ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Ricinus communis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015141	ATTA	3	1223	1234	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015141	ATTA	3	1301	1311	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015141	TCTT	3	2069	2080	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015141	AGGG	3	4305	4316	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015141	GATG	3	4833	4844	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015141	GGAT	3	5520	5530	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_015141	GGCG	4	8589	8603	15	0 %	0 %	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
8	NC_015141	TCTT	3	9036	9047	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015141	AAAG	3	13298	13309	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364987
10	NC_015141	CTAA	3	14603	14614	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	32364987
11	NC_015141	GAAA	3	16063	16073	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364987
12	NC_015141	ATTC	3	17691	17701	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	32364987
13	NC_015141	AGAT	3	18395	18406	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32364987
14	NC_015141	TACT	3	19625	19637	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	32364987
15	NC_015141	TTCT	3	21488	21499	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	32364987
16	NC_015141	TACT	3	25557	25568	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	32364987
17	NC_015141	TTAG	3	28578	28589	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	32364987
18	NC_015141	TGTC	4	30437	30453	17	0 %	50 %	25 %	25 %	5 %	32364987
19	NC_015141	GATT	3	30838	30849	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	32364987
20	NC_015141	TTCC	3	32154	32165	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
21	NC_015141	GACT	3	32422	32434	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	32364987
22	NC_015141	GTAA	3	33598	33610	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	32364987
23	NC_015141	CTTT	3	34108	34119	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
24	NC_015141	AAAG	3	39597	39608	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364987
25	NC_015141	GATA	3	39940	39951	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32364987
26	NC_015141	CTAT	3	40046	40058	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	32364987
27	NC_015141	CCAA	3	44051	44062	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	32364987
28	NC_015141	GTCA	3	49017	49029	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	32364987
29	NC_015141	ATTC	3	51110	51121	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32364987
30	NC_015141	TGAA	3	52599	52609	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32364987
31	NC_015141	TTTC	3	60500	60511	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
32	NC_015141	GGCA	4	63797	63811	15	25 %	0 %	50 %	25 %	6 %	32364987
33	NC_015141	AGCA	3	64730	64741	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	32364987
34	NC_015141	ATGA	3	65131	65142	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32364987
35	NC_015141	CCGG	3	65417	65427	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	32364987
36	NC_015141	AATC	3	67311	67321	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	32364987
37	NC_015141	TTCT	3	69491	69502	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
38	NC_015141	TCTT	3	69951	69962	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
39	NC_015141	GATA	3	70193	70204	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32364987
40	NC_015141	TTGG	3	70797	70807	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	32364987
41	NC_015141	GAAT	3	73020	73031	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32364987
42	NC_015141	AGGA	3	73578	73589	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
43	NC_015141	AGGA	3	75583	75593	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
44	NC_015141	AAGC	3	76104	76115	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	32364987
45	NC_015141	AAAT	3	77659	77670	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32364987
46	NC_015141	AAAG	3	78790	78800	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364987
47	NC_015141	CTTA	3	79150	79161	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	32364987
48	NC_015141	AATA	3	82225	82236	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32364987
49	NC_015141	CTTT	3	82983	82994	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
50	NC_015141	TGAC	6	84909	84932	24	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32364987
51	NC_015141	GAAG	3	86095	86106	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	32364987
52	NC_015141	GCCA	3	91650	91660	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	32364987
53	NC_015141	AGAA	3	97606	97617	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364987
54	NC_015141	CTTT	3	98059	98070	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	32364987
55	NC_015141	TGAG	3	98208	98218	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	32364987
56	NC_015141	CTTG	3	107294	107306	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	32364987
57	NC_015141	TTGC	4	107317	107332	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	32364987
58	NC_015141	ACCT	3	107348	107359	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	32364987
59	NC_015141	AAAT	3	108031	108041	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32364987
60	NC_015141	GCCG	3	109654	109666	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	32364987
61	NC_015141	TCCC	3	110111	110122	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	32364987
62	NC_015141	TGAA	3	117450	117461	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32364987
63	NC_015141	AATT	3	121240	121252	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
64	NC_015141	CTTG	3	122051	122062	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	32364987
65	NC_015141	TCTA	3	122628	122638	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	32364987
66	NC_015141	CTTT	3	123277	123288	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
67	NC_015141	CTTT	3	123838	123848	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32364987
68	NC_015141	ACTC	3	124487	124498	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	32364987
