ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Erodium carvifolium chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015083	CAC	4	10685	10695	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	32314881
2	NC_015083	TAA	4	12476	12486	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015083	TTA	4	15675	15686	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015083	GTT	4	22915	22926	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	32314882
5	NC_015083	TAT	5	27944	27957	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_015083	GAA	4	28083	28094	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_015083	GAA	4	28113	28124	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_015083	GTT	4	31508	31518	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_015083	TTA	4	32012	32024	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_015083	ATA	4	32025	32036	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_015083	ATT	4	32172	32183	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_015083	TCT	4	37193	37203	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32314882
13	NC_015083	ATG	4	38735	38745	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32314882
14	NC_015083	TCT	4	42575	42585	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	32314883
15	NC_015083	ATA	4	46819	46830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_015083	TAA	4	48592	48602	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_015083	TAT	5	51441	51455	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_015083	ATA	4	54454	54465	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32314883
19	NC_015083	GTT	4	57106	57116	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32314883
20	NC_015083	AAT	4	61274	61285	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015083	TAA	4	63538	63548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32314884
22	NC_015083	CTT	4	67665	67676	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015083	TCT	4	70739	70750	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32314885
24	NC_015083	TCT	4	72947	72958	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32314885
25	NC_015083	ACA	4	73094	73104	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	32314885
26	NC_015083	TCT	4	77575	77586	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	32314885
27	NC_015083	ATC	4	80189	80199	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32314885
28	NC_015083	TTA	4	83225	83236	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32314885
29	NC_015083	GAT	4	85173	85183	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32314885
30	NC_015083	TCT	4	93025	93036	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015083	AGG	4	96458	96469	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_015083	AAG	4	104180	104191	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	32314887
33	NC_015083	TGT	4	104925	104935	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32314887
34	NC_015083	AGA	4	106765	106775	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_015083	AGG	4	107400	107410	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_015083	AAG	4	107454	107464	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	32314887
37	NC_015083	ATT	4	113059	113070	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015083	AGA	4	115868	115880	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	32314888
39	NC_015083	TAA	4	116892	116903	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Erodium carvifolium chloroplast