ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Glaucocystis nostochinearum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015117	ATTT	3	3056	3066	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015117	ATT	5	3739	3752	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32339865
3	NC_015117	ATT	4	3771	3781	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32339865
4	NC_015117	TAAA	3	4097	4107	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32339865
5	NC_015117	TTA	5	4796	4810	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32339865
6	NC_015117	TAT	5	5040	5054	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32339865
7	NC_015117	T	12	5858	5869	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	32339865
8	NC_015117	TTTA	3	6195	6205	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32339865
9	NC_015117	TAT	4	6220	6231	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32339865
10	NC_015117	TTTA	3	7132	7143	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32339865
11	NC_015117	ATT	4	7208	7218	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32339865
12	NC_015117	TAAAAA	3	8978	8996	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	32339865
13	NC_015117	A	12	9273	9284	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	32339865
14	NC_015117	T	14	9675	9688	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	32339865
15	NC_015117	T	16	9713	9728	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	32339865
16	NC_015117	GGTA	3	10235	10245	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	32339866
17	NC_015117	AATATA	3	11524	11541	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32339866
18	NC_015117	AAAT	3	11739	11750	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32339866
19	NC_015117	TAAA	3	12098	12109	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32339866
20	NC_015117	ATA	4	12728	12738	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32339866
21	NC_015117	ATTA	3	13408	13418	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_015117	TTAA	3	13701	13712	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32339866
23	NC_015117	TTTA	3	13721	13733	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	32339866
24	NC_015117	T	13	13762	13774	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	32339866
25	NC_015117	TAT	4	14077	14087	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32339866
26	NC_015117	TA	6	14472	14482	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32339866
27	NC_015117	TTA	4	14817	14828	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32339866
28	NC_015117	A	13	14842	14854	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	32339866
29	NC_015117	AAT	4	14916	14927	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32339866
30	NC_015117	A	12	16079	16090	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	32339866
31	NC_015117	AAAT	3	16200	16210	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32339866
32	NC_015117	TTA	4	16299	16310	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32339866
33	NC_015117	ATT	4	16751	16762	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32339866
34	NC_015117	TAT	4	16785	16795	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32339866
35	NC_015117	TTCT	3	16960	16970	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_015117	AATA	3	16983	16993	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_015117	T	12	17136	17147	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	32339866
38	NC_015117	TAAA	3	17693	17704	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32339866
39	NC_015117	TTCA	3	17742	17753	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32339866
40	NC_015117	ATAA	5	18036	18055	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	32339866
41	NC_015117	AAAT	3	18106	18118	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_015117	ATA	4	18587	18598	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32339866
43	NC_015117	AAAT	3	18599	18609	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32339866
44	NC_015117	TTAAA	3	19032	19046	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	32339867
45	NC_015117	TTA	4	19365	19376	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32339867
46	NC_015117	TGT	4	19568	19579	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32339867
47	NC_015117	TAAA	3	19581	19591	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32339867
48	NC_015117	AATC	3	20316	20326	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	32339867
49	NC_015117	TAA	5	21102	21116	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32339867
50	NC_015117	TAA	6	22055	22072	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32339867
51	NC_015117	TAAA	4	22804	22819	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	32339867
52	NC_015117	TAAA	3	22906	22916	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32339867
53	NC_015117	ATTC	4	23091	23106	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	32339867
54	NC_015117	TTTA	3	24279	24289	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_015117	TAAA	3	24330	24340	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_015117	A	16	25163	25178	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	32339867
57	NC_015117	ACAA	3	25250	25260	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	32339867
58	NC_015117	AAAAT	3	25422	25435	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	32339867
59	NC_015117	TAA	4	25692	25702	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32339867
60	NC_015117	AAAAT	3	25735	25749	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	32339867
61	NC_015117	AAAT	3	25910	25920	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32339867
62	NC_015117	ATTTTT	3	26339	26356	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	32339867
63	NC_015117	TCTA	3	26956	26966	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	32339867
64	NC_015117	AATA	3	27295	27310	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	32339867
65	NC_015117	ATT	4	27969	27979	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_015117	TAT	4	28540	28550	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32339868
67	NC_015117	TTTA	3	28589	28599	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32339868
68	NC_015117	TTTA	3	28640	28650	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32339868
69	NC_015117	TTTAA	3	28712	28726	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	32339868
70	NC_015117	TTTTAT	3	29081	29099	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	32339868
71	NC_015117	TAA	4	29291	29301	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32339868
72	NC_015117	AAAT	3	29883	29895	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	32339868
73	NC_015117	ATT	4	30133	30145	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_015117	ATT	5	30318	30332	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32339868
75	NC_015117	AATAA	3	30956	30969	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_015117	TA	6	31258	31268	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32339868
77	NC_015117	TATT	3	31340	31351	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32339868
78	NC_015117	GTTGG	3	31674	31687	14	0 %	40 %	60 %	0 %	7 %	32339868
79	NC_015117	TTTTA	3	32055	32068	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	32339868
80	NC_015117	ATTT	3	32202	32212	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32339868
81	NC_015117	TATT	3	32226	32236	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32339868
82	NC_015117	ATTA	3	33042	33053	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015117	ATTT	3	33219	33229	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_015117	TTTG	3	33981	33992	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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