ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Penicillium digitatum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015080	ATT	4	1170	1181	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015080	TAA	4	1203	1213	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015080	TTA	6	2069	2086	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	32242243
4	NC_015080	TGG	4	2158	2169	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	32242243
5	NC_015080	TTA	4	3109	3119	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_015080	ATT	4	3855	3865	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_015080	ATA	5	4181	4195	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_015080	ATA	5	4666	4679	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_015080	ACA	4	5715	5726	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	32242243
10	NC_015080	TTA	4	6139	6151	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_015080	ATA	4	6440	6450	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32242243
12	NC_015080	ATT	4	6633	6643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242243
13	NC_015080	AAT	4	7305	7316	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015080	GAA	4	7488	7498	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_015080	ATT	4	9514	9525	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242244
16	NC_015080	TAA	4	10500	10511	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_015080	TTA	4	10557	10567	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_015080	TTA	4	11225	11235	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242244
19	NC_015080	TTA	4	11353	11364	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242244
20	NC_015080	TAA	4	12410	12422	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_015080	TAT	4	13805	13816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_015080	ATT	4	15267	15278	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_015080	ATA	4	15386	15396	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_015080	TTA	4	15516	15530	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	32242244
25	NC_015080	ATT	4	15906	15916	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242244
26	NC_015080	TTA	4	15948	15959	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242244
27	NC_015080	ATT	4	16127	16138	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242244
28	NC_015080	TAT	5	16867	16881	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32242244
29	NC_015080	TAT	9	17127	17153	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_015080	TAT	4	17502	17514	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_015080	ATA	6	17764	17780	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32242244
32	NC_015080	GTA	4	17830	17840	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32242244
33	NC_015080	TAT	5	18457	18471	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_015080	AAT	9	18463	18489	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_015080	ATT	5	18600	18613	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_015080	TAA	5	18623	18636	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_015080	AGT	4	18894	18905	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_015080	AAC	4	21329	21340	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	32242244
39	NC_015080	TAT	5	21656	21669	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242244
40	NC_015080	TAT	4	22406	22416	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_015080	GAT	4	22623	22635	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_015080	TAT	4	23433	23445	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_015080	AGT	4	25034	25046	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_015080	ATA	4	25435	25446	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_015080	TTA	4	25556	25567	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_015080	ATT	5	26377	26391	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_015080	TTA	4	26908	26920	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_015080	ATT	4	26950	26960	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Penicillium digitatum mitochondrion