ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Olea woodiana subsp. woodiana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015608	TCAA	4	323	337	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
2	NC_015608	CTTT	3	358	369	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015608	AGT	4	421	432	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015608	CAG	4	1136	1147	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470159
5	NC_015608	AAGT	3	1242	1252	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	33470159
6	NC_015608	CCAAT	3	1732	1746	15	40 %	20 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015608	AAG	4	3029	3040	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470160
8	NC_015608	GAA	4	3059	3070	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470160
9	NC_015608	T	12	3305	3316	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470160
10	NC_015608	CATT	3	4146	4157	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015608	AG	6	4638	4649	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015608	AAAT	3	4771	4782	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015608	T	14	4881	4894	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015608	TGAAA	3	5110	5123	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_015608	GTT	4	5161	5171	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015608	AAAT	3	5236	5247	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015608	TA	6	6346	6357	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470160
18	NC_015608	TA	6	6553	6563	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015608	AT	7	6612	6625	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_015608	AAATAG	3	6620	6637	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_015608	T	14	6819	6832	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015608	AAAT	3	6854	6865	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015608	AT	6	7387	7398	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015608	TAAA	3	9317	9332	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_015608	AAAT	3	9574	9585	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015608	A	14	9596	9609	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_015608	GATTT	3	9721	9734	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015608	CAA	4	9789	9800	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_015608	TTTA	3	9966	9977	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015608	T	12	11018	11029	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015608	A	13	12819	12831	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_015608	AAAT	3	13479	13489	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470160
33	NC_015608	TTTCT	3	13511	13524	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	33470160
34	NC_015608	T	15	14175	14189	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_015608	ATTT	3	15416	15426	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_015608	TATT	3	16727	16739	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_015608	TGTT	3	17075	17085	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33470160
38	NC_015608	T	12	17468	17479	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015608	A	15	17481	17495	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_015608	T	16	17785	17800	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470160
41	NC_015608	T	12	19295	19306	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	33470160
42	NC_015608	T	13	19694	19706	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33470160
43	NC_015608	T	12	20232	20243	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470160
44	NC_015608	GAAT	3	23891	23901	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	33470161
45	NC_015608	T	12	24147	24158	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470161
46	NC_015608	CCTA	3	25699	25709	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	33470161
47	NC_015608	ATCAA	3	29099	29113	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
48	NC_015608	CAA	4	29822	29833	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015608	TGAATT	3	31301	31319	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
50	NC_015608	A	13	31821	31833	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_015608	A	16	32732	32747	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_015608	GTAT	3	33038	33050	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_015608	ATGA	3	33514	33524	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_015608	T	14	33708	33721	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_015608	TTCT	3	34057	34068	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_015608	GAAA	3	36123	36134	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	33470161
57	NC_015608	TTG	4	36528	36538	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	33470161
58	NC_015608	TTC	4	36973	36984	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470161
59	NC_015608	CTTTTT	4	37185	37208	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015608	A	12	37328	37339	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015608	GA	6	37341	37352	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_015608	TA	6	37545	37555	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_015608	TC	6	37947	37957	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	33470161
64	NC_015608	TAA	4	38145	38155	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_015608	TA	12	38206	38228	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_015608	GAAT	3	39829	39839	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	33470161
67	NC_015608	GAT	4	40524	40535	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470161
68	NC_015608	GCA	4	42423	42434	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470161
69	NC_015608	ATTT	3	43745	43756	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_015608	AATTTA	3	44069	44086	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_015608	TAA	4	44116	44126	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_015608	A	15	44135	44149	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015608	ATTT	3	44275	44286	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_015608	A	14	46182	46195	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33470162
75	NC_015608	A	12	46435	46446	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015608	GTA	4	46510	46520	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_015608	GTT	4	46722	46732	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_015608	CTAAA	4	48194	48214	21	60 %	20 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
79	NC_015608	TAT	4	48292	48304	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_015608	CATA	3	50252	50262	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_015608	CTTT	3	50501	50513	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
82	NC_015608	TA	6	52897	52907	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_015608	AGA	4	53097	53108	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_015608	ATTTT	3	53616	53631	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_015608	TTA	4	53692	53703	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_015608	TAAA	3	53961	53971	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_015608	TTTTA	3	54621	54634	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_015608	ATA	4	56638	56648	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470162
89	NC_015608	TATT	3	57009	57019	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_015608	TGCA	3	58309	58321	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	33470162
91	NC_015608	GTTA	4	59207	59221	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_015608	TTA	4	59405	59417	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_015608	TAGA	3	61559	61570	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_015608	AATT	3	61597	61609	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_015608	TAA	4	61609	61620	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_015608	TGAA	3	62836	62846	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_015608	GAAA	3	63074	63085	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015608	AT	6	64717	64727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470163
99	NC_015608	ATA	4	66094	66104	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_015608	AAT	4	66106	66116	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_015608	AT	6	66270	66280	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_015608	TTTC	3	67564	67575	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_015608	A	14	67963	67976	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_015608	T	12	68767	68778	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_015608	AT	6	69183	69193	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_015608	ATA	4	69468	69479	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_015608	TA	7	69493	69505	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_015608	GAAA	3	70512	70523	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	33470164
109	NC_015608	TAAAC	3	70671	70685	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015608	TTG	4	71062	71072	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_015608	TGAA	3	71636	71647	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_015608	TTTC	3	71670	71682	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
113	NC_015608	T	15	71790	71804	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015608	TTTCA	3	74292	74306	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	33470164
115	NC_015608	ATT	4	74788	74798	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_015608	AATAG	4	75040	75058	19	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
117	NC_015608	GGTT	3	76190	76201	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	33470164
118	NC_015608	TCT	4	76561	76572	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470164
119	NC_015608	CAAA	5	76835	76853	19	75 %	0 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
120	NC_015608	A	15	77856	77870	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470164
121	NC_015608	AT	6	79776	79786	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470164
122	NC_015608	A	14	80543	80556	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_015608	T	17	80792	80808	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	33470165
124	NC_015608	T	25	83196	83220	25	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
125	NC_015608	AGAATT	3	85136	85154	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
126	NC_015608	TTC	4	85240	85251	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470165
127	NC_015608	CAAT	3	85313	85323	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33470165
128	NC_015608	TTTC	3	86352	86362	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	33470165
129	NC_015608	A	13	86416	86428	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_015608	T	17	86720	86736	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_015608	GAT	4	88669	88679	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_015608	ATCG	3	91124	91136	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	33470166
133	NC_015608	GAT	4	91699	91710	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470166
134	NC_015608	TGA	4	93393	93404	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470166
135	NC_015608	AATA	3	94258	94270	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	33470166
136	NC_015608	ACA	4	94302	94313	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33470166
137	NC_015608	TCCGG	3	96873	96887	15	0 %	20 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
138	NC_015608	TTTCG	3	99432	99445	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
139	NC_015608	TTTGTT	3	99824	99842	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	33470166
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141	NC_015608	ATTTTT	3	101231	101249	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
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143	NC_015608	ATCC	3	104830	104841	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
144	NC_015608	TCTA	3	105225	105236	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
145	NC_015608	AAGG	3	105363	105373	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
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147	NC_015608	AGGT	3	108297	108308	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
148	NC_015608	TAAG	3	109417	109427	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_015608	ATTT	3	110479	110489	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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157	NC_015608	AGA	4	117393	117404	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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161	NC_015608	TCTA	3	122499	122510	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	33470167
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176	NC_015608	CTTA	3	133227	133237	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
177	NC_015608	CCTT	3	137281	137291	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
178	NC_015608	GGAT	3	137813	137824	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
179	NC_015608	ACTAAT	4	140870	140891	22	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
180	NC_015608	AAAAAT	3	141405	141423	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
181	NC_015608	GAA	4	141424	141435	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
182	NC_015608	ACCGG	3	145766	145780	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
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191	NC_015608	ACAAAA	3	155916	155933	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Olea woodiana subsp. woodiana chloroplast