ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Gossypium thurberi chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015204AAGT3114411541150 %25 %25 %0 %9 %32521091
2NC_015204AT7172917411350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_015204AAAT3206820791275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_015204CAATA3462146361660 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
5NC_015204ATCT3471947301225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
6NC_015204ATTTT3486448771420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_015204ATT5488649011633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_015204TTTTA3494449581520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_015204TGT449594969110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
10NC_015204TTCA3499050011225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
11NC_015204GTT450565066110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
12NC_015204GAATAA3511951371966.67 %16.67 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
13NC_015204A145673568614100 %0 %0 %0 %7 %32521091
14NC_015204AAAT4651165261675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
15NC_015204TTTA3659666071225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_015204A166655667016100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_015204TAA4668466951266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_015204AAT4670267131266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_015204ATAG3840084111250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
20NC_015204TAT4842384341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_015204ATTT3867086811225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_015204AATC3875887681150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
23NC_015204ATTT4886188751525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
24NC_015204CTTAT3979598101620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
25NC_015204ATTCT310000100131420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
26NC_015204T141235012363140 %100 %0 %0 %7 %32521091
27NC_015204TTTCT31271212725140 %80 %0 %20 %7 %32521091
28NC_015204TCTA313509135201225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
29NC_015204AAT413562135731266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
30NC_015204AAAT314131141421275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_015204C131468714699130 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
32NC_015204T121471514726120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_015204TTTA414760147741525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
34NC_015204CT81708217097160 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
35NC_015204TTA417228172391233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_015204ATG718275182952133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %32521092
37NC_015204T151931519329150 %100 %0 %0 %6 %32521092
38NC_015204TTTA323438234491225 %75 %0 %0 %8 %32521092
39NC_015204TAA423976239861166.67 %33.33 %0 %0 %9 %32521092
40NC_015204GTT42440824419120 %66.67 %33.33 %0 %8 %32521092
41NC_015204T122702927040120 %100 %0 %0 %0 %32521092
42NC_015204GATA327272272821150 %25 %25 %0 %9 %32521092
43NC_015204GAA427859278701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
44NC_015204AT628097281081250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_015204TAT428539285491133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
46NC_015204CTAA329112291231250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
47NC_015204T143029130304140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
48NC_015204GAAA331455314661275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
49NC_015204ATCA331655316651150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
50NC_015204TTCA432523325381625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
51NC_015204TG63264932660120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
52NC_015204T123265932670120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_015204TA832953329681650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
54NC_015204ATTTTG333327333431716.67 %66.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
55NC_015204AATA333570335811275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
56NC_015204TCTT33364333655130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
57NC_015204GTTT33398133992120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
58NC_015204GAAA335969359801275 %0 %25 %0 %8 %32521092
59NC_015204TTGC33637036380110 %50 %25 %25 %9 %32521092
60NC_015204TTA437117371281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_015204AG637190372001150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
62NC_015204ATCT337389374001225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
63NC_015204TA637402374131250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_015204AAAT337453374641275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_015204AAAAT337924379381580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
66NC_015204TGAA438003380171550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
67NC_015204ATA438134381441166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_015204AAATAA338186382031883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
69NC_015204ATA538267382821666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
70NC_015204ATA438313383251366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
71NC_015204TAA438382383921166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
72NC_015204TAAT338400384111250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
73NC_015204AAAT338430384421375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
