ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Beta vulgaris subsp. maritima mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015099	AAAG	3	3451	3461	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_015099	AAGA	3	4356	4367	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_015099	TTTG	3	8315	8327	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	32343502
4	NC_015099	TGAT	3	10373	10383	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015099	CTTT	3	10628	10639	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_015099	TTTC	3	11097	11108	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015099	CTTT	3	12982	12993	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015099	TTAC	5	14102	14121	20	25 %	50 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
9	NC_015099	TCGA	3	15701	15712	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015099	GCAA	3	15905	15915	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015099	CTTG	4	16055	16070	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
12	NC_015099	GAAA	3	16126	16136	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_015099	CTTT	3	16566	16577	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32343502
14	NC_015099	TAAG	3	19758	19769	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015099	CACT	3	20825	20835	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	32343503
16	NC_015099	TCTG	3	22699	22710	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015099	CCTT	3	23091	23102	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
18	NC_015099	TACT	3	25798	25809	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_015099	CAAG	3	26082	26093	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
20	NC_015099	TCTA	3	27777	27787	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_015099	CCAA	3	27886	27897	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015099	TTTC	3	29847	29857	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343503
23	NC_015099	TGGC	3	32228	32238	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	32343503
24	NC_015099	AAAC	3	33200	33211	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	32343503
25	NC_015099	CAAG	3	34017	34028	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_015099	TGTA	3	34195	34205	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015099	TTCC	3	34263	34273	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
28	NC_015099	CAGT	3	34800	34811	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_015099	AAGA	3	35669	35680	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015099	TAAC	3	39000	39011	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015099	CAAC	3	40795	40806	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015099	AGCG	3	40935	40945	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_015099	TCTT	3	44360	44370	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_015099	TTCT	3	45057	45068	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_015099	ACTC	3	45614	45624	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_015099	AAGT	3	48314	48325	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32343504
37	NC_015099	TCGC	3	49007	49018	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015099	CTTT	3	58981	58992	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32343502
39	NC_015099	AAGG	3	59554	59566	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32343502
40	NC_015099	TTGA	3	60751	60762	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	32343502
41	NC_015099	TTGT	3	61686	61697	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	32343502
42	NC_015099	TGGC	3	63128	63139	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	32343502
43	NC_015099	TACT	3	65549	65560	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
44	NC_015099	TGAA	3	69099	69109	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32343502
45	NC_015099	TAAG	3	69301	69312	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32343502
46	NC_015099	AAGT	3	70904	70915	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32343502
47	NC_015099	AAGG	3	73515	73527	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	32343502
48	NC_015099	AGTA	3	74511	74523	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	32343502
49	NC_015099	GCAA	3	78475	78485	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	32343502
50	NC_015099	AGCA	3	80550	80561	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	32343502
51	NC_015099	CTTC	4	86555	86569	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	32343502
52	NC_015099	AATG	3	86692	86703	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32343502
53	NC_015099	ACTT	3	88558	88569	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
54	NC_015099	CCTT	3	88775	88785	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32343502
55	NC_015099	TCGA	3	88990	89001	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32343502
56	NC_015099	TTTC	3	89425	89435	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343502
57	NC_015099	ATTC	3	93914	93925	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	32343502
58	NC_015099	TTTC	3	98417	98429	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	32343502
59	NC_015099	AAGG	3	99466	99477	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32343502
60	NC_015099	TTTG	3	101782	101793	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	32343502
61	NC_015099	GCCG	3	104746	104757	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	32343502
62	NC_015099	ATGC	3	112625	112636	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	32343502
63	NC_015099	ATTC	3	112979	112990	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
64	NC_015099	GGAG	3	114580	114591	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	32343502
65	NC_015099	AAAG	3	116186	116196	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32343502
66	NC_015099	AAGA	4	118151	118166	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	32343502
67	NC_015099	TTCC	3	120690	120701	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	32343502
