ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica rapa subsp. pekinensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015139	TA	6	188	198	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015139	AT	9	3758	3775	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_015139	TA	6	4563	4573	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_015139	TA	7	6275	6288	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_015139	CA	6	6339	6349	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_015139	TA	6	7848	7859	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015139	TA	6	7879	7889	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_015139	AT	6	7972	7982	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_015139	AT	6	9405	9416	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_015139	TA	6	9443	9453	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015139	TA	9	9567	9583	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_015139	AT	6	13371	13384	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_015139	TA	6	26537	26548	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015139	TC	6	27814	27825	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015139	AT	7	30661	30676	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_015139	AG	6	34500	34510	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_015139	TA	7	35428	35441	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_015139	AT	13	35466	35491	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_015139	TG	6	39823	39833	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_015139	AT	6	45140	45151	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015139	TA	6	56053	56063	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_015139	AT	6	57958	57968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015139	AT	6	60608	60618	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015139	TA	6	62031	62041	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_015139	TA	6	65813	65823	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015139	AT	6	70623	70633	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015139	TA	6	93621	93633	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015139	AT	6	107613	107626	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_015139	TA	8	111758	111773	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_015139	AT	6	112764	112774	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_015139	AT	8	117333	117347	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_015139	TA	6	118275	118285	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015139	AT	6	120457	120467	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_015139	TA	6	123403	123413	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_015139	AT	6	129142	129153	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_015139	AT	6	143133	143144	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica rapa subsp. pekinensis chloroplast