Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Fragaria vesca subsp. vesca chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015206CAG499710081233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %32512684
2NC_015206AAG4210221131266.67 %0 %33.33 %0 %8 %32512684
3NC_015206AAT4480648171266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_015206TAT4710271141333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
5NC_015206ATA4760076101166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_015206TAT410378103881133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
7NC_015206TAA410415104261266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_015206TAT610442104581733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
9NC_015206TGT41757717588120 %66.67 %33.33 %0 %8 %32512685
10NC_015206GTT42305223063120 %66.67 %33.33 %0 %8 %32512685
11NC_015206TAC429001290111133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
12NC_015206ATA430936309461166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_015206TAA432326323371266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_015206TAT432694327051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_015206AAT433110331211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_015206TGC43598135992120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %32512686
17NC_015206TCT43806738077110 %66.67 %0 %33.33 %9 %32512686
18NC_015206CAC441190412011233.33 %0 %0 %66.67 %8 %32512686
19NC_015206GCA441510415211233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %32512686
20NC_015206TTA452795528061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_015206TGA453573535831133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
22NC_015206ATA455721557311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %32512687
23NC_015206TAT456196562061133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_015206ATT467903679151333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
25NC_015206GAA469580695911266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
26NC_015206TCC47317273182110 %33.33 %0 %66.67 %9 %32512688
27NC_015206TAT473459734711333.33 %66.67 %0 %0 %7 %32512688
28NC_015206TCT47505775068120 %66.67 %0 %33.33 %8 %32512688
29NC_015206TCT47946779478120 %66.67 %0 %33.33 %8 %32512688
30NC_015206TTA485498855091233.33 %66.67 %0 %0 %8 %32512688
31NC_015206CTT48571385724120 %66.67 %0 %33.33 %8 %32512688
32NC_015206GAT486181861911133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %32512688
33NC_015206TAT486400864111233.33 %66.67 %0 %0 %0 %32512688
34NC_015206GAT487569875791133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %32512688
35NC_015206AAG41012941013051266.67 %0 %33.33 %0 %8 %32512692
36NC_015206GAA51106211106351566.67 %0 %33.33 %0 %6 %32512692
37NC_015206TAA41122791122901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %32512692
38NC_015206AAG41130181130291266.67 %0 %33.33 %0 %8 %32512692
39NC_015206TAA41137231137331166.67 %33.33 %0 %0 %9 %32512692
40NC_015206TTC5121236121250150 %66.67 %0 %33.33 %6 %32512692
41NC_015206TAT41215121215221133.33 %66.67 %0 %0 %9 %32512692
42NC_015206TTA41215981216091233.33 %66.67 %0 %0 %8 %32512692
43NC_015206ATT41216201216301133.33 %66.67 %0 %0 %9 %32512692
44NC_015206TAT41258471258581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %32512692
45NC_015206ATC41274291274391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %32512692
46NC_015206ATA51277171277301466.67 %33.33 %0 %0 %7 %32512692
47NC_015206TAA41291561291671266.67 %33.33 %0 %0 %8 %32512692
48NC_015206TTC6130659130677190 %66.67 %0 %33.33 %10 %32512692
49NC_015206CTT4139993140004120 %66.67 %0 %33.33 %8 %32512692
50NC_015206ATC41506851506961233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %32512692
51NC_015206GAA41521961522061166.67 %0 %33.33 %0 %9 %32512692
52NC_015206ATC41537191537291133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
53NC_015206ATA41548871548981266.67 %33.33 %0 %0 %0 %32512692
54NC_015206ATC41551071551171133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %32512692
55NC_015206GAA51555731555871566.67 %0 %33.33 %0 %6 %32512692