ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Hevea brasiliensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015308	AT	12	528	552	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015308	AT	6	649	660	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015308	TA	7	664	678	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_015308	AC	6	766	777	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015308	TA	6	4952	4963	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015308	TA	6	4998	5009	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015308	TA	6	5354	5365	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015308	TA	6	5711	5722	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32690937
9	NC_015308	TA	6	9679	9689	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_015308	TA	6	9715	9725	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015308	AT	6	10944	10955	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015308	AT	6	22119	22129	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32690938
13	NC_015308	TA	6	26799	26809	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32690938
14	NC_015308	AT	6	28127	28139	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_015308	AT	11	31804	31824	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015308	AT	6	32492	32503	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015308	TA	12	32509	32530	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015308	TA	6	33538	33549	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_015308	TA	13	34381	34405	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015308	AT	8	35294	35309	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_015308	TA	6	35322	35332	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_015308	AG	6	38810	38820	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015308	TC	6	39426	39436	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32690939
24	NC_015308	TG	6	44151	44161	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	32690939
25	NC_015308	TA	9	46485	46502	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	32690939
26	NC_015308	AT	6	53728	53738	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32690939
27	NC_015308	TA	13	62290	62315	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015308	AT	6	62500	62510	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015308	TA	6	65523	65534	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015308	AT	6	65753	65763	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32690940
31	NC_015308	AT	8	67412	67428	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_015308	AT	6	72184	72194	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015308	AT	6	86699	86712	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32690945
34	NC_015308	AT	7	86846	86861	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	32690945
35	NC_015308	AT	6	87466	87476	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32690945
36	NC_015308	AT	6	88235	88245	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32690945
37	NC_015308	AT	6	99812	99823	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32690945
38	NC_015308	AT	6	116530	116541	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32690944
39	NC_015308	CT	6	128853	128864	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32690944
40	NC_015308	AT	7	130098	130110	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32690944
41	NC_015308	AT	6	150580	150591	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Hevea brasiliensis chloroplast