ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olea europaea subsp. cuspidata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015604	AGT	4	422	433	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015604	AAG	4	3032	3043	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470026
3	NC_015604	GAA	4	3062	3073	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470026
4	NC_015604	GTT	4	5162	5172	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015604	CAA	4	9779	9790	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015604	CAA	4	29803	29814	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015604	TTG	4	36484	36494	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	33470027
8	NC_015604	TTC	4	36929	36940	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470027
9	NC_015604	TAA	4	38092	38102	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015604	GAT	4	40465	40476	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470028
11	NC_015604	GCA	4	42364	42375	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33470028
12	NC_015604	TAA	4	44057	44067	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015604	GTA	4	46442	46452	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_015604	GTT	4	46653	46663	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015604	TAT	4	48222	48234	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_015604	TTA	4	52816	52827	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015604	AGA	4	53036	53047	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015604	TTA	4	53623	53634	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_015604	ATA	4	56567	56577	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33470028
20	NC_015604	TTA	4	59332	59344	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015604	TAA	4	61531	61543	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_015604	AAT	4	66018	66028	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015604	ATA	4	69383	69394	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015604	TTG	4	70972	70982	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_015604	ATT	4	74696	74706	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015604	TCT	4	76469	76480	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470030
27	NC_015604	TTC	4	85157	85168	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	33470031
28	NC_015604	GAT	4	87190	87200	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33470032
29	NC_015604	GAT	4	88572	88582	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015604	GAT	4	91602	91613	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470032
31	NC_015604	TGA	4	93296	93307	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33470032
32	NC_015604	TTC	4	101135	101146	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_015604	AGA	4	112372	112382	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33470032
34	NC_015604	TAA	4	113462	113473	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33470032
35	NC_015604	AAG	4	113687	113698	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470032
36	NC_015604	TAT	4	113876	113886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33470032
37	NC_015604	GAA	4	114448	114459	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33470032
38	NC_015604	AGA	4	117305	117316	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_015604	CTT	4	129397	129409	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	33470034
40	NC_015604	GAA	4	141329	141340	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015604	ATC	4	150862	150873	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33470034
42	NC_015604	ATC	4	153893	153903	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_015604	ATC	4	155275	155285	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33470034

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olea europaea subsp. cuspidata chloroplast