Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Pristionchus pacificus mitochondrion
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S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Start | End | Tract Length | A% | T% | G% | C% | Imperfection % | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_015245 | ATTT | 3 | 80 | 90 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
2 | NC_015245 | ATTT | 3 | 749 | 760 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 326536051 |
3 | NC_015245 | TTTA | 3 | 2699 | 2709 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 326536053 |
4 | NC_015245 | TATT | 3 | 3230 | 3240 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 326536053 |
5 | NC_015245 | TTTA | 3 | 3261 | 3273 | 13 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 7 % | 326536053 |
6 | NC_015245 | AATG | 3 | 3280 | 3290 | 11 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 9 % | 326536053 |
7 | NC_015245 | TTTA | 3 | 3573 | 3584 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 326536054 |
8 | NC_015245 | TGTT | 3 | 3980 | 3991 | 12 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 8 % | 326536054 |
9 | NC_015245 | TTTA | 3 | 4827 | 4837 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 326536055 |
10 | NC_015245 | TATT | 3 | 4878 | 4889 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 0 % | 326536055 |
11 | NC_015245 | ATTT | 3 | 6270 | 6280 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 326536056 |
12 | NC_015245 | ATGT | 3 | 6304 | 6314 | 11 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 9 % | 326536056 |
13 | NC_015245 | TATT | 3 | 6445 | 6456 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 326536056 |
14 | NC_015245 | TATT | 3 | 6932 | 6943 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 326536057 |
15 | NC_015245 | TATT | 3 | 7001 | 7011 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 326536057 |
16 | NC_015245 | TATT | 5 | 7590 | 7610 | 21 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 326536057 |
17 | NC_015245 | GTTT | 3 | 8372 | 8383 | 12 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 8 % | 326536058 |
18 | NC_015245 | TTTA | 4 | 8857 | 8872 | 16 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 6 % | 326536058 |
19 | NC_015245 | ATCA | 3 | 9198 | 9208 | 11 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 9 % | 326536058 |
20 | NC_015245 | TTAT | 4 | 9226 | 9241 | 16 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 6 % | 326536058 |
21 | NC_015245 | TAGA | 3 | 10097 | 10108 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 326536059 |
22 | NC_015245 | TTAT | 5 | 10162 | 10182 | 21 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 326536059 |
23 | NC_015245 | TCAT | 3 | 12925 | 12936 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 326536061 |
24 | NC_015245 | TATT | 3 | 14591 | 14602 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |