ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica rapa subsp. pekinensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015139	CTA	4	79	89	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015139	TCT	4	658	668	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015139	CAG	4	922	933	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015139	TAA	4	4796	4807	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015139	TTC	4	6409	6419	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_015139	TCA	4	7617	7627	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_015139	AAT	4	12664	12675	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015139	GAT	4	14859	14871	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_015139	AAT	4	16540	16551	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015139	GTT	4	22678	22689	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015139	TCA	4	25032	25042	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015139	TAT	4	26505	26516	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015139	AAT	4	29331	29342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015139	TAA	6	30879	30897	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_015139	AAT	4	30953	30964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_015139	TAT	4	31478	31488	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_015139	TAT	4	35451	35462	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015139	GAT	4	37887	37897	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_015139	GCA	4	39786	39797	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015139	ATG	4	40112	40122	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015139	AGA	4	43301	43313	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_015139	ATT	4	45759	45770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015139	TTA	4	50134	50145	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_015139	TAT	4	53531	53542	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_015139	TTG	4	53762	53772	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015139	TTA	4	62375	62386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_015139	ATA	4	63885	63896	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015139	TAA	6	70178	70194	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_015139	TTA	4	71063	71074	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015139	GGA	4	74700	74711	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015139	TCT	4	77267	77277	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_015139	GAT	4	83969	83979	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015139	AGA	4	89114	89124	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_015139	AAT	4	94457	94467	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_015139	TTC	4	98249	98260	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_015139	TCT	4	110248	110258	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_015139	AAG	4	110850	110861	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015139	TAT	4	112183	112194	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_015139	TAA	4	113059	113071	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_015139	AAT	4	125006	125017	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015139	TCT	4	126592	126602	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_015139	GAA	4	138504	138515	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_015139	AGA	4	148100	148111	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_015139	ATC	4	152785	152795	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica rapa subsp. pekinensis chloroplast