ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chrysoperla nipponensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015093	TAT	4	697	708	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242259
2	NC_015093	TAATTT	3	742	759	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	32242259
3	NC_015093	ATT	4	865	877	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242259
4	NC_015093	ATTT	3	995	1005	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32242259
5	NC_015093	TTAA	3	1360	1372	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_015093	TAT	4	2069	2080	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242259
7	NC_015093	AGG	4	2160	2171	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	32242259
8	NC_015093	TTAA	3	3243	3254	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32242259
9	NC_015093	ATT	4	3753	3763	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242259
10	NC_015093	TAT	4	4160	4170	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242259
11	NC_015093	TTAGCT	3	4386	4403	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	32242259
12	NC_015093	TAT	4	5633	5643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242259
13	NC_015093	TATT	3	6001	6012	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015093	AAATA	3	6360	6373	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	32242260
15	NC_015093	AT	6	6431	6441	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32242260
16	NC_015093	AAT	4	6610	6620	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32242260
17	NC_015093	AAATAT	3	6932	6948	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32242260
18	NC_015093	ATA	4	7335	7346	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242260
19	NC_015093	AAG	4	7473	7484	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32242260
20	NC_015093	AAAT	3	7568	7578	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32242260
21	NC_015093	TAA	4	8205	8219	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32242260
22	NC_015093	AAT	4	8320	8331	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242260
23	NC_015093	ATT	6	8946	8963	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	32242260
24	NC_015093	AAAT	3	9048	9058	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32242260
25	NC_015093	CAAA	3	9134	9144	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	32242260
26	NC_015093	AAAT	3	9212	9223	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32242260
27	NC_015093	AATT	3	9754	9766	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32242260
28	NC_015093	ATT	4	9850	9860	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015093	ATT	5	9877	9891	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_015093	ATTT	4	10334	10349	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	32242260
31	NC_015093	ATTT	3	11004	11014	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32242260
32	NC_015093	TTA	4	11132	11144	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242260
33	NC_015093	ATTA	3	11643	11654	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32242260
34	NC_015093	AAAT	3	12080	12092	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	32242260
35	NC_015093	ATA	5	12120	12134	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32242260
36	NC_015093	CTA	4	12522	12533	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32242260
37	NC_015093	AAATT	3	13047	13060	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_015093	TAA	4	13422	13432	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_015093	TTTA	3	13568	13579	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_015093	TTTTA	3	13713	13727	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_015093	TAAT	3	13815	13826	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015093	ATT	4	13871	13881	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_015093	ATT	5	13914	13928	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_015093	TTTA	3	14452	14464	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_015093	TTTAA	3	14534	14549	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_015093	TTA	5	14695	14709	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_015093	TAAA	4	14866	14881	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_015093	TAT	4	15052	15063	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015093	TAA	4	15299	15310	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_015093	AAAT	3	15406	15416	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_015093	AAT	4	15457	15467	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_015093	TA	6	15506	15516	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_015093	TA	10	15524	15544	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_015093	TA	11	15555	15576	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_015093	CAAT	3	15703	15714	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_015093	TA	7	15806	15818	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_015093	ATT	5	15820	15834	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_015093	AT	6	15869	15881	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_015093	TA	8	15896	15911	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_015093	ATT	4	16031	16041	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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