Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nelumbo nucifera chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015610CAG49869971233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %33436202
2NC_015610ATA4168416961366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_015610GAA4316731781266.67 %0 %33.33 %0 %8 %33436203
4NC_015610ATA4530553151166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_015610TTA410486104961133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_015610TTA517857178711533.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
7NC_015610TGT41895518965110 %66.67 %33.33 %0 %9 %33436203
8NC_015610GTT42588725898120 %66.67 %33.33 %0 %8 %33436204
9NC_015610CAG430457304681233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
10NC_015610TAT534737347501433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_015610GTA435558355681133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
12NC_015610ATT436489365001233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
13NC_015610GGA438630386411233.33 %0 %66.67 %0 %8 %33436204
14NC_015610TAA440472404821166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_015610ATG442876428861133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %33436204
16NC_015610CTA444439444501233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %33436204
17NC_015610GCA444774447851233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %33436204
18NC_015610TTG44822148231110 %66.67 %33.33 %0 %9 %33436205
19NC_015610GTA448878488881133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
20NC_015610TAA449532495421166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_015610AAT451359513691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_015610TCT45357853589120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
23NC_015610TGT46152661536110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
24NC_015610TTG46319963209110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
25NC_015610TTC46339063401120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
26NC_015610TAG464278642891233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436205
27NC_015610AGA464345643551166.67 %0 %33.33 %0 %9 %33436205
28NC_015610TCA567385673981433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
29NC_015610CTT47045170462120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
30NC_015610CTA471025710361233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
31NC_015610AGT472137721491333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
32NC_015610AAT572172721851466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_015610ACA474430744401166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
34NC_015610TAT574591746041433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
35NC_015610ATA475327753381266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_015610GAA475952759631266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
37NC_015610TAT478293783051333.33 %66.67 %0 %0 %7 %33436207
38NC_015610GGA487617876291333.33 %0 %66.67 %0 %7 %33436207
39NC_015610CTT49197191982120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33436207
40NC_015610GAT493835938451133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %33436207
41NC_015610GAT496863968741233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436207
42NC_015610TGA498590986011233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436207
43NC_015610AGA81179311179532366.67 %0 %33.33 %0 %4 %33436207
44NC_015610TCT4118151118161110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33436207
45NC_015610AAG41197721197831266.67 %0 %33.33 %0 %8 %33436207
46NC_015610ACA41221961222071266.67 %0 %0 %33.33 %8 %33436207
47NC_015610TCT4122209122220120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33436207
48NC_015610TAA41322451322561266.67 %33.33 %0 %0 %8 %33436207
49NC_015610CTT4133498133509120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33436207
50NC_015610AGT41336891337001233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436207
51NC_015610AAT41340151340251166.67 %33.33 %0 %0 %9 %33436207
52NC_015610AAT41348371348481266.67 %33.33 %0 %0 %8 %33436207
53NC_015610CTT4134925134935110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33436207
54NC_015610ATT41352791352901233.33 %66.67 %0 %0 %8 %33436207
55NC_015610TCT4136047136057110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33436207
56NC_015610TCA41362251362351133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %33436207
57NC_015610TAG41362491362601233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436207
58NC_015610CCT4153608153619120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
59NC_015610ATC41582811582921233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %33436211
60NC_015610ATC41613101613201133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
61NC_015610GAA51631721631861566.67 %0 %33.33 %0 %6 %33436211