ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ptilidium pulcherrimum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015402	ATA	4	1854	1865	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085060
2	NC_015402	ATT	4	3266	3276	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
3	NC_015402	TAT	4	3366	3376	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
4	NC_015402	TTA	4	17293	17304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085060
5	NC_015402	TTA	4	17538	17548	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
6	NC_015402	AGA	4	17659	17670	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33085060
7	NC_015402	CTG	4	18528	18539	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
8	NC_015402	ATA	4	18760	18771	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085060
9	NC_015402	ATT	8	18766	18789	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085060
10	NC_015402	TTA	4	29025	29035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
11	NC_015402	TGC	4	29504	29515	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
12	NC_015402	AAG	4	29773	29784	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33085060
13	NC_015402	GCT	4	30093	30104	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
14	NC_015402	TAT	4	31578	31588	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
15	NC_015402	AAT	4	34303	34313	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33085060
16	NC_015402	TAA	4	35163	35173	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33085060
17	NC_015402	ATA	4	37732	37742	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33085060
18	NC_015402	TGT	4	40108	40118	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	33085060
19	NC_015402	TGC	4	40596	40607	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
20	NC_015402	GAT	4	43648	43660	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	33085060
21	NC_015402	ATT	4	45200	45210	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
22	NC_015402	ATG	4	45581	45591	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33085060
23	NC_015402	ATA	4	47904	47915	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	33085060
24	NC_015402	TTA	4	52811	52822	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085060
25	NC_015402	AAT	4	55893	55904	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085060
26	NC_015402	AGC	4	56207	56218	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
27	NC_015402	ATT	5	63774	63788	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33085060
28	NC_015402	TAT	4	63797	63809	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33085060
29	NC_015402	ATG	4	65726	65736	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33085060
30	NC_015402	ATT	4	65939	65949	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
31	NC_015402	TAA	5	68491	68505	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_015402	ATA	4	77803	77814	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085066
33	NC_015402	TTA	4	78983	78994	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085067
34	NC_015402	ATT	4	79796	79806	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085067
35	NC_015402	GGA	4	85689	85700	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_015402	TAA	5	93635	93649	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_015402	CAA	4	95018	95028	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33085067
38	NC_015402	AAT	5	95100	95115	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33085067
39	NC_015402	TAA	4	95582	95593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015402	TTC	4	96212	96222	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33085067
41	NC_015402	TAA	4	96849	96859	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33085067
42	NC_015402	TTA	4	96943	96954	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085067
43	NC_015402	ATT	4	98014	98025	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085067
44	NC_015402	TTC	5	99719	99733	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	33085068
45	NC_015402	TAA	5	102754	102768	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_015402	AAT	4	103070	103081	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_015402	ATA	4	103578	103588	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_015402	TAT	4	103686	103698	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_015402	TAA	4	105783	105795	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33085068
50	NC_015402	ATA	4	106822	106833	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085068
51	NC_015402	TTA	4	107207	107218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085068

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ptilidium pulcherrimum chloroplast