ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Moniliophthora roreri mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015400GATA3154615561150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
2NC_015400TTAT3302330341225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_015400ATAA3601560271375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
4NC_015400TAAC3716571761250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
5NC_015400AATT312022120341350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_015400ATTT312117121281225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_015400AGGA312325123361250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
8NC_015400GCTA313111131211125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
9NC_015400GTCC31368413695120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
10NC_015400TTCC31437614387120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
11NC_015400TAAA314761147721275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
12NC_015400ATTA320587205981250 %50 %0 %0 %0 %33033944
13NC_015400GTTC32082520836120 %50 %25 %25 %8 %33033944
14NC_015400TAAA322418224291275 %25 %0 %0 %8 %33033944
15NC_015400AGAA423464234791675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
16NC_015400AATT324601246121250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_015400GATT330500305111225 %50 %25 %0 %8 %33033945
18NC_015400TTCC33222232233120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
19NC_015400TTAA332694327041150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_015400TAAT333323333341250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_015400TAGA334608346191250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
22NC_015400TAGA334880348921350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
23NC_015400TTAA334901349121250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_015400TTAA335955359661250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_015400AATT337162371731250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_015400TTTA337624376351225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
27NC_015400ATAA338893389041275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_015400TCCT33957339583110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
29NC_015400TTTA341019410301225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_015400ATTT541274412932025 %75 %0 %0 %10 %33033945
31NC_015400GTTC34402344034120 %50 %25 %25 %8 %33033947
32NC_015400TTAT344136441461125 %75 %0 %0 %9 %33033947
33NC_015400CAAG344681446911150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
34NC_015400ATAA345075450861275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_015400TAAA345354453641175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
36NC_015400CTTC34885548865110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
37NC_015400AATT351357513681250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_015400AGTA351376513871250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
39NC_015400CCCT35271552726120 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
40NC_015400TAAT356374563851250 %50 %0 %0 %8 %33033947
41NC_015400TTTA358097581081225 %75 %0 %0 %8 %33033948
42NC_015400CTTA359263592731125 %50 %0 %25 %9 %33033948
43NC_015400TTAA360084600941150 %50 %0 %0 %9 %33033948
44NC_015400TTTA360984609951225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_015400AAAT363502635141375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
46NC_015400TTAA363765637761250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
47NC_015400TCTA364320643301125 %50 %0 %25 %9 %33033948
48NC_015400ATTT364893649051325 %75 %0 %0 %7 %33033948
49NC_015400AAAT366292663021175 %25 %0 %0 %9 %33033948
50NC_015400TTAA368237682481250 %50 %0 %0 %8 %33033949
51NC_015400TAAG369474694851250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
52NC_015400TTTA370793708041225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_015400TTTA370862708731225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
54NC_015400AAGA372345723551175 %0 %25 %0 %9 %33033946
55NC_015400AATT373603736141250 %50 %0 %0 %8 %33033946
56NC_015400TAGG376231762421225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
57NC_015400GGAG376850768611225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
58NC_015400TAAA383134831451275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
59NC_015400CCTC48327183286160 %25 %0 %75 %6 %Non-Coding
60NC_015400AAAG383649836611375 %0 %25 %0 %7 %33033949
61NC_015400TATT384406844161125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
62NC_015400ATTT385378853901325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
63NC_015400TCTA385392854021125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
64NC_015400TTAA385992860021150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
65NC_015400GGAA386087860971150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
66NC_015400TTTA386622866331225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
67NC_015400CAAG387175871871350 %0 %25 %25 %7 %Non-Coding
68NC_015400TTAG487462874761525 %50 %25 %0 %6 %Non-Coding
69NC_015400AATT387639876501250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
70NC_015400TACT387867878781225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
71NC_015400TAAA388014880251275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
72NC_015400ATTT388037880481225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
73NC_015400ACTA388617886271150 %25 %0 %25 %9 %33033949
74NC_015400TTGA390003900141225 %50 %25 %0 %8 %33033949
75NC_015400TTAA390655906661250 %50 %0 %0 %8 %33033949
76NC_015400TAAA391353913641275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
77NC_015400TGTA391617916271125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
78NC_015400AAGC392089920991150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
79NC_015400AAGA392344923551275 %0 %25 %0 %8 %33033946
80NC_015400ATTT392619926311325 %75 %0 %0 %7 %33033946
81NC_015400TTTA392877928871125 %75 %0 %0 %9 %33033946