ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phytophthora mirabilis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015606	TAT	4	108	118	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015606	TTAA	3	2817	2828	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015606	ATT	4	2942	2953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015606	ATT	4	2974	2985	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015606	A	12	3308	3319	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470155
6	NC_015606	CATA	3	3361	3371	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33470155
7	NC_015606	AATT	4	3695	3711	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470155
8	NC_015606	ATT	5	4038	4052	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33470155
9	NC_015606	TAA	4	4064	4075	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470155
10	NC_015606	ATTT	3	4485	4495	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015606	TA	6	4833	4843	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015606	TTA	4	5146	5156	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015606	TTTA	3	6565	6576	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015606	AAATT	3	6870	6883	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_015606	AATTTA	3	6932	6949	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_015606	TTAA	3	6957	6968	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015606	TATTTT	3	7022	7039	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	33470156
18	NC_015606	TTAA	3	7199	7210	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470156
19	NC_015606	A	14	7275	7288	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_015606	TTTA	3	7464	7476	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015606	A	15	7792	7806	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470156
22	NC_015606	TAAA	3	8338	8348	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470156
23	NC_015606	TTAATT	3	8350	8367	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	33470156
24	NC_015606	AT	6	8384	8394	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470156
25	NC_015606	TAT	4	8425	8435	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470156
26	NC_015606	A	12	8553	8564	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_015606	TAT	4	8924	8935	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470156
28	NC_015606	TTAG	3	9557	9568	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	33470156
29	NC_015606	TTAT	3	9841	9851	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470156
30	NC_015606	A	13	10520	10532	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_015606	TTTA	3	10533	10544	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015606	AATT	3	10852	10863	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470156
33	NC_015606	ATAA	5	11133	11152	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	33470156
34	NC_015606	AATT	3	11167	11178	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_015606	T	13	11470	11482	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33470156
36	NC_015606	ATT	4	11564	11575	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470156
37	NC_015606	TTTTTA	3	11928	11946	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	33470156
38	NC_015606	GTTA	3	12190	12200	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	33470156
39	NC_015606	T	15	12286	12300	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470156
40	NC_015606	ATTAA	3	12422	12435	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_015606	CTA	4	13707	13717	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33470156
42	NC_015606	ACA	7	13805	13825	21	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33470156
43	NC_015606	ATAA	4	14548	14563	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	33470156
44	NC_015606	TAA	4	14604	14616	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33470156
45	NC_015606	ATA	4	15619	15629	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470156
46	NC_015606	TAAA	3	15690	15701	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015606	AT	9	16122	16139	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470156
48	NC_015606	TTGAAT	3	16488	16506	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	33470157
49	NC_015606	AT	8	16872	16886	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33470157
50	NC_015606	TA	7	17450	17463	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_015606	TAT	4	17594	17604	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470157
52	NC_015606	ATA	4	17668	17678	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470157
53	NC_015606	TAAT	3	18657	18668	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470157
54	NC_015606	TAT	5	18672	18686	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	33470157
55	NC_015606	AAAAT	3	18886	18899	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33470157
56	NC_015606	TTAA	3	18913	18923	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470157
57	NC_015606	ATT	4	19089	19100	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_015606	A	16	19806	19821	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470157
59	NC_015606	AAAT	3	20140	20151	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470157
60	NC_015606	TTTAA	3	20216	20229	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33470157
61	NC_015606	A	17	20331	20347	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	33470157
62	NC_015606	ATT	5	20606	20619	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470157
63	NC_015606	ACA	5	20644	20657	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	33470157
64	NC_015606	T	15	21237	21251	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470157
65	NC_015606	TAT	4	21363	21374	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470157
66	NC_015606	ACA	4	21409	21419	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33470157
67	NC_015606	TTG	4	21458	21469	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33470157
68	NC_015606	TGG	4	21499	21509	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	33470157
69	NC_015606	T	16	21788	21803	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	33470157
