ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ricinus communis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015141	ATTA	3	1223	1234	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015141	ATTA	3	1301	1311	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015141	TCTT	3	2069	2080	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015141	TC	6	2679	2690	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015141	ATTCT	3	3695	3708	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
6	NC_015141	GAA	4	4064	4075	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015141	AGGG	3	4305	4316	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015141	GATG	3	4833	4844	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_015141	TCT	4	4864	4875	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015141	T	15	4945	4959	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_015141	TCG	4	5075	5086	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015141	AGG	4	5419	5430	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015141	GGAT	3	5520	5530	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_015141	TGC	4	5644	5655	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015141	AAC	4	7154	7164	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015141	GAC	4	7528	7539	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015141	GGT	4	7583	7593	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015141	CCTAA	3	8270	8285	16	40 %	20 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
19	NC_015141	TTA	4	8537	8548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015141	GGCG	4	8589	8603	15	0 %	0 %	75 %	25 %	6 %	Non-Coding
21	NC_015141	TCTT	3	9036	9047	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015141	GCA	5	9527	9540	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_015141	GAA	4	10178	10189	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015141	TTC	4	10880	10891	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015141	TAA	4	12171	12182	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015141	GAT	5	12412	12425	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_015141	GCC	4	12624	12635	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015141	AAAG	3	13298	13309	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364987
29	NC_015141	AT	6	13502	13512	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32364987
30	NC_015141	CTAA	3	14603	14614	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	32364987
31	NC_015141	AAG	5	15513	15528	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	32364987
32	NC_015141	GAAA	3	16063	16073	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364987
33	NC_015141	GAA	4	16487	16498	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32364987
34	NC_015141	ATTC	3	17691	17701	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	32364987
35	NC_015141	AGC	4	17860	17871	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32364987
36	NC_015141	AGAT	3	18395	18406	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32364987
37	NC_015141	TACT	3	19625	19637	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	32364987
38	NC_015141	AG	6	21092	21102	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
39	NC_015141	TCT	5	21463	21476	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	32364987
40	NC_015141	TTCT	3	21488	21499	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	32364987
41	NC_015141	AAG	4	22032	22044	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	32364987
42	NC_015141	TCT	4	22671	22681	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32364987
43	NC_015141	TCT	4	24999	25009	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32364987
44	NC_015141	TACT	3	25557	25568	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	32364987
45	NC_015141	CTT	5	27582	27595	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	32364987
46	NC_015141	TTAG	3	28578	28589	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	32364987
47	NC_015141	TGTC	4	30437	30453	17	0 %	50 %	25 %	25 %	5 %	32364987
48	NC_015141	CT	6	30468	30479	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
49	NC_015141	GATT	3	30838	30849	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	32364987
50	NC_015141	TTCC	3	32154	32165	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
51	NC_015141	GACT	3	32422	32434	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	32364987
52	NC_015141	GTAA	3	33598	33610	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	32364987
53	NC_015141	CTTT	3	34108	34119	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
54	NC_015141	TCT	4	34163	34173	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32364987
55	NC_015141	TAA	4	35645	35656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	32364987
56	NC_015141	CTT	4	36464	36475	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32364987
57	NC_015141	CGC	4	37066	37076	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	32364987
58	NC_015141	GAT	4	37964	37975	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32364987
59	NC_015141	AGA	4	38070	38081	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32364987
60	NC_015141	AAAG	3	39597	39608	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364987
61	NC_015141	AGA	4	39659	39671	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	32364987
62	NC_015141	GATA	3	39940	39951	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32364987
63	NC_015141	CTAT	3	40046	40058	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	32364987
64	NC_015141	CCAA	3	44051	44062	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	32364987
65	NC_015141	AT	6	46823	46834	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
66	NC_015141	TTC	4	46870	46881	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32364987
67	NC_015141	GTCA	3	49017	49029	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	32364987
68	NC_015141	TA	6	49255	49266	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
69	NC_015141	CT	6	49926	49936	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364987
70	NC_015141	ATTC	3	51110	51121	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32364987
71	NC_015141	TCT	4	52512	52524	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	32364987
72	NC_015141	TGAA	3	52599	52609	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32364987
73	NC_015141	GTT	4	53911	53922	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32364987
74	NC_015141	GAA	4	58728	58739	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32364987
75	NC_015141	CT	8	60268	60282	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	32364987
