ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Apochrysa matsumurae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015095	ATT	4	861	873	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242262
2	NC_015095	ATTT	3	991	1001	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32242262
3	NC_015095	TTTG	3	2340	2350	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	32242262
4	NC_015095	CTTT	3	2883	2894	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32242262
5	NC_015095	TTTA	3	3227	3237	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32242262
6	NC_015095	TAT	4	4002	4014	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242262
7	NC_015095	TAT	4	4151	4162	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242262
8	NC_015095	TTAA	3	5829	5839	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32242262
9	NC_015095	CTTT	3	5872	5882	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32242262
10	NC_015095	AT	6	6054	6065	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015095	CTTT	3	6170	6181	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015095	TATTTA	3	6201	6218	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_015095	TAAA	3	6340	6351	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	32242262
14	NC_015095	ATA	4	6598	6609	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242262
15	NC_015095	AAT	4	6776	6787	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242262
16	NC_015095	TAA	4	7318	7329	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	32242262
17	NC_015095	CTA	4	7497	7508	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32242262
18	NC_015095	TAA	4	7906	7917	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242262
19	NC_015095	TAA	4	8026	8036	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32242262
20	NC_015095	TAA	4	8188	8202	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32242262
21	NC_015095	TAT	6	8967	8983	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	32242262
22	NC_015095	AAAT	3	8984	8994	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32242262
23	NC_015095	TAA	8	9166	9189	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242262
24	NC_015095	AATATA	3	9350	9367	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32242262
25	NC_015095	TA	7	9603	9615	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32242263
26	NC_015095	ATA	4	9728	9738	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32242263
27	NC_015095	ATT	4	9833	9843	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_015095	ATT	5	9860	9873	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_015095	TTTA	3	10077	10088	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32242263
30	NC_015095	ATTTTT	4	10152	10176	25	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	32242263
31	NC_015095	TTAA	3	10240	10252	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32242263
32	NC_015095	TAA	4	10313	10324	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242263
33	NC_015095	ATT	4	10755	10765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242263
34	NC_015095	AATAA	3	11666	11680	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	32242263
35	NC_015095	TAAAA	3	11797	11811	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	32242263
36	NC_015095	AAAT	3	12066	12078	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	32242263
37	NC_015095	ATA	4	12093	12103	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32242263
38	NC_015095	AAT	4	12108	12119	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242263
39	NC_015095	ATT	4	12652	12663	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015095	TTA	4	13377	13388	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015095	ATTC	3	14025	14036	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_015095	AAATTA	3	14323	14339	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_015095	TTAA	3	14875	14885	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_015095	CAATA	3	14952	14965	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
45	NC_015095	ATT	4	15250	15262	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_015095	AT	8	15741	15757	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_015095	ATA	5	15806	15819	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_015095	TTA	4	15821	15832	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015095	AT	6	15865	15877	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_015095	CT	6	15888	15899	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
51	NC_015095	TAT	4	15959	15969	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_015095	AT	6	15975	15987	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_015095	ATTTAT	3	16003	16020	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Apochrysa matsumurae mitochondrion