ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Apatura metis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015537	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_015537	ATTTT	3	232	245	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_015537	TAT	4	529	540	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33323626
4	NC_015537	ATTT	3	690	700	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33323626
5	NC_015537	T	14	847	860	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33323626
6	NC_015537	ATTT	3	862	872	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33323626
7	NC_015537	TTTAAT	3	926	943	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	33323626
8	NC_015537	ATTA	4	1024	1038	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33323626
9	NC_015537	T	14	1246	1259	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33323626
10	NC_015537	GAG	4	2116	2126	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	33323626
11	NC_015537	ATA	4	2843	2854	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33323626
12	NC_015537	ATT	5	2849	2863	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33323626
13	NC_015537	ATT	4	2888	2898	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33323626
14	NC_015537	AATT	3	3264	3276	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33323626
15	NC_015537	TAA	4	3423	3434	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33323626
16	NC_015537	T	17	3904	3920	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	33323626
17	NC_015537	ATT	4	3948	3958	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33323626
18	NC_015537	TAATT	3	4059	4072	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33323626
19	NC_015537	TTATT	3	4249	4263	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	33323626
20	NC_015537	TCATTA	4	4327	4350	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	33323626
21	NC_015537	TAA	4	4706	4717	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33323626
22	NC_015537	ATT	5	5554	5567	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33323627
23	NC_015537	T	13	5832	5844	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33323627
24	NC_015537	TAAA	3	6335	6346	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33323627
25	NC_015537	TA	6	6401	6411	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33323627
26	NC_015537	TAT	4	6642	6653	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33323627
27	NC_015537	TAA	4	7269	7280	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33323627
28	NC_015537	ATAA	3	7629	7639	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33323627
29	NC_015537	TAA	4	7703	7715	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33323627
30	NC_015537	ATA	5	7733	7747	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33323627
31	NC_015537	CAAA	3	7818	7829	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33323627
32	NC_015537	AAAAAT	3	7975	7992	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	33323627
33	NC_015537	ATTAAT	3	8267	8284	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	33323627
34	NC_015537	ATCTA	3	8301	8314	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	33323627
35	NC_015537	TA	6	8872	8882	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33323627
36	NC_015537	AAAT	3	8992	9002	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33323627
37	NC_015537	AAAAT	3	9081	9094	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33323627
38	NC_015537	ATT	4	9401	9412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33323627
39	NC_015537	AT	7	9541	9555	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33323627
40	NC_015537	A	13	9582	9594	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	33323627
41	NC_015537	AATT	3	9692	9703	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33323627
42	NC_015537	ATT	4	9827	9837	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_015537	ATTTT	4	10002	10021	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	33323627
44	NC_015537	T	14	10046	10059	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33323627
45	NC_015537	T	12	10113	10124	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	33323627
46	NC_015537	ATTT	4	10306	10321	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	33323627
47	NC_015537	AT	20	10380	10418	39	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33323627
48	NC_015537	TAA	5	11001	11015	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33323627
49	NC_015537	A	12	11782	11793	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	33323627
50	NC_015537	AAT	4	12182	12194	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33323627
51	NC_015537	TA	7	12600	12612	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_015537	TA	6	12617	12628	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_015537	TTTTA	3	13108	13123	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_015537	TAAT	4	13610	13625	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015537	AATT	3	13631	13642	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_015537	ATTT	3	13832	13844	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_015537	TAATTT	3	13845	13863	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
58	NC_015537	TAA	4	14537	14547	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_015537	TTAA	3	14739	14750	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015537	T	24	14862	14885	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_015537	ATT	4	15013	15025	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_015537	ATTA	3	15036	15047	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015537	ATTA	4	15055	15070	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_015537	ATTA	4	15091	15106	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_015537	TA	13	15117	15141	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_015537	TA	10	15150	15169	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Apatura metis mitochondrion