA	4	7062	7072	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33436213
34	NC_015612	AAAT	3	7076	7087	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33436213
35	NC_015612	ATA	5	7460	7474	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33436213
36	NC_015612	ATA	4	7645	7656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33436213
37	NC_015612	ATT	5	7663	7677	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33436213
38	NC_015612	TAA	4	7898	7910	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33436213
39	NC_015612	A	14	8141	8154	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33436213
40	NC_015612	TAAAA	3	8165	8179	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	33436213
41	NC_015612	TAA	4	8341	8355	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33436213
42	NC_015612	TAA	6	8865	8885	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33436213
43	NC_015612	AAAT	3	9187	9197	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33436213
44	NC_015612	TAA	4	9240	9252	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33436213
45	NC_015612	AAAAT	3	9276	9289	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33436213
46	NC_015612	AT	6	9466	9477	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33436213
47	NC_015612	ATT	4	9596	9607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33436213
48	NC_015612	AT	6	9741	9753	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33436213
49	NC_015612	TAAA	3	9769	9779	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33436213
50	NC_015612	ATT	5	10028	10042	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_015612	TTA	4	10079	10091	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33436213
52	NC_015612	ATT	5	10240	10254	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33436213
53	NC_015612	AAAT	3	10410	10420	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33436213
54	NC_015612	TAA	7	10497	10517	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	33436213
55	NC_015612	TTTA	3	10518	10529	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33436213
56	NC_015612	ATTT	3	11166	11176	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33436214
57	NC_015612	ATT	5	11305	11318	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33436214
58	NC_015612	AATTTT	3	11499	11516	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	33436214
59	NC_015612	ATT	4	11599	11609	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33436214
60	NC_015612	ATA	5	12212	12225	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33436214
61	NC_015612	TTA	4	12270	12281	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33436214
62	NC_015612	TAAAA	3	12427	12440	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33436214
63	NC_015612	TAAAT	4	12445	12464	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	33436214
64	NC_015612	ATA	4	12463	12474	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33436214
65	NC_015612	TA	7	12770	12782	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_015612	TTAA	3	13939	13949	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_015612	AATT	3	14096	14107	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_015612	AATT	3	14167	14178	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_015612	ATT	4	14206	14217	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_015612	TAAA	3	14368	14380	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_015612	TAT	4	14805	14815	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_015612	TAA	4	14825	14837	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_015612	AATTT	3	14838	14852	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015612	ATT	4	14952	14964	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_015612	TAAA	3	14965	14976	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015612	TTAA	3	15011	15022	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_015612	T	23	15075	15097	23	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015612	T	12	15130	15141	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015612	TAAAA	3	15172	15186	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_015612	TTTAA	3	15230	15243	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_015612	TAAA	3	15269	15281	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_015612	TA	8	15287	15302	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_015612	TTAA	3	15305	15316	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_015612	AT	8	15335	15349	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_015612	TA	7	15356	15368	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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