68	NC_015099	TGAA	3	125001	125011	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32343502
69	NC_015099	TGAG	3	125067	125078	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	32343502
70	NC_015099	ATGA	3	125092	125103	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	32343502
71	NC_015099	AGGT	3	128446	128458	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	32343502
72	NC_015099	AAAG	3	130869	130879	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32343502
73	NC_015099	ACTT	3	132103	132114	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	32343502
74	NC_015099	GAAA	3	134232	134242	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32343502
75	NC_015099	GAAA	3	134285	134295	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32343502
76	NC_015099	TTTG	3	135316	135327	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	32343502
77	NC_015099	TTTC	3	136230	136242	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	32343502
78	NC_015099	CAAG	3	137188	137200	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	32343502
79	NC_015099	TCTG	3	140602	140613	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	32343502
80	NC_015099	CCTT	3	140994	141005	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32343502
81	NC_015099	TACT	3	143701	143712	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
82	NC_015099	CAAG	3	143985	143996	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	32343502
83	NC_015099	TCTA	3	145680	145690	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	32343502
84	NC_015099	CCAA	3	145789	145800	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	32343502
85	NC_015099	AAAG	3	146264	146276	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	32343502
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89	NC_015099	CTAT	3	153987	153997	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	32343502
90	NC_015099	ATTC	3	154531	154542	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
91	NC_015099	GATC	3	157807	157819	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	32343502
92	NC_015099	TTCC	3	159362	159373	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	32343502
93	NC_015099	GAAA	3	162057	162069	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	32343502
94	NC_015099	CTGT	3	162098	162109	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	32343502
95	NC_015099	CTAA	3	162175	162185	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	32343502
96	NC_015099	AAAG	3	164549	164561	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	32343502
97	NC_015099	TCTA	3	164893	164904	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
98	NC_015099	CAAG	3	165651	165662	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	32343502
99	NC_015099	CAAA	3	166088	166099	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	32343502
100	NC_015099	ATGA	3	170213	170224	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32343502
101	NC_015099	CCCA	3	174556	174566	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	32343502
102	NC_015099	GCAA	3	175907	175917	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	32343502
103	NC_015099	AAAG	3	176292	176303	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32343502
104	NC_015099	AAAG	3	176674	176684	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32343502
105	NC_015099	CTTT	3	179031	179043	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	32343502
106	NC_015099	CAAT	3	179511	179522	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	32343502
107	NC_015099	ATGG	3	182005	182015	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	32343502
108	NC_015099	CTTT	3	182548	182559	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	32343502
109	NC_015099	AATA	3	186214	186225	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32343502
110	NC_015099	AAAG	3	190830	190840	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32343502
111	NC_015099	GGCA	3	191595	191606	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	32343502
112	NC_015099	ATTC	3	194565	194576	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32343502
113	NC_015099	AAAG	3	194924	194934	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32343502
114	NC_015099	CTTT	3	195911	195922	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32343502
115	NC_015099	TCAG	3	197804	197814	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	32343502
116	NC_015099	GTCC	3	197876	197886	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	32343502
117	NC_015099	CTTT	3	198463	198473	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343502
118	NC_015099	CAAA	3	199813	199823	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	32343502
119	NC_015099	TACG	3	202794	202805	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	32343502
120	NC_015099	CTTT	3	203486	203496	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343502
121	NC_015099	AATT	3	205863	205874	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32343502
122	NC_015099	ATTT	3	206428	206439	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32343502
123	NC_015099	CTTT	3	211633	211643	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343502
124	NC_015099	AAGC	3	211939	211950	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	32343502
125	NC_015099	GTTA	3	212322	212334	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	32343502
126	NC_015099	CTTT	3	212607	212617	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32343502
127	NC_015099	TTCA	3	213039	213049	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	32343502
128	NC_015099	AAAT	3	215292	215303	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32343502
129	NC_015099	TAAG	3	215691	215703	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	32343502
130	NC_015099	AGTA	3	220154	220165	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	32343502
131	NC_015099	CTTT	3	220224	220236	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	32343502
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Beta vulgaris subsp. maritima mitochondrion