ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Beta vulgaris subsp. maritima mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015099	AGAAAG	3	166	183	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_015099	TA	7	518	530	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_015099	AAAG	3	3451	3461	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_015099	AAGA	3	4356	4367	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015099	TAA	4	7826	7837	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015099	CA	7	7892	7904	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
7	NC_015099	TCT	4	8290	8301	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32343502
8	NC_015099	TTTG	3	8315	8327	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	32343502
9	NC_015099	TCT	4	9138	9148	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32343502
10	NC_015099	GTG	4	10046	10057	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015099	TGAT	3	10373	10383	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015099	CTTT	3	10628	10639	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015099	TTTC	3	11097	11108	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015099	TCT	4	11177	11188	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_015099	CT	6	11546	11556	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015099	ATA	4	11664	11675	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015099	CTTT	3	12982	12993	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015099	TTAC	5	14102	14121	20	25 %	50 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
19	NC_015099	TCT	4	14970	14981	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015099	GA	6	15570	15580	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015099	TCGA	3	15701	15712	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015099	TC	6	15734	15744	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_015099	GCAA	3	15905	15915	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015099	CTTG	4	16055	16070	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
25	NC_015099	GAAA	3	16126	16136	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_015099	CTTT	3	16566	16577	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32343502
27	NC_015099	AG	6	18988	19000	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015099	GA	6	19206	19216	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015099	TAAG	3	19758	19769	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015099	CACT	3	20825	20835	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	32343503
31	NC_015099	CTT	4	22233	22244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015099	TCTG	3	22699	22710	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015099	CCTT	3	23091	23102	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
34	NC_015099	TACT	3	25798	25809	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_015099	CAAG	3	26082	26093	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_015099	TCTA	3	27777	27787	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_015099	CCAA	3	27886	27897	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015099	TTTC	3	29847	29857	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343503
39	NC_015099	TGGC	3	32228	32238	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	32343503
40	NC_015099	TA	9	33077	33093	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	32343503
41	NC_015099	AAAC	3	33200	33211	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	32343503
42	NC_015099	GA	7	33549	33561	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32343503
43	NC_015099	CAAG	3	34017	34028	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_015099	AT	6	34135	34145	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_015099	TGTA	3	34195	34205	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_015099	TTCC	3	34263	34273	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_015099	CAGT	3	34800	34811	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_015099	AAGA	3	35669	35680	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015099	CTC	5	37832	37847	16	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
50	NC_015099	ACC	5	38570	38584	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
51	NC_015099	TAAC	3	39000	39011	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_015099	CT	6	40024	40034	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_015099	AGA	4	40428	40438	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_015099	CAAC	3	40795	40806	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
55	NC_015099	AGCG	3	40935	40945	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
56	NC_015099	CCTTT	3	41000	41014	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
57	NC_015099	AAGAG	3	42438	42451	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_015099	A	12	44251	44262	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_015099	TCTT	3	44360	44370	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_015099	GAA	4	44691	44702	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_015099	CAT	4	44841	44851	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_015099	TCTTCC	3	44985	45003	19	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
63	NC_015099	TTCT	3	45057	45068	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_015099	ACTC	3	45614	45624	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_015099	TCT	4	46365	46376	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32343503
66	NC_015099	GTA	4	47040	47050	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32343504
67	NC_015099	TTG	4	47301	47312	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32343504
68	NC_015099	AAGT	3	48314	48325	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32343504
69	NC_015099	GAA	4	48981	48991	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_015099	TCGC	3	49007	49018	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015099	TCT	4	53858	53868	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32343502
72	NC_015099	AT	7	53886	53899	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32343502
73	NC_015099	AGA	4	56195	56205	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	32343502
74	NC_015099	CTAGT	3	57691	57705	15	20 %	40 %	20 %	20 %	0 %	32343502
75	NC_015099	CTTT	3	58981	58992	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32343502
76	NC_015099	AAGG	3	59554	59566	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32343502
77	NC_015099	TTGA	3	60751	60762	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	32343502
78	NC_015099	TTTTC	3	61644	61657	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	32343502
79	NC_015099	TTGT	3	61686	61697	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	32343502
80	NC_015099	GTA	4	61747	61757	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32343502
81	NC_015099	TGGC	3	63128	63139	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	32343502
82	NC_015099	AGA	4	63459	63470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32343502
83	NC_015099	T	14	64828	64841	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	32343502
84	NC_015099	CCTTC	3	65411	65425	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	32343502
85	NC_015099	TACT	3	65549	65560	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
86	NC_015099	TTC	4	67248	67259	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32343502
87	NC_015099	AG	6	68883	68893	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32343502
