ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna radiata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015121	CT	6	23652	23662	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314904
2	NC_015121	CT	6	24632	24643	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32314904
3	NC_015121	TC	6	30794	30805	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32314904
4	NC_015121	CT	6	33102	33112	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314904
5	NC_015121	GA	7	36215	36227	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32314904
6	NC_015121	TA	12	41002	41026	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32314904
7	NC_015121	AG	6	43066	43076	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314904
8	NC_015121	TC	6	44276	44286	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314904
9	NC_015121	AG	6	45992	46002	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314904
10	NC_015121	GA	7	47302	47315	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32314904
11	NC_015121	CT	6	68023	68033	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314904
12	NC_015121	TA	7	68797	68810	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32314904
13	NC_015121	AG	6	71377	71387	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314904
14	NC_015121	TA	6	83127	83137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314904
15	NC_015121	TA	6	86327	86337	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314904
16	NC_015121	AT	6	92964	92974	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314904
17	NC_015121	GA	7	95350	95362	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32314904
18	NC_015121	GA	8	95436	95450	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	32314904
19	NC_015121	AC	6	103044	103054	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	32314904
20	NC_015121	GA	7	107593	107605	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32314904
21	NC_015121	AG	6	108017	108028	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32314904
22	NC_015121	AG	6	111229	111240	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32314904
23	NC_015121	CT	6	130099	130109	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314903
24	NC_015121	GT	6	130604	130614	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	32314903
25	NC_015121	TA	7	144762	144774	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32314903
26	NC_015121	TC	6	155973	155983	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314903
27	NC_015121	GA	6	167485	167495	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314903
28	NC_015121	TC	6	168026	168036	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314903
29	NC_015121	CA	6	174494	174505	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	32314903
30	NC_015121	TC	6	177662	177673	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32314903
31	NC_015121	TA	6	179916	179926	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314903
32	NC_015121	GA	6	185120	185130	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314903
33	NC_015121	TA	7	192105	192118	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32314903
34	NC_015121	AG	6	199298	199308	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314903
35	NC_015121	TA	6	240749	240759	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314903
36	NC_015121	CT	6	241123	241134	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32314903
37	NC_015121	AG	6	251361	251371	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314903
38	NC_015121	AT	6	255818	255828	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314903
39	NC_015121	AG	6	259015	259025	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314903
40	NC_015121	TA	6	260078	260088	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314903
41	NC_015121	AG	6	272505	272515	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314903
42	NC_015121	AT	6	276802	276813	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32314903
43	NC_015121	TC	6	289119	289130	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32314903
44	NC_015121	CT	6	297938	297948	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314903
45	NC_015121	TC	6	300655	300665	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32314903
46	NC_015121	TA	7	305944	305956	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32314903
47	NC_015121	TA	7	316213	316225	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32314903
48	NC_015121	AG	6	321943	321954	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32314903
49	NC_015121	AT	6	330737	330747	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_015121	AT	6	335533	335543	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_015121	TC	6	341021	341031	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_015121	AT	6	349335	349345	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314904
53	NC_015121	GA	6	359125	359136	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_015121	TA	6	363969	363979	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_015121	CT	6	364633	364643	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
56	NC_015121	TA	7	370797	370809	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_015121	TA	6	385407	385417	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_015121	AT	6	399502	399513	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32314906

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna radiata mitochondrion