70	NC_015606	TTA	4	22786	22796	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_015606	TA	6	23014	23024	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470157
72	NC_015606	TCAA	3	24387	24397	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33470157
73	NC_015606	ATT	4	24806	24818	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470157
74	NC_015606	TTA	4	24819	24830	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470157
75	NC_015606	ATT	4	25046	25058	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33470157
76	NC_015606	T	12	25460	25471	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470157
77	NC_015606	TAT	4	25481	25491	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470157
78	NC_015606	A	13	25531	25543	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470157
79	NC_015606	AATTT	3	25744	25758	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_015606	CTG	4	25976	25987	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470158
81	NC_015606	AAAAT	3	26043	26056	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33470158
82	NC_015606	ATA	5	26069	26083	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33470158
83	NC_015606	AAAT	3	26385	26396	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470158
84	NC_015606	TTCAGC	3	26543	26560	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	33470158
85	NC_015606	CCAA	3	26798	26808	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	33470158
86	NC_015606	TCT	4	27062	27072	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33470158
87	NC_015606	TA	6	27432	27442	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470158
88	NC_015606	TAT	4	27753	27764	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470158
89	NC_015606	TTA	4	28418	28429	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33470158
90	NC_015606	ATA	4	29341	29353	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_015606	TATT	3	29972	29983	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33470158
92	NC_015606	ATTT	3	30051	30062	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33470158
93	NC_015606	AT	7	30151	30164	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470158
94	NC_015606	T	14	30585	30598	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470158
95	NC_015606	T	12	30923	30934	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470158
96	NC_015606	ATTTT	3	30937	30951	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	33470158
97	NC_015606	TTTA	3	31079	31090	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33470158
98	NC_015606	TTAA	3	31238	31250	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470158
99	NC_015606	A	15	32225	32239	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33470158
100	NC_015606	TTAA	3	32295	32306	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33470158
101	NC_015606	A	16	32477	32492	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470158
102	NC_015606	TAA	4	32683	32694	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470158
103	NC_015606	TA	7	32697	32710	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33470158
104	NC_015606	AT	6	32769	32779	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470158
105	NC_015606	A	13	32873	32885	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33470158
106	NC_015606	TAAATT	3	33252	33270	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470158
107	NC_015606	AAAT	3	33876	33886	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470159
108	NC_015606	TAA	5	33925	33938	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33470159
109	NC_015606	TAA	4	34092	34102	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470159
110	NC_015606	AATA	3	34431	34441	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470159
111	NC_015606	T	12	34568	34579	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33470159
112	NC_015606	A	14	34642	34655	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33470159
113	NC_015606	TTTA	3	34873	34883	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470159
114	NC_015606	TA	6	35401	35411	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33470159
115	NC_015606	A	12	35684	35695	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	33470159
116	NC_015606	AATTAA	3	36080	36097	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	33470159
117	NC_015606	AAAT	3	36399	36410	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470159
118	NC_015606	A	18	36416	36433	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	33470159
119	NC_015606	TAA	4	36431	36442	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470159
120	NC_015606	ATTT	3	36451	36461	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470159
121	NC_015606	AAAT	3	36500	36511	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470159
122	NC_015606	TAAA	3	36593	36604	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470159
123	NC_015606	TAA	4	36767	36777	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470159
124	NC_015606	ACAA	3	36900	36912	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	33470159
125	NC_015606	TAA	4	36999	37009	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470159
126	NC_015606	GAAA	3	37152	37162	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	33470159
127	NC_015606	ATA	4	37270	37280	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470159
128	NC_015606	ATTT	3	37295	37305	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33470159
129	NC_015606	TAA	4	37403	37413	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470159
130	NC_015606	AAAAT	3	37482	37495	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33470159
131	NC_015606	AAAT	3	37504	37514	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33470159
132	NC_015606	AAAT	3	37666	37677	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33470159
133	NC_015606	ATTTAA	3	37734	37751	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33470159
134	NC_015606	A	15	37765	37779	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	33470159

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phytophthora mirabilis mitochondrion