88	NC_015099	TGAA	3	69099	69109	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32343502
89	NC_015099	TAAG	3	69301	69312	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32343502
90	NC_015099	AG	6	70065	70075	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32343502
91	NC_015099	AAGT	3	70904	70915	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32343502
92	NC_015099	T	12	70939	70950	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	32343502
93	NC_015099	GAT	4	71085	71095	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32343502
94	NC_015099	AT	6	72292	72302	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32343502
95	NC_015099	GAT	4	72385	72395	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32343502
96	NC_015099	CATTT	3	73020	73034	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	32343502
97	NC_015099	AGA	4	73399	73410	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	32343502
98	NC_015099	AAGG	3	73515	73527	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32343502
99	NC_015099	CTT	4	74191	74201	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32343502
100	NC_015099	AGTA	3	74511	74523	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	32343502
101	NC_015099	GCAA	3	78475	78485	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	32343502
102	NC_015099	ATA	4	79431	79442	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32343502
103	NC_015099	GAAGA	4	79763	79783	21	60 %	0 %	40 %	0 %	9 %	32343502
104	NC_015099	CTA	4	80365	80375	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32343502
105	NC_015099	AGCA	3	80550	80561	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	32343502
106	NC_015099	AT	6	81398	81408	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32343502
107	NC_015099	TGAAG	3	81598	81612	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	32343502
108	NC_015099	CAT	4	84550	84560	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32343502
109	NC_015099	CTTC	4	86555	86569	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	32343502
110	NC_015099	AATG	3	86692	86703	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32343502
111	NC_015099	ACC	4	86763	86775	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	32343502
112	NC_015099	GAT	4	87724	87734	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32343502
113	NC_015099	AGA	4	88096	88107	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32343502
114	NC_015099	ACTT	3	88558	88569	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
115	NC_015099	CCTT	3	88775	88785	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32343502
116	NC_015099	TCGA	3	88990	89001	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32343502
117	NC_015099	TTTC	3	89425	89435	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343502
118	NC_015099	GCT	4	89929	89940	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	32343502
119	NC_015099	GCC	4	90753	90763	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	32343502
120	NC_015099	ATTC	3	93914	93925	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	32343502
121	NC_015099	CTT	4	94228	94239	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32343502
122	NC_015099	TGA	4	94586	94596	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32343502
123	NC_015099	AAT	4	94701	94712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32343502
124	NC_015099	TTTCC	3	96630	96644	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	32343502
125	NC_015099	AGA	4	97811	97821	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	32343502
126	NC_015099	TTTC	3	98417	98429	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	32343502
127	NC_015099	AAGG	3	99466	99477	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32343502
128	NC_015099	GA	6	100431	100441	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32343502
129	NC_015099	GAA	4	100721	100731	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	32343502
130	NC_015099	TTTG	3	101782	101793	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	32343502
131	NC_015099	GCCG	3	104746	104757	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	32343502
132	NC_015099	GAA	4	107022	107034	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	32343502
133	NC_015099	AGAGAA	3	107765	107782	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	32343502
134	NC_015099	AAGAA	4	109105	109125	21	80 %	0 %	20 %	0 %	9 %	32343502
135	NC_015099	AGA	4	109597	109608	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32343502
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140	NC_015099	AG	6	115484	115495	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32343502
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245	NC_015099	CCTTT	3	192505	192518	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	32343502
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253	NC_015099	GTCC	3	197876	197886	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	32343502
254	NC_015099	TCA	4	198014	198024	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32343502
255	NC_015099	CTTT	3	198463	198473	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343502
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257	NC_015099	CAAA	3	199813	199823	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	32343502
258	NC_015099	TC	6	199902	199913	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32343502
259	NC_015099	CTA	4	199993	200004	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32343502
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261	NC_015099	CGTAT	3	201223	201236	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	32343502
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372	NC_015099	CTTG	3	271329	271340	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	32343502
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374	NC_015099	AT	7	275668	275680	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32343502
375	NC_015099	CTAT	3	275883	275893	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	32343502
376	NC_015099	ATTC	3	276427	276438	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
377	NC_015099	TC	6	277235	277245	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32343502
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380	NC_015099	TTCC	3	281258	281269	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32343502
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479	NC_015099	ATGA	3	350281	350292	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
480	NC_015099	TCTT	3	350845	350855	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
481	NC_015099	TCAG	3	352977	352988	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
482	NC_015099	T	13	353164	353176	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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487	NC_015099	TTTC	3	356523	356534	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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496	NC_015099	CCTT	3	361079	361090	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
497	NC_015099	GGAA	3	361374	361385	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
498	NC_015099	AGGA	3	362124	362135	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
499	NC_015099	AAAC	3	362389	362400	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
500	NC_015099	TC	7	363674	363687	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
501	NC_015099	AAAG	3	364608	364619	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Beta vulgaris subsp. maritima mitochondrion