ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chlorella variabilis plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015359	TAT	4	6724	6735	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33126809
2	NC_015359	ATT	4	18379	18389	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33126810
3	NC_015359	TGT	4	24931	24942	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	33126810
4	NC_015359	GGT	4	25127	25138	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	33126810
5	NC_015359	ACA	4	27710	27722	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	33126811
6	NC_015359	CAG	5	29298	29312	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
7	NC_015359	GTT	4	30438	30448	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_015359	CAC	4	30698	30708	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
9	NC_015359	AAT	4	30810	30821	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015359	TGA	4	36219	36229	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	33126811
11	NC_015359	AGA	4	36367	36377	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33126811
12	NC_015359	TAA	4	43539	43550	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015359	ACA	4	43728	43739	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33126811
14	NC_015359	ATT	4	44410	44420	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33126811
15	NC_015359	AGA	4	51251	51262	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	33126812
16	NC_015359	GAA	4	51952	51964	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	33126812
17	NC_015359	CAA	4	70218	70228	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015359	CAA	4	74050	74060	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33126813
19	NC_015359	GAA	4	80466	80476	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33126814
20	NC_015359	ATT	4	80977	80987	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33126814
21	NC_015359	AGT	4	82708	82719	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	33126814
22	NC_015359	ATT	4	87087	87098	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33126815
23	NC_015359	ACA	4	90260	90270	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33126815
24	NC_015359	CTG	4	93525	93535	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	33126815
25	NC_015359	TTA	4	95349	95360	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33126816
26	NC_015359	TGG	4	97865	97876	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	33126816
27	NC_015359	TCT	4	98515	98525	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	33126816
28	NC_015359	TGC	4	98558	98569	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	33126816
29	NC_015359	TGT	4	98922	98933	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015359	TGC	4	117338	117348	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	33126817
31	NC_015359	TAG	5	119932	119946	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_015359	TGA	4	120158	120169	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_015359	TTC	4	120694	120705	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chlorella variabilis plastid