69	NC_015141	AAGA	3	126988	126999	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364987
70	NC_015141	TCAA	3	128583	128593	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	32364987
71	NC_015141	AGAA	3	131688	131699	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364987
72	NC_015141	CTTT	3	132307	132318	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
73	NC_015141	AAAG	3	132611	132621	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364987
74	NC_015141	AGGC	3	134691	134702	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	32364987
75	NC_015141	ACTA	3	135925	135936	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	32364987
76	NC_015141	ACCC	3	137794	137804	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	32364987
77	NC_015141	GGAG	3	139021	139031	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	32364987
78	NC_015141	TCTT	4	142437	142452	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	32364987
79	NC_015141	AAGA	3	142738	142748	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364987
80	NC_015141	ACAA	3	147925	147935	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	32364987
81	NC_015141	CCAA	3	148523	148534	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	32364987
82	NC_015141	CACC	3	150566	150577	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	32364987
83	NC_015141	GTTA	3	152374	152384	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	32364987
84	NC_015141	AAAG	3	154360	154370	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364987
85	NC_015141	TCTT	3	161568	161579	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	32364988
86	NC_015141	AGCA	3	166096	166107	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	32364988
87	NC_015141	AGAA	4	171003	171018	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	32364988
88	NC_015141	TCAA	3	171106	171117	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	32364988
89	NC_015141	TAGA	4	171442	171457	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	32364988
90	NC_015141	CTTG	3	172343	172354	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	32364988
91	NC_015141	GCCG	4	173263	173277	15	0 %	0 %	50 %	50 %	6 %	32364988
92	NC_015141	TGAA	3	175116	175128	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	32364988
93	NC_015141	TTTC	3	175900	175911	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364988
94	NC_015141	TTGG	3	176277	176288	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	32364988
95	NC_015141	TGGG	3	177278	177288	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	32364988
96	NC_015141	ATGA	3	179324	179335	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32364988
97	NC_015141	CCCG	3	179899	179909	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	32364988
98	NC_015141	GCCC	3	180667	180677	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	32364988
99	NC_015141	GAAT	3	184470	184480	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32364988
100	NC_015141	AAGA	3	185079	185090	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	32364988
101	NC_015141	GATC	3	185197	185208	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32364988
102	NC_015141	AAAG	3	186551	186561	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364988
103	NC_015141	TCCT	3	193929	193940	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364988
104	NC_015141	CAGT	3	196502	196513	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32364988
105	NC_015141	CTTT	3	197572	197583	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364988
106	NC_015141	GAAA	4	198206	198221	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	32364988
107	NC_015141	AGAA	4	198664	198678	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	32364988
108	NC_015141	AAAG	3	200927	200938	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364988
109	NC_015141	TATT	3	202347	202357	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32364988
110	NC_015141	AATG	3	202878	202888	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32364988
111	NC_015141	GAGT	3	205869	205880	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	32364988
112	NC_015141	AGTC	3	206044	206055	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32364988
113	NC_015141	TCAG	3	207575	207586	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32364988
114	NC_015141	TTCT	3	211768	211779	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364988
115	NC_015141	TAGC	4	214582	214597	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	32364988
116	NC_015141	TCTT	3	220091	220101	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32364988
117	NC_015141	TTAT	4	222244	222258	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	32364988
118	NC_015141	TTCC	3	225679	225689	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364988
119	NC_015141	AAAG	4	226758	226773	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	32364988
120	NC_015141	AGTC	3	227426	227436	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	32364988
121	NC_015141	TTCT	3	230103	230115	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	32364988
122	NC_015141	GGGT	3	230798	230808	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	32364988
123	NC_015141	AGAA	3	235467	235478	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	32364988
124	NC_015141	GGTT	3	236116	236127	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	32364988
125	NC_015141	CTTT	3	238555	238566	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364988
126	NC_015141	CTTG	3	238615	238625	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	32364988
127	NC_015141	ACTT	3	243216	243227	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32364988
128	NC_015141	ATGA	3	243512	243523	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32364988
129	NC_015141	AACC	3	243794	243805	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	32364988
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131	NC_015141	AAAG	3	246848	246858	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364988
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258	NC_015141	CAAA	3	501623	501633	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
259	NC_015141	TTCT	3	502505	502515	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Ricinus communis mitochondrion