ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pristionchus pacificus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015245	ATTT	3	80	90	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015245	TTTTAT	3	668	685	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	326536051
3	NC_015245	ATTT	3	749	760	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	326536051
4	NC_015245	TTTA	3	2699	2709	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	326536053
5	NC_015245	TATT	3	3230	3240	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	326536053
6	NC_015245	TTTA	3	3261	3273	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	326536053
7	NC_015245	AATG	3	3280	3290	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	326536053
8	NC_015245	AAT	4	3525	3535	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	326536054
9	NC_015245	TTTA	3	3573	3584	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	326536054
10	NC_015245	TAT	4	3689	3700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	326536054
11	NC_015245	TAT	4	3844	3855	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	326536054
12	NC_015245	TGTT	3	3980	3991	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	326536054
13	NC_015245	AT	7	4725	4737	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	326536055
14	NC_015245	TTTA	3	4827	4837	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	326536055
15	NC_015245	TATT	3	4878	4889	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	326536055
16	NC_015245	AAATT	3	5467	5480	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	326536055
17	NC_015245	ATTTT	3	5940	5953	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	326536056
18	NC_015245	ATTT	3	6270	6280	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	326536056
19	NC_015245	ATGT	3	6304	6314	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	326536056
20	NC_015245	TATT	3	6445	6456	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	326536056
21	NC_015245	TAG	4	6642	6652	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	326536057
22	NC_015245	TA	6	6800	6810	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	326536057
23	NC_015245	TATT	3	6932	6943	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	326536057
24	NC_015245	TATT	3	7001	7011	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	326536057
25	NC_015245	TATT	5	7590	7610	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	326536057
26	NC_015245	GTTT	3	8372	8383	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	326536058
27	NC_015245	TTTA	4	8857	8872	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	326536058
28	NC_015245	ATCA	3	9198	9208	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	326536058
29	NC_015245	TTAT	4	9226	9241	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	326536058
30	NC_015245	TAGTA	3	9397	9411	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_015245	TAGA	3	10097	10108	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	326536059
32	NC_015245	TTAT	5	10162	10182	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	326536059
33	NC_015245	TAT	5	10297	10310	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	326536059
34	NC_015245	TA	6	10980	10990	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_015245	ATG	4	12059	12069	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	326536060
36	NC_015245	ATT	5	12320	12333	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	326536061
37	NC_015245	TCAT	3	12925	12936	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	326536061
38	NC_015245	A	14	13885	13898	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_015245	TTA	4	14246	14257	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015245	TATTT	3	14395	14408	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_015245	TATT	3	14591	14602	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015245	ATT	4	14677	14689	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_015245	A	13	14767	14779	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_015245	AT	24	15028	15074	47	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_015245	TA	8	15120	15134	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_015245	TA	8	15226	15240	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_015245	TA	8	15271	15286	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_015245	AT	6	15308	15319	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015245	AT	7	15828	15841	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_015245	TA	6	15843	15854	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_015245	TA	6	15877	15888	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pristionchus pacificus mitochondrion