ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olea woodiana subsp. woodiana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015608	AGT	4	421	432	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015608	CAG	4	1136	1147	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470159
3	NC_015608	AAG	4	3029	3040	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470160
4	NC_015608	GAA	4	3059	3070	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470160
5	NC_015608	GTT	4	5161	5171	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_015608	CAA	4	9789	9800	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015608	CAA	4	29822	29833	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015608	TTG	4	36528	36538	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	33470161
9	NC_015608	TTC	4	36973	36984	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470161
10	NC_015608	TAA	4	38145	38155	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015608	GAT	4	40524	40535	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470161
12	NC_015608	GCA	4	42423	42434	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470161
13	NC_015608	TAA	4	44116	44126	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_015608	GTA	4	46510	46520	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015608	GTT	4	46722	46732	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015608	TAT	4	48292	48304	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_015608	AGA	4	53097	53108	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015608	TTA	4	53692	53703	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_015608	ATA	4	56638	56648	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470162
20	NC_015608	TTA	4	59405	59417	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015608	TAA	4	61609	61620	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015608	ATA	4	66094	66104	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015608	AAT	4	66106	66116	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015608	ATA	4	69468	69479	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015608	TTG	4	71062	71072	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015608	ATT	4	74788	74798	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015608	TCT	4	76561	76572	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470164
28	NC_015608	TTC	4	85240	85251	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470165
29	NC_015608	GAT	4	88669	88679	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015608	GAT	4	91699	91710	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470166
31	NC_015608	TGA	4	93393	93404	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470166
32	NC_015608	ACA	4	94302	94313	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33470166
33	NC_015608	TTC	4	101219	101230	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_015608	AGA	4	112456	112466	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33470166
35	NC_015608	TAA	4	113546	113557	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470166
36	NC_015608	AAG	4	113771	113782	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470166
37	NC_015608	TAT	4	113960	113970	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470166
38	NC_015608	AGA	4	117393	117404	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_015608	CTT	4	129492	129504	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	33470167
40	NC_015608	GAA	4	141424	141435	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015608	TGT	4	148341	148352	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33470168
42	NC_015608	ATC	4	150944	150955	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33470168
43	NC_015608	ATC	4	153975	153985	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olea woodiana subsp. woodiana chloroplast