Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Jacobaea vulgaris chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015543TCT4676686110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33470230
2NC_015543TAT4189619071233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_015543TTC420822093120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33470230
4NC_015543GAA4288728981266.67 %0 %33.33 %0 %8 %33470230
5NC_015543ATA4442144331366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_015543ATA4466946801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_015543AGA4475347641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
8NC_015543CTT468356845110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
9NC_015543TAT4798079901133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_015543AAG412048120601366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
11NC_015543GAA417133171441266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
12NC_015543GAA417179171891166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
13NC_015543TAA523714237281566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
14NC_015543GTT52453324547150 %66.67 %33.33 %0 %6 %33470231
15NC_015543TGT42801828029120 %66.67 %33.33 %0 %8 %33470231
16NC_015543TAA531778317921566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_015543TTA432262322731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %33470231
18NC_015543GAG433576335861133.33 %0 %66.67 %0 %9 %33470232
19NC_015543TTC43430634317120 %66.67 %0 %33.33 %0 %33470232
20NC_015543ATG437890379001133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %33470232
21NC_015543AGA544282442951466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
22NC_015543CTT44554145552120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
23NC_015543ATT545561455761633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
24NC_015543TAT447617476281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_015543TAT450038500491233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_015543TTC45113651146110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
27NC_015543TTG45432654336110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
28NC_015543TTC46175161762120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33470233
29NC_015543ATT462377623891333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_015543TTA462497625081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_015543TTC46432964340120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
32NC_015543ATA465514655251266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_015543TAA466888668991266.67 %33.33 %0 %0 %8 %33470234
34NC_015543ATA469311693211166.67 %33.33 %0 %0 %9 %33470234
35NC_015543TCT47249472505120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33470234
36NC_015543AAT474015740271366.67 %33.33 %0 %0 %7 %33470234
37NC_015543CTG47749677508130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %33470234
38NC_015543ATA477565775761266.67 %33.33 %0 %0 %8 %33470234
39NC_015543GAA478306783161166.67 %0 %33.33 %0 %9 %33470234
40NC_015543TAT581211812241433.33 %66.67 %0 %0 %7 %33470234
41NC_015543TAT582586825991433.33 %66.67 %0 %0 %7 %33470234
42NC_015543GAT484849848591133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %33470234
43NC_015543TTC49700997020120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33470238
44NC_015543GAA51072171072311566.67 %0 %33.33 %0 %6 %33470238
45NC_015543GAA71078321078522166.67 %0 %33.33 %0 %4 %33470238
46NC_015543AGA41099161099261166.67 %0 %33.33 %0 %9 %33470238
47NC_015543ATT41122571122681233.33 %66.67 %0 %0 %8 %33470238
48NC_015543CTT4114489114499110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33470238
49NC_015543TAA41147851147971366.67 %33.33 %0 %0 %7 %33470238
50NC_015543TAT41153331153431133.33 %66.67 %0 %0 %9 %33470238
51NC_015543AGA51157261157401566.67 %0 %33.33 %0 %6 %33470238
52NC_015543CTA41182881182991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %33470238
53NC_015543AGT41203901204001133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %33470238
54NC_015543CCA51222371222501433.33 %0 %0 %66.67 %7 %33470238
55NC_015543TTA41234021234131233.33 %66.67 %0 %0 %8 %33470238
56NC_015543CTT4123754123765120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33470238
57NC_015543TTC6126308126326190 %66.67 %0 %33.33 %10 %33470238
58NC_015543GAA41365231365341266.67 %0 %33.33 %0 %8 %33470238