ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Ricinus communis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015141	TC	6	2679	2690	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015141	AT	6	13502	13512	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
3	NC_015141	AG	6	21092	21102	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
4	NC_015141	CT	6	30468	30479	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
5	NC_015141	AT	6	46823	46834	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
6	NC_015141	TA	6	49255	49266	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
7	NC_015141	CT	6	49926	49936	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364987
8	NC_015141	CT	8	60268	60282	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	32364987
9	NC_015141	TA	6	60696	60707	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
10	NC_015141	AT	6	60913	60926	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
11	NC_015141	GA	6	63774	63785	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
12	NC_015141	TC	6	68134	68144	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364987
13	NC_015141	GA	6	69344	69355	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
14	NC_015141	AT	6	70885	70896	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
15	NC_015141	CT	6	72213	72224	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
16	NC_015141	CG	6	96276	96287	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	32364987
17	NC_015141	TA	6	104741	104753	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
18	NC_015141	TC	6	115981	115992	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
19	NC_015141	CT	8	119273	119288	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	32364987
20	NC_015141	TA	6	119320	119330	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
21	NC_015141	TA	6	119640	119650	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
22	NC_015141	GA	6	131603	131613	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
23	NC_015141	AT	6	133428	133439	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
24	NC_015141	CT	6	134802	134812	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364987
25	NC_015141	AG	7	138696	138709	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32364987
26	NC_015141	TA	6	149865	149876	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
27	NC_015141	TC	6	151641	151652	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
28	NC_015141	AG	6	151873	151883	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
29	NC_015141	AT	7	155147	155160	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
30	NC_015141	GT	6	155625	155635	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	32364987
31	NC_015141	TC	7	202389	202402	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	32364988
32	NC_015141	TC	6	214093	214103	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364988
33	NC_015141	TC	7	217429	217442	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	32364988
34	NC_015141	TC	7	217557	217569	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	32364988
35	NC_015141	AC	6	222931	222941	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	32364988
36	NC_015141	AG	7	235237	235249	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32364988
37	NC_015141	TC	7	243765	243778	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	32364988
38	NC_015141	TC	6	258206	258216	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364988
39	NC_015141	AT	13	259746	259771	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364988
40	NC_015141	TA	6	261212	261222	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
41	NC_015141	AT	7	265034	265047	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
42	NC_015141	AG	6	269083	269094	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
43	NC_015141	TA	6	272206	272216	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
44	NC_015141	AG	6	274432	274444	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32364987
45	NC_015141	AG	7	286581	286594	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32364987
46	NC_015141	TA	7	295920	295933	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
47	NC_015141	TA	6	300230	300240	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
48	NC_015141	CT	6	306094	306104	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364987
49	NC_015141	AG	6	313348	313358	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
50	NC_015141	AG	6	319749	319759	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
51	NC_015141	TA	7	336422	336434	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
52	NC_015141	AG	6	340391	340401	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
53	NC_015141	CT	7	355080	355092	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	32364987
54	NC_015141	AT	7	355269	355282	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
55	NC_015141	CT	8	365045	365059	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	32364987
56	NC_015141	AT	6	367056	367066	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
57	NC_015141	GA	6	371636	371647	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
58	NC_015141	AG	6	372461	372472	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
59	NC_015141	TA	7	376980	376992	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
60	NC_015141	AT	7	378690	378702	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
61	NC_015141	AG	6	386081	386091	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
62	NC_015141	TA	6	403907	403917	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
63	NC_015141	CA	7	404192	404204	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	32364987
64	NC_015141	GA	6	404230	404241	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
65	NC_015141	CT	7	414394	414407	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	32364987
66	NC_015141	CT	6	428675	428686	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
67	NC_015141	AG	6	445114	445124	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
68	NC_015141	CT	6	445913	445924	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
69	NC_015141	AT	9	455087	455103	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	32364987
70	NC_015141	TA	7	466506	466520	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	32364987
71	NC_015141	TC	6	470743	470754	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
72	NC_015141	GA	6	475498	475509	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
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74	NC_015141	AG	6	477584	477595	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
75	NC_015141	GA	6	494449	494460	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015141	CT	6	495984	495995	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
77	NC_015141	AT	6	502239	502249	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Ricinus communis mitochondrion