74NC_015204GATC339027390371125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
75NC_015204AATG342374423851250 %25 %25 %0 %8 %32521093
76NC_015204TG64281642826110 %50 %50 %0 %9 %32521093
77NC_015204ATCT444098441131625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
78NC_015204AT1344485445092550 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_015204TAATT344766447791440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
80NC_015204ATA444881448931366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
81NC_015204TAG446554465641133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %32521093
82NC_015204AT646832468441350 %50 %0 %0 %7 %32521093
83NC_015204GTAA346868468781150 %25 %25 %0 %9 %32521093
84NC_015204TTTG34838248393120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
85NC_015204AT948428484441750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
86NC_015204AAT448448484591266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
87NC_015204AT648507485171150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
88NC_015204TA649138491511450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_015204TAA449645496571366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
90NC_015204ATTTTT349663496801816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
91NC_015204TAA549709497231566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
92NC_015204AAAG349734497451275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
93NC_015204ATT550334503471433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
94NC_015204T155057350587150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
95NC_015204AGAAT350672506861560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
96NC_015204AT851041510551550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
97NC_015204CATA351098511081150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
98NC_015204GTTTT35119451207140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
99NC_015204ACAT351392514021150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
100NC_015204TTATT351440514531420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
101NC_015204CAAA352531525421275 %0 %0 %25 %8 %32521093
102NC_015204GTCT35314153152120 %50 %25 %25 %8 %32521093
103NC_015204TTA453368533791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
104NC_015204CAA453873538831166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
105NC_015204GTTT35390653918130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
106NC_015204GATT353944539551225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
107NC_015204ATTTCG353988540041716.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
108NC_015204TA654051540631350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
109NC_015204ATTCT354203542161420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
110NC_015204TAGAA354242542551460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
111NC_015204ATTT354256542661125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
112NC_015204AATC554284543021950 %25 %0 %25 %10 %Non-Coding
113NC_015204TTAAT454605546231940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
114NC_015204AGAA354836548471275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
115NC_015204TTTCA358081580961620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
116NC_015204AAAG360640606501175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
117NC_015204ATTT362367623781225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
118NC_015204TAGT362391624021225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
119NC_015204ATT562489625031533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
120NC_015204TTTA362892629041325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
121NC_015204TCTA363431634421225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
122NC_015204TTTTC46453364552200 %80 %0 %20 %10 %Non-Coding
123NC_015204CTT46555965570120 %66.67 %0 %33.33 %8 %32521094
124NC_015204TTTC36725367263110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
125NC_015204AAT467514675251266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
126NC_015204ATA467631676411166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
127NC_015204TCT46916869180130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
128NC_015204T176940969425170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
129NC_015204A12694846949512100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
130NC_015204ATT671494715121933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
131NC_015204TAAA371865718761275 %25 %0 %0 %8 %32521095
132NC_015204ATA572064720771466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
133NC_015204TCAT373404734151225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
134NC_015204GAAC373747737581250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
135NC_015204TTTA374679746901225 %75 %0 %0 %8 %32521095
136NC_015204A14749377495014100 %0 %0 %0 %7 %32521095
137NC_015204TGAA376497765071150 %25 %25 %0 %9 %32521095
138NC_015204CTT47812678136110 %66.67 %0 %33.33 %9 %32521095
139NC_015204TTATA379411794241440 %60 %0 %0 %7 %32521095
140NC_015204ACA479827798381266.67 %0 %0 %33.33 %8 %32521095
141NC_015204A13807618077313100 %0 %0 %0 %7 %32521095
142NC_015204TTGA381540815521325 %50 %25 %0 %7 %32521095
143NC_015204A12821228213312100 %0 %0 %0 %8 %32521095
144NC_015204TTTC38247582485110 %75 %0 %25 %9 %32521095
145NC_015204CACTT384192842051420 %40 %0 %40 %7 %32521095
146NC_015204CTTT38441384423110 %75 %0 %25 %9 %32521095
147NC_015204AT686157861681250 %50 %0 %0 %8 %32521095
148NC_015204TATCA386258862731640 %40 %0 %20 %6 %32521095
149NC_015204TTAA386538865491250 %50 %0 %0 %8 %32521095
150NC_015204TTTC38679186802120 %75 %0 %25 %8 %32521095
