ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pichia pastoris CBS 7435 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015384	AGAAAA	4	421	444	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015384	ATTT	3	717	729	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	32867235
3	NC_015384	ATT	4	979	989	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32867235
4	NC_015384	TAT	4	1271	1281	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015384	C	13	1282	1294	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015384	TA	6	1570	1581	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015384	ATA	5	1784	1797	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32867236
8	NC_015384	AAT	4	1938	1950	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32867236
9	NC_015384	TTA	4	2060	2070	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32867236
10	NC_015384	TAG	4	2965	2976	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32867236
11	NC_015384	AT	6	2992	3004	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32867236
12	NC_015384	AAT	4	3011	3022	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867236
13	NC_015384	ATA	4	3097	3107	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32867236
14	NC_015384	AT	6	3319	3329	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32867236
15	NC_015384	TTTA	3	3530	3541	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32867236
16	NC_015384	TTA	4	3719	3730	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
17	NC_015384	ATT	4	3883	3894	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
18	NC_015384	TAT	4	4008	4019	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
19	NC_015384	ATT	4	4776	4788	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32867236
20	NC_015384	TAA	4	4798	4809	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867236
21	NC_015384	AT	9	5304	5321	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_015384	AATC	3	5377	5388	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015384	TAT	7	5391	5411	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015384	TAA	4	5439	5449	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_015384	AGTA	3	5703	5714	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015384	TATAAA	3	5873	5889	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32867236
27	NC_015384	TTA	4	6099	6109	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32867236
28	NC_015384	AAAT	3	6187	6197	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015384	TA	7	6199	6212	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_015384	AT	14	6312	6338	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_015384	TAAA	3	6354	6366	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_015384	TAT	4	6788	6798	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015384	AAAT	3	6811	6822	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_015384	TA	6	6847	6857	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_015384	AAAAGA	3	7120	7136	17	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_015384	GAATAT	3	7359	7376	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32867236
37	NC_015384	TAA	4	7487	7498	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867236
38	NC_015384	TAT	4	7549	7560	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
39	NC_015384	ATTT	3	7563	7575	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	32867236
40	NC_015384	AT	6	7809	7819	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_015384	TAG	4	8148	8159	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32867236
42	NC_015384	AT	6	8307	8317	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32867236
43	NC_015384	ATT	4	8389	8400	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
44	NC_015384	CTAT	3	9344	9354	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_015384	AT	9	9530	9546	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_015384	AT	7	10103	10115	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_015384	TA	6	10129	10139	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_015384	AAAT	3	10147	10158	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015384	TTA	5	10207	10221	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_015384	ATA	5	10223	10237	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_015384	TAA	4	10325	10336	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_015384	TAT	5	10427	10441	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_015384	TTA	4	10612	10623	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
54	NC_015384	TAA	5	10641	10655	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32867236
55	NC_015384	TAA	4	10728	10738	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32867236
56	NC_015384	TA	7	10750	10765	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	32867236
57	NC_015384	TTTA	3	10794	10804	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32867236
58	NC_015384	ATTA	3	11241	11252	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32867236
59	NC_015384	TAT	4	11550	11561	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
60	NC_015384	TAAT	3	11665	11676	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_015384	TAT	5	11718	11732	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_015384	AATTTA	4	11743	11766	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_015384	AATTT	3	11773	11787	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_015384	AT	6	11798	11809	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_015384	AT	8	11820	11835	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_015384	ATA	4	12183	12193	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_015384	TAAA	3	12720	12731	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_015384	ATGT	3	12857	12867	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_015384	AT	7	12898	12913	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_015384	TAT	4	13109	13120	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
71	NC_015384	TAA	4	13481	13491	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32867236
72	NC_015384	AT	6	13536	13546	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32867236
73	NC_015384	TTAAA	3	13801	13815	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	32867236
74	NC_015384	AAT	7	13894	13914	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32867236
75	NC_015384	TAA	4	13935	13946	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867236
76	NC_015384	AAAAT	3	14221	14235	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_015384	TAT	4	14307	14318	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_015384	AT	6	14568	14578	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_015384	AGG	4	14630	14640	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_015384	ACTT	3	14746	14756	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_015384	ACAT	3	15107	15117	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
