ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Erodium carvifolium chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015083	ACCTA	3	234	248	15	40 %	20 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
2	NC_015083	AAAC	3	1673	1683	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015083	TGTT	3	1994	2005	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015083	ACCC	3	3959	3970	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
5	NC_015083	TGTA	4	4595	4610	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_015083	GTTT	3	5141	5152	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	32314881
7	NC_015083	TA	7	5590	5603	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_015083	AAAT	5	5629	5647	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
9	NC_015083	TTTC	3	6708	6718	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32314881
10	NC_015083	A	12	7881	7892	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015083	A	13	7930	7942	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_015083	CAC	4	10685	10695	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	32314881
13	NC_015083	TTGA	3	11143	11154	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	32314881
14	NC_015083	TTTC	3	11676	11687	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32314881
15	NC_015083	TATT	3	12356	12366	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015083	TAA	4	12476	12486	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_015083	GAATCA	3	13515	13533	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
18	NC_015083	TGTT	3	15123	15133	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	32314881
19	NC_015083	AAAG	3	15544	15554	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_015083	TTA	4	15675	15686	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015083	TCCCCT	4	17950	17973	24	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	32314882
22	NC_015083	TTTC	3	21455	21465	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	32314882
23	NC_015083	ATTG	3	21911	21922	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	32314882
24	NC_015083	TTCT	5	22682	22700	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	32314882
25	NC_015083	GTT	4	22915	22926	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32314882
26	NC_015083	CATT	3	26302	26313	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32314882
27	NC_015083	GTAA	3	26836	26846	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_015083	A	15	27111	27125	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_015083	TAT	5	27944	27957	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_015083	AATT	3	27959	27970	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015083	GAAA	3	27994	28004	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_015083	GAA	4	28083	28094	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_015083	GAA	4	28113	28124	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_015083	CAAA	4	28146	28161	16	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
35	NC_015083	GGAA	3	30881	30893	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_015083	GAGGA	3	30933	30946	14	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_015083	AATA	4	31102	31116	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_015083	GTT	4	31508	31518	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_015083	TTA	4	32012	32024	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_015083	ATA	4	32025	32036	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_015083	ATT	4	32172	32183	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_015083	AATCT	3	32186	32200	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
43	NC_015083	AG	6	32517	32527	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	32314882
44	NC_015083	TAGA	3	32954	32965	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_015083	CT	6	33147	33157	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_015083	AAGC	3	33950	33960	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	32314882
47	NC_015083	TA	6	34254	34264	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314882
48	NC_015083	TTTC	3	34352	34363	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	32314882
49	NC_015083	T	14	36910	36923	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_015083	TCT	4	37193	37203	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32314882
51	NC_015083	ATTG	3	38582	38592	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	32314882
52	NC_015083	ATG	4	38735	38745	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32314882
53	NC_015083	TG	6	40670	40680	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	32314883
54	NC_015083	CTAT	3	42289	42301	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
55	NC_015083	TCT	4	42575	42585	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32314883
56	NC_015083	TTTA	3	42943	42954	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32314883
57	NC_015083	TAAG	3	43270	43280	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	32314883
58	NC_015083	AAAT	3	44928	44939	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_015083	ATA	4	46819	46830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015083	A	12	46968	46979	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_015083	ATTCT	3	47300	47314	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
62	NC_015083	TAA	4	48592	48602	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_015083	T	14	48784	48797	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_015083	TTTA	3	48984	48995	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015083	GTTG	3	49775	49785	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	32314883
66	NC_015083	AT	7	50396	50409	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_015083	CAAA	3	50897	50907	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_015083	TAT	5	51441	51455	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_015083	GATGT	3	52190	52204	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_015083	TTATTC	3	52415	52431	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
71	NC_015083	ATA	4	54454	54465	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32314883
72	NC_015083	ATTCA	3	54625	54640	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