151NC_015204AT686927869371150 %50 %0 %0 %9 %32521095
152NC_015204AATT387637876471150 %50 %0 %0 %9 %32521095
153NC_015204TTAT387774877851225 %75 %0 %0 %8 %32521095
154NC_015204AATT388416884271250 %50 %0 %0 %8 %32521095
155NC_015204ATA488458884691266.67 %33.33 %0 %0 %8 %32521095
156NC_015204CTT48885688867120 %66.67 %0 %33.33 %8 %32521095
157NC_015204GAT489328893381133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %32521095
158NC_015204ATATG390681906951540 %40 %20 %0 %6 %32521095
159NC_015204GAT490724907341133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %32521095
160NC_015204AACGG392265922781440 %0 %40 %20 %7 %32521095
161NC_015204TTCT39242492434110 %75 %0 %25 %9 %32521095
162NC_015204ATCG393182931941325 %25 %25 %25 %7 %32521095
163NC_015204CTTT39361193621110 %75 %0 %25 %9 %32521095
164NC_015204AGA494449944591166.67 %0 %33.33 %0 %9 %32521095
165NC_015204TGAT395493955051325 %50 %25 %0 %7 %32521095
166NC_015204AATA396376963881375 %25 %0 %0 %7 %32521095
167NC_015204GAAGGA397162971791850 %0 %50 %0 %5 %32521095
168NC_015204CTAATT398335983511733.33 %50 %0 %16.67 %5 %32521095
169NC_015204GAAAG398445984601660 %0 %40 %0 %6 %32521095
170NC_015204TCCGG39931299326150 %20 %40 %40 %6 %32521095
171NC_015204TTTGTT3102342102360190 %83.33 %16.67 %0 %10 %32521095
172NC_015204TTC4103736103747120 %66.67 %0 %33.33 %8 %32521095
173NC_015204T17103805103821170 %100 %0 %0 %5 %32521095
174NC_015204TTCTA51043281043512420 %60 %0 %20 %8 %32521095
175NC_015204AGTATT31043621043781733.33 %50 %16.67 %0 %5 %32521095
176NC_015204TATTAG41043851044072333.33 %50 %16.67 %0 %4 %32521095
177NC_015204ATTAGT31044121044281733.33 %50 %16.67 %0 %5 %32521095
178NC_015204AAGAA31048161048301580 %0 %20 %0 %0 %32521095
179NC_015204TCTA31080981081091225 %50 %0 %25 %8 %32521095
180NC_015204AAGG31082471082571150 %0 %50 %0 %9 %32521095
181NC_015204TAAAG41095191095382060 %20 %20 %0 %5 %32521095
182NC_015204GAGG31109881109991225 %0 %75 %0 %8 %32521095
183NC_015204AGGT31112001112111225 %25 %50 %0 %8 %32521095
184NC_015204TAAG31123201123301150 %25 %25 %0 %9 %32521095
185NC_015204AT61134321134421150 %50 %0 %0 %9 %32521095
186NC_015204AGAAA31142561142711680 %0 %20 %0 %6 %32521095
187NC_015204TAT41143971144081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %32521095
188NC_015204TAA41144291144391166.67 %33.33 %0 %0 %9 %32521095
189NC_015204AAAT31160511160611175 %25 %0 %0 %9 %32521095
190NC_015204ATT51170131170281633.33 %66.67 %0 %0 %6 %32521095
191NC_015204CCTAT31176361176501520 %40 %0 %40 %6 %32521095
192NC_015204AATA31176851176971375 %25 %0 %0 %7 %32521095
193NC_015204T12117708117719120 %100 %0 %0 %8 %32521095
194NC_015204TTGT3117762117773120 %75 %25 %0 %8 %32521095
195NC_015204AATA31178801178911275 %25 %0 %0 %8 %32521095
196NC_015204ATA41182981183101366.67 %33.33 %0 %0 %7 %32521095
197NC_015204T12118341118352120 %100 %0 %0 %8 %32521095
198NC_015204TTCA41188291188441625 %50 %0 %25 %6 %32521095
199NC_015204TAGTT31189891190021420 %60 %20 %0 %7 %32521095
200NC_015204TAAA31190771190921675 %25 %0 %0 %6 %32521095
201NC_015204TA81204711204851550 %50 %0 %0 %6 %32521095
202NC_015204TAGA31208121208231250 %25 %25 %0 %8 %32521095
203NC_015204TTGA31228561228671225 %50 %25 %0 %0 %32521095
204NC_015204TTTG3124099124109110 %75 %25 %0 %9 %32521095
205NC_015204TTCT3124913124924120 %75 %0 %25 %8 %32521095
206NC_015204TAA41286961287071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %32521095
207NC_015204TTA41290921291031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %32521095
208NC_015204TAAT31307211307321250 %50 %0 %0 %8 %32521095
209NC_015204CATT31308831308941225 %50 %0 %25 %0 %32521095
210NC_015204AACT31310431310531150 %25 %0 %25 %9 %32521095
211NC_015204ATTT31318591318701225 %75 %0 %0 %8 %32521095
212NC_015204AAAG31324911325021275 %0 %25 %0 %8 %32521095
213NC_015204ATTG31328871328981225 %50 %25 %0 %8 %32521095
214NC_015204T13133118133130130 %100 %0 %0 %7 %32521095
215NC_015204T17133761133777170 %100 %0 %0 %5 %32521095
216NC_015204TTC6134547134565190 %66.67 %0 %33.33 %10 %32521095
217NC_015204TA61355611355711150 %50 %0 %0 %9 %32521095
218NC_015204CTTA31366721366821125 %50 %0 %25 %9 %32521095
219NC_015204ACTTT41394681394872020 %60 %0 %20 %5 %32521095
220NC_015204CCTT3140745140755110 %50 %0 %50 %9 %32521095
221NC_015204GGAT31412891413001225 %25 %50 %0 %8 %32521095
222NC_015204TTTCT3144171144185150 %80 %0 %20 %0 %32521095
223NC_015204ACTAAT31445741445901750 %33.33 %0 %16.67 %5 %32521095
224NC_015204ACTAAT41445941446162350 %33.33 %0 %16.67 %4 %32521095
225NC_015204A1614518614520116100 %0 %0 %0 %6 %32521095
226NC_015204AATA41452341452491675 %25 %0 %0 %6 %32521095
227NC_015204GAA41452551452661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %32521095
228NC_015204ACCGG31496751496891520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
229NC_015204TTTC3149862149873120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
230NC_015204CTTTC3150542150557160 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
231NC_015204CATAC31509521509651440 %20 %0 %40 %7 %32521099
232NC_015204CTCCTT3151822151839180 %50 %0 %50 %5 %32521099
233NC_015204ATCA31535391535511350 %25 %0 %25 %7 %32521099
234NC_015204TGAT31536341536461325 %50 %25 %0 %7 %32521099
235NC_015204ACC41537431537531133.33 %0 %0 %66.67 %9 %32521099
236NC_015204TTC4154542154552110 %66.67 %0 %33.33 %9 %32521099
237NC_015204AAAG31553811553911175 %0 %25 %0 %9 %32521099
238NC_015204CGAT31558081558201325 %25 %25 %25 %7 %32521099
239NC_015204TATT31564401564511225 %75 %0 %0 %8 %32521099
240NC_015204ATC41582681582781133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
241NC_015204ATC41596641596741133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %32521096
242NC_015204GAA51601341601481566.67 %0 %33.33 %0 %6 %32521096