76	NC_015141	TTTC	3	60500	60511	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
77	NC_015141	TA	6	60696	60707	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
78	NC_015141	AT	6	60913	60926	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
79	NC_015141	GA	6	63774	63785	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
80	NC_015141	GGCA	4	63797	63811	15	25 %	0 %	50 %	25 %	6 %	32364987
81	NC_015141	AGCA	3	64730	64741	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	32364987
82	NC_015141	ATGA	3	65131	65142	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32364987
83	NC_015141	CCGG	3	65417	65427	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	32364987
84	NC_015141	CAG	4	65531	65542	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32364987
85	NC_015141	GAT	4	66171	66181	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32364987
86	NC_015141	AATC	3	67311	67321	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	32364987
87	NC_015141	CCT	4	67835	67845	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	32364987
88	NC_015141	TC	6	68134	68144	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32364987
89	NC_015141	GCT	4	68565	68577	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	32364987
90	NC_015141	G	15	68857	68871	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	32364987
91	NC_015141	GA	6	69344	69355	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
92	NC_015141	TTCT	3	69491	69502	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
93	NC_015141	TCTT	3	69951	69962	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
94	NC_015141	GATA	3	70193	70204	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32364987
95	NC_015141	TTGG	3	70797	70807	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	32364987
96	NC_015141	AT	6	70885	70896	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32364987
97	NC_015141	A	17	71783	71799	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	32364987
98	NC_015141	CT	6	72213	72224	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32364987
99	NC_015141	AGA	4	72290	72300	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	32364987
100	NC_015141	GAAT	3	73020	73031	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32364987
101	NC_015141	AGGA	3	73578	73589	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32364987
102	NC_015141	CCTGT	3	74208	74221	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	32364987
103	NC_015141	AGGA	3	75583	75593	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32364987
104	NC_015141	AAGC	3	76104	76115	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	32364987
105	NC_015141	AAAT	3	77659	77670	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32364987
106	NC_015141	AAAGTG	3	78553	78569	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	32364987
107	NC_015141	AAAG	3	78790	78800	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32364987
108	NC_015141	TCA	4	79121	79132	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32364987
109	NC_015141	CTTA	3	79150	79161	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	32364987
110	NC_015141	T	13	80936	80948	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	32364987
111	NC_015141	GTCGG	3	81611	81626	16	0 %	20 %	60 %	20 %	6 %	32364987
112	NC_015141	AATA	3	82225	82236	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32364987
113	NC_015141	TAT	4	82553	82564	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32364987
114	NC_015141	CTTT	3	82983	82994	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32364987
115	NC_015141	TGAC	6	84909	84932	24	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32364987
116	NC_015141	GAAG	3	86095	86106	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	32364987
117	NC_015141	TAA	4	87541	87552	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32364987
118	NC_015141	GAT	4	89053	89063	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32364987
119	NC_015141	GCCA	3	91650	91660	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	32364987
120	NC_015141	CG	6	96276	96287	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	32364987
121	NC_015141	CAG	4	96478	96489	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32364987
122	NC_015141	AGAA	3	97606	97617	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32364987
123	NC_015141	CTTT	3	98059	98070	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	32364987
124	NC_015141	TCA	4	98131	98142	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32364987
125	NC_015141	TGAG	3	98208	98218	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	32364987
126	NC_015141	GAA	4	98590	98601	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32364987
127	NC_015141	CTC	4	98776	98787	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	32364987
128	NC_015141	TGT	5	99031	99044	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	32364987
129	NC_015141	TCT	4	100097	100107	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32364987
130	NC_015141	TA	6	104741	104753	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32364987
131	NC_015141	CTG	4	104844	104855	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32364987
132	NC_015141	T	13	105101	105113	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
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159	NC_015141	CTTT	3	123838	123848	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32364987
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252	NC_015141	AATG	3	202878	202888	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32364988
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502	NC_015141	TCT	4	414759	414769	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32364987
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610	NC_015141	TAA	4	495618	495629	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
611	NC_015141	CT	6	495984	495995	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
612	NC_015141	CTA	4	497422	497432	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
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614	NC_015141	AAG	4	498473	498484	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
615	NC_015141	GATC	3	499524	499534	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
616	NC_015141	CAAA	3	501623	501633	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
617	NC_015141	AGC	4	501765	501776	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
618	NC_015141	AT	6	502239	502249	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
619	NC_015141	TTCT	3	502505	502515	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ricinus communis mitochondrion