ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ptilidium pulcherrimum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015402	TTCT	3	626	637	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	33085060
2	NC_015402	TTTATT	3	1763	1781	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	33085060
3	NC_015402	ATA	4	1854	1865	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085060
4	NC_015402	TTTA	3	2886	2896	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33085060
5	NC_015402	ATT	4	3266	3276	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
6	NC_015402	TAT	4	3366	3376	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
7	NC_015402	T	12	4350	4361	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	33085060
8	NC_015402	A	12	4739	4750	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	33085060
9	NC_015402	A	12	4894	4905	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	33085060
10	NC_015402	AT	23	5571	5616	46	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085060
11	NC_015402	TA	6	5791	5801	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085060
12	NC_015402	ATCT	3	11518	11528	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	33085060
13	NC_015402	AT	6	12891	12904	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33085060
14	NC_015402	T	13	14074	14086	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33085060
15	NC_015402	TAAAAA	3	14637	14654	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	33085060
16	NC_015402	TA	6	16398	16408	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085060
17	NC_015402	AATG	3	16510	16521	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	33085060
18	NC_015402	TTA	4	17293	17304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085060
19	NC_015402	AAAAAT	3	17351	17369	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	33085060
20	NC_015402	TTA	4	17538	17548	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
21	NC_015402	AGA	4	17659	17670	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33085060
22	NC_015402	TAAA	3	18155	18165	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33085060
23	NC_015402	CTG	4	18528	18539	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
24	NC_015402	ATA	4	18760	18771	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085060
25	NC_015402	ATT	8	18766	18789	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085060
26	NC_015402	CT	6	18810	18820	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	33085060
27	NC_015402	AATTT	3	19113	19126	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	33085060
28	NC_015402	AAAGA	3	19920	19933	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	33085060
29	NC_015402	CTAA	3	21598	21608	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	33085060
30	NC_015402	TTAT	3	22005	22015	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33085060
31	NC_015402	TTTA	3	22157	22168	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33085060
32	NC_015402	AT	7	23045	23058	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33085060
33	NC_015402	TC	6	23597	23608	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	33085060
34	NC_015402	AT	6	24368	24378	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085060
35	NC_015402	AT	8	24572	24587	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33085060
36	NC_015402	AATT	3	26517	26528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085060
37	NC_015402	TTA	4	29025	29035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
38	NC_015402	TGC	4	29504	29515	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
39	NC_015402	AAG	4	29773	29784	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33085060
40	NC_015402	GCT	4	30093	30104	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
41	NC_015402	AATA	3	30522	30533	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33085060
42	NC_015402	ATCG	3	30826	30836	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	33085060
43	NC_015402	TGTA	3	31131	31142	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	33085060
44	NC_015402	TAT	4	31578	31588	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
45	NC_015402	ATTT	3	31954	31964	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33085060
46	NC_015402	A	13	32501	32513	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33085060
47	NC_015402	GAAAT	3	32683	32696	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	33085060
48	NC_015402	AAT	4	34303	34313	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33085060
49	NC_015402	TAA	4	35163	35173	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33085060
50	NC_015402	AATC	3	37273	37284	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	33085060
51	NC_015402	TTAA	3	37528	37539	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	33085060
52	NC_015402	TA	7	37605	37618	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33085060
53	NC_015402	ATA	4	37732	37742	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33085060
54	NC_015402	TA	6	39801	39811	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085060
55	NC_015402	TGT	4	40108	40118	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	33085060
56	NC_015402	TGC	4	40596	40607	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
57	NC_015402	GA	6	40770	40781	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	33085060
58	NC_015402	TA	11	41316	41336	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085060
59	NC_015402	TC	7	41894	41907	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	33085060
60	NC_015402	GAT	4	43648	43660	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	33085060
61	NC_015402	ATT	4	45200	45210	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
62	NC_015402	ATG	4	45581	45591	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33085060
63	NC_015402	CAAT	3	47290	47302	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	33085060
64	NC_015402	ATA	4	47904	47915	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	33085060
65	NC_015402	ATTT	4	48748	48763	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33085060
66	NC_015402	TA	7	49008	49020	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33085060
67	NC_015402	AATT	3	49065	49076	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085060
68	NC_015402	TATT	3	49216	49226	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33085060
69	NC_015402	AAAT	3	49829	49841	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	33085060
70	NC_015402	T	14	50293	50306	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	33085060
71	NC_015402	AT	7	50668	50680	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33085060
72	NC_015402	ATAA	3	51079	51090	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33085060
73	NC_015402	TAAT	3	52320	52330	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085060
74	NC_015402	TTAT	3	52409	52419	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33085060
75	NC_015402	AAAT	3	52522	52533	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33085060
76	NC_015402	TTA	4	52811	52822	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085060