82	NC_015384	AT	7	15130	15142	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_015384	TAA	4	15182	15193	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_015384	AAT	4	15617	15628	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_015384	TTAA	4	16413	16427	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_015384	AT	7	16652	16664	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_015384	TA	7	16956	16970	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_015384	TAAA	3	17044	17056	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_015384	AAAATA	3	17138	17155	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_015384	AGT	4	17502	17513	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32867236
91	NC_015384	TAT	4	17575	17585	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32867236
92	NC_015384	ATA	4	17777	17787	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32867236
93	NC_015384	TAA	5	18522	18536	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32867236
94	NC_015384	ATA	4	18766	18776	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32867236
95	NC_015384	AT	8	19044	19059	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	32867236
96	NC_015384	AT	6	19068	19079	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32867236
97	NC_015384	ATTT	3	19856	19868	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	32867236
98	NC_015384	ATA	4	20541	20551	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32867236
99	NC_015384	TAA	4	21009	21020	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867236
100	NC_015384	TAT	4	21085	21096	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
101	NC_015384	AT	8	21119	21134	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	32867236
102	NC_015384	AAATT	3	21210	21224	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	32867236
103	NC_015384	ATTT	4	21311	21326	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	32867236
104	NC_015384	ATA	8	21407	21429	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867236
105	NC_015384	ATA	5	21803	21817	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32867236
106	NC_015384	TA	6	22043	22053	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32867236
107	NC_015384	TAT	4	22319	22330	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
108	NC_015384	TTA	4	22414	22425	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
109	NC_015384	TAT	4	22618	22628	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_015384	ATT	4	22742	22753	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
111	NC_015384	ATTA	3	22817	22827	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32867236
112	NC_015384	TAT	4	22972	22983	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867236
113	NC_015384	TTTAT	3	23195	23209	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	32867236
114	NC_015384	AT	6	23713	23724	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32867236
115	NC_015384	TTAGTA	3	23725	23741	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	32867236
116	NC_015384	AAT	4	23766	23776	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32867236
117	NC_015384	TAT	4	24009	24021	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32867236
118	NC_015384	ATA	4	24154	24165	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867236
119	NC_015384	ATT	5	24227	24242	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32867236
120	NC_015384	TAT	4	24277	24287	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32867236
121	NC_015384	TTA	4	24515	24526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32867237
122	NC_015384	AT	6	24764	24775	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_015384	TAT	4	25078	25090	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_015384	ATT	4	25120	25131	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_015384	AAAT	3	25162	25173	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_015384	TA	7	25194	25206	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_015384	TA	7	25229	25241	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_015384	TAT	5	25940	25954	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32867237
129	NC_015384	ATT	4	25980	25991	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	32867237
130	NC_015384	TAA	4	26330	26341	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867237
131	NC_015384	ATTA	3	26724	26736	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32867237
132	NC_015384	AT	7	28611	28623	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32867237
133	NC_015384	TAT	4	29049	29061	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32867237
134	NC_015384	ATA	4	29086	29097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32867237
135	NC_015384	AACA	3	29312	29323	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	32867237
136	NC_015384	TAT	4	29590	29601	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_015384	TAAT	3	29708	29718	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_015384	TA	6	29722	29734	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_015384	ATA	5	30082	30095	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32867237
140	NC_015384	TAAA	3	30464	30474	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32867237
141	NC_015384	ATTA	3	30798	30810	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32867237
142	NC_015384	TAT	4	31116	31127	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_015384	AT	19	31213	31249	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_015384	TAAA	3	31383	31394	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_015384	TTA	4	31658	31669	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_015384	TAA	4	31749	31760	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_015384	AAT	4	31938	31950	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
148	NC_015384	TTTTA	4	32142	32162	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_015384	ATT	4	32341	32352	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_015384	TAA	4	32362	32373	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_015384	TA	7	32417	32429	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
152	NC_015384	TAA	4	32948	32960	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
153	NC_015384	TAAT	3	33385	33395	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
154	NC_015384	TA	10	33431	33450	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
155	NC_015384	AATT	3	33584	33595	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_015384	ATAA	6	34093	34116	24	75 %	25 %	0 %	0 %	4 %	32867237
157	NC_015384	AT	6	34340	34350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32867237
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159	NC_015384	TTAT	3	34526	34537	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32867237
160	NC_015384	ATA	6	34558	34575	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32867237
161	NC_015384	TAA	5	34682	34696	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32867237
162	NC_015384	ATAA	3	34750	34761	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32867237
163	NC_015384	GA	6	34957	34967	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
164	NC_015384	TAA	4	35290	35302	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
165	NC_015384	TAA	4	35529	35541	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pichia pastoris CBS 7435 mitochondrion