73	NC_015083	TGCA	3	56128	56140	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	32314883
74	NC_015083	GTT	4	57106	57116	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32314883
75	NC_015083	TTCTT	3	57738	57752	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	32314884
76	NC_015083	TA	6	58655	58665	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_015083	AGAATT	3	58672	58688	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_015083	TTAT	3	58702	58713	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_015083	ATATGT	4	58714	58738	25	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_015083	TATT	3	59750	59761	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_015083	TCAA	3	60877	60888	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	32314884
82	NC_015083	AAT	4	61274	61285	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_015083	CT	6	61671	61682	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
84	NC_015083	A	15	61728	61742	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_015083	AAAG	3	61990	62000	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_015083	TA	6	63034	63044	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32314884
87	NC_015083	TAA	4	63538	63548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32314884
88	NC_015083	T	12	63994	64005	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	32314884
89	NC_015083	A	14	65304	65317	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_015083	AAGC	3	66662	66674	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
91	NC_015083	TTTTC	3	67527	67540	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
92	NC_015083	CTT	4	67665	67676	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015083	TCGT	3	69879	69890	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	32314885
94	NC_015083	ATTT	4	70110	70125	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	32314885
95	NC_015083	TCT	4	70739	70750	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32314885
96	NC_015083	GAAT	3	71274	71286	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	32314885
97	NC_015083	TCT	4	72947	72958	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32314885
98	NC_015083	ACA	4	73094	73104	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	32314885
99	NC_015083	TA	6	73126	73137	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32314885
100	NC_015083	TAAA	3	73447	73457	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32314885
101	NC_015083	AT	6	73500	73512	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32314885
102	NC_015083	T	14	74416	74429	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	32314885
103	NC_015083	AAAC	3	74673	74684	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	32314885
104	NC_015083	GTTT	3	74903	74914	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	32314885
105	NC_015083	TCT	4	77575	77586	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32314885
106	NC_015083	ATC	4	80189	80199	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32314885
107	NC_015083	T	14	81644	81657	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	32314885
108	NC_015083	TTA	4	83225	83236	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32314885
109	NC_015083	AAAG	3	83257	83267	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32314885
110	NC_015083	TTAA	3	83276	83287	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32314885
111	NC_015083	T	15	84770	84784	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	32314885
112	NC_015083	ATATG	3	85130	85144	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	32314885
113	NC_015083	GAT	4	85173	85183	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32314885
114	NC_015083	AG	6	85475	85486	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	32314885
115	NC_015083	TTTA	3	86998	87009	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	32314885
116	NC_015083	TCT	4	93025	93036	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
117	NC_015083	CGAAG	3	94732	94746	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
118	NC_015083	ATCC	3	95932	95943	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
119	NC_015083	AGG	4	96458	96469	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_015083	GAGG	3	99861	99872	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_015083	AGGT	3	100090	100101	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_015083	TTTC	3	101487	101498	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_015083	GAAA	3	101510	101521	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_015083	TCTATA	3	102675	102692	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
125	NC_015083	AAG	4	104180	104191	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32314887
126	NC_015083	AATA	3	104849	104860	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32314887
127	NC_015083	TGT	4	104925	104935	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32314887
128	NC_015083	TAGA	3	105727	105738	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_015083	GAAA	3	106728	106739	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_015083	AGA	4	106765	106775	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_015083	A	12	107281	107292	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_015083	AGG	4	107400	107410	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_015083	AAG	4	107454	107464	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	32314887
134	NC_015083	GATT	3	109721	109732	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	32314887
135	NC_015083	GAAA	3	110054	110064	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32314887
136	NC_015083	AT	7	110090	110103	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32314887
137	NC_015083	TCTT	4	111764	111778	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
138	NC_015083	TTTC	3	111829	111841	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
139	NC_015083	ATT	4	113059	113070	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015083	AGA	4	115868	115880	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	32314888
141	NC_015083	AGAA	3	116326	116336	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	32314888
142	NC_015083	TAA	4	116892	116903	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Erodium carvifolium chloroplast