77	NC_015402	TA	6	55641	55651	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085060
78	NC_015402	AAT	4	55893	55904	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085060
79	NC_015402	AGC	4	56207	56218	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33085060
80	NC_015402	GTTT	3	56695	56705	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	33085060
81	NC_015402	TGCA	3	56930	56942	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	33085060
82	NC_015402	TTTC	3	59563	59574	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	33085060
83	NC_015402	AATT	3	60076	60087	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085060
84	NC_015402	AT	6	60096	60106	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085060
85	NC_015402	T	12	60189	60200	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	33085060
86	NC_015402	TAAAA	3	62014	62027	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33085060
87	NC_015402	ATT	5	63774	63788	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33085060
88	NC_015402	TAT	4	63797	63809	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	33085060
89	NC_015402	AT	6	64625	64636	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085060
90	NC_015402	AAAT	3	65153	65164	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33085060
91	NC_015402	ATTA	3	65253	65264	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085060
92	NC_015402	ATG	4	65726	65736	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33085060
93	NC_015402	ATT	4	65939	65949	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085060
94	NC_015402	ATTT	3	67313	67323	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33085065
95	NC_015402	ATTT	3	67978	67988	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33085065
96	NC_015402	TAA	5	68491	68505	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_015402	TA	6	68529	68539	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_015402	AATAT	3	68547	68560	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_015402	AT	13	72393	72416	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085065
100	NC_015402	AAAT	3	72908	72918	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33085066
101	NC_015402	ATTT	3	73764	73774	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33085066
102	NC_015402	TA	8	75132	75146	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_015402	TTTC	3	75825	75835	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	33085066
104	NC_015402	AAAT	3	77211	77221	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33085066
105	NC_015402	ATA	4	77803	77814	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085066
106	NC_015402	AT	8	78395	78409	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	33085066
107	NC_015402	TTA	4	78983	78994	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085067
108	NC_015402	AT	6	79642	79652	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33085067
109	NC_015402	ATT	4	79796	79806	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33085067
110	NC_015402	AATT	3	79843	79854	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085067
111	NC_015402	TTTA	3	79892	79903	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33085067
112	NC_015402	ATTT	3	80700	80711	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_015402	TTAT	3	81046	81057	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_015402	CTTT	3	84250	84260	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_015402	CT	6	84881	84892	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
116	NC_015402	GGA	4	85689	85700	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_015402	GAGG	3	86941	86952	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_015402	AGGT	3	87159	87170	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015402	TTCT	3	90700	90710	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_015402	TTTA	3	92175	92185	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_015402	TA	7	92332	92345	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_015402	TTTAT	3	92476	92490	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
123	NC_015402	AAAT	3	92928	92939	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_015402	TAA	5	93635	93649	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
125	NC_015402	AT	8	94071	94086	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_015402	AT	6	94608	94619	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33085067
127	NC_015402	CATT	3	94772	94783	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	33085067
128	NC_015402	CAA	4	95018	95028	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33085067
129	NC_015402	AAT	5	95100	95115	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33085067
130	NC_015402	TAA	4	95582	95593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_015402	TTC	4	96212	96222	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33085067
132	NC_015402	TAA	4	96849	96859	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33085067
133	NC_015402	TTA	4	96943	96954	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085067
134	NC_015402	ATT	4	98014	98025	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085067
135	NC_015402	A	13	98548	98560	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	33085067
136	NC_015402	AAATTG	3	98678	98695	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	33085067
137	NC_015402	ACATAC	3	99018	99035	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	33085067
138	NC_015402	TTTTGC	3	99268	99286	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
139	NC_015402	TTC	5	99719	99733	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	33085068
140	NC_015402	AAAT	3	102697	102708	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_015402	TAA	5	102754	102768	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
142	NC_015402	AAT	4	103070	103081	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_015402	ATA	4	103578	103588	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_015402	T	13	103635	103647	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_015402	TAT	4	103686	103698	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
146	NC_015402	T	18	104518	104535	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
147	NC_015402	TATT	3	105726	105737	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33085068
148	NC_015402	TAA	4	105783	105795	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33085068
149	NC_015402	GA	6	105902	105912	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	33085068
150	NC_015402	ATA	4	106822	106833	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33085068
151	NC_015402	TTA	4	107207	107218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33085068
152	NC_015402	TC	6	108076	108086	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
153	NC_015402	AATTTC	3	108605	108622	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
154	NC_015402	CTAC	3	112861	112872	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015402	AG	6	115140	115151	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_015402	AAAG	3	115776	115787	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ptilidium pulcherrimum chloroplast