ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Hevea brasiliensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015308	CAG	4	1384	1395	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32690937
2	NC_015308	ATA	4	2315	2326	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015308	TAT	4	2843	2855	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32690937
4	NC_015308	ATA	4	3313	3327	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32690937
5	NC_015308	CTT	4	5784	5794	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32690937
6	NC_015308	TAT	5	9244	9259	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_015308	TAT	7	9272	9292	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_015308	ATA	4	9314	9326	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_015308	TAA	4	9617	9629	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_015308	ATT	5	10907	10921	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_015308	AAC	4	18374	18385	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	32690938
12	NC_015308	GAA	4	19368	19378	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	32690938
13	NC_015308	TAA	4	25634	25645	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015308	GTT	5	27359	27373	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	32690938
15	NC_015308	TAA	4	27917	27929	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_015308	TAA	4	29245	29256	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015308	AAC	4	29942	29954	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	32690938
18	NC_015308	GAA	4	31615	31626	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32690938
19	NC_015308	TAT	4	32040	32050	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_015308	TAT	4	32053	32063	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015308	TAT	8	32124	32148	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015308	TAT	4	33425	33435	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015308	TAT	4	33502	33514	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_015308	TAT	4	33557	33569	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_015308	ATT	4	33699	33709	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015308	ATT	4	33727	33737	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015308	ATT	4	33745	33755	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_015308	ATT	4	33773	33783	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015308	ATT	4	33791	33801	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015308	ATT	4	33819	33829	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_015308	ATT	4	33837	33847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_015308	ATT	4	33865	33875	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015308	TTA	4	36411	36422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32690938
34	NC_015308	GGA	4	37807	37818	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	32690938
35	NC_015308	ATT	4	39766	39778	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_015308	TAA	4	39814	39824	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_015308	TAA	4	39845	39856	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015308	GCA	4	44114	44125	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32690939
39	NC_015308	ATA	4	50180	50191	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015308	TAT	8	51930	51953	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015308	CAA	4	53842	53852	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_015308	TAT	4	54166	54177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_015308	TAT	5	54275	54288	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_015308	TAT	4	54342	54352	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_015308	TAT	4	54421	54434	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_015308	AAG	4	54694	54704	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_015308	ATA	7	57535	57556	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32690940
48	NC_015308	ATA	4	57817	57828	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015308	TTG	4	58246	58256	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_015308	TAT	4	67658	67669	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_015308	TAA	4	70876	70886	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_015308	TAA	6	70899	70915	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_015308	TAT	6	71656	71674	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_015308	ATA	4	74757	74769	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32690945
55	NC_015308	ATT	5	76867	76881	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32690945
56	NC_015308	ATT	4	79009	79021	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32690945
57	NC_015308	ATC	4	80090	80101	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32690945
58	NC_015308	TCT	4	82954	82965	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32690945
59	NC_015308	CTT	4	89425	89436	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32690945
60	NC_015308	GAT	4	89893	89903	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32690945
61	NC_015308	GAT	4	91282	91292	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32690945
62	NC_015308	GAT	4	94333	94344	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32690945
63	NC_015308	TTC	4	104351	104362	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32690944
64	NC_015308	TCT	4	105620	105631	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32690944
65	NC_015308	GAA	5	114772	114786	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	32690944
66	NC_015308	AAT	4	118378	118389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32690944
67	NC_015308	ATT	4	119774	119784	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32690944
68	NC_015308	TAT	4	120237	120248	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32690944
69	NC_015308	ATT	4	120604	120616	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32690944
70	NC_015308	TTC	5	126263	126277	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	32690944
71	NC_015308	TTC	4	127301	127311	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32690944
72	NC_015308	TAA	4	129707	129718	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32690944
73	NC_015308	TTC	4	130953	130964	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32690944
74	NC_015308	AAC	4	132117	132128	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	32690944
75	NC_015308	ATT	4	132633	132644	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32690944
76	NC_015308	TTA	4	133237	133249	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32690944
77	NC_015308	GAA	4	134911	134922	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32690944
78	NC_015308	TTC	6	135611	135629	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	32690944
79	NC_015308	TCA	4	136281	136291	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32690944
80	NC_015308	AGA	4	144770	144781	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32690944
81	NC_015308	AAG	4	146037	146048	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32690944
82	NC_015308	CTT	4	152648	152659	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32690943
83	NC_015308	ACC	4	154581	154591	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	32690943
84	NC_015308	ATC	4	156057	156068	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32690943
85	NC_015308	ATC	4	159109	159119	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_015308	ATC	4	160498	160508	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32690945
87	NC_015308	GAA	5	160964	160978	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	32690945

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