ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Penicillium digitatum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015080	CTTAAG	3	463	479	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
2	NC_015080	TTAA	3	610	620	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_015080	ATT	4	1170	1181	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015080	TAA	4	1203	1213	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_015080	AATT	3	1312	1322	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32242243
6	NC_015080	TTTATT	3	1813	1830	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	32242243
7	NC_015080	TTA	6	2069	2086	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	32242243
8	NC_015080	TGG	4	2158	2169	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	32242243
9	NC_015080	TA	8	3078	3094	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_015080	TTA	4	3109	3119	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_015080	TA	7	3184	3197	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_015080	AATATA	3	3250	3273	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_015080	TAATC	3	3453	3467	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015080	TTAGA	3	3496	3510	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_015080	ATT	4	3855	3865	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_015080	ACTAA	3	4084	4097	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_015080	ATA	5	4181	4195	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_015080	ATA	5	4666	4679	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_015080	ATAGGT	3	5406	5423	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	32242243
20	NC_015080	TA	6	5596	5607	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_015080	ACA	4	5715	5726	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	32242243
22	NC_015080	TTA	4	6139	6151	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_015080	A	14	6159	6172	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_015080	AAAT	3	6321	6332	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32242243
25	NC_015080	ATA	4	6440	6450	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32242243
26	NC_015080	ATT	4	6633	6643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242243
27	NC_015080	AAT	4	7305	7316	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015080	GAA	4	7488	7498	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015080	TTTA	3	7891	7902	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_015080	A	17	7963	7979	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_015080	ATT	4	9514	9525	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242244
32	NC_015080	TAA	4	10500	10511	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_015080	TTA	4	10557	10567	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_015080	TTAT	3	11193	11203	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32242244
35	NC_015080	TTA	4	11225	11235	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242244
36	NC_015080	TTA	4	11353	11364	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242244
37	NC_015080	AT	7	11519	11531	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32242244
38	NC_015080	AT	8	12372	12388	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_015080	AATATT	3	12389	12406	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_015080	TAA	4	12410	12422	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_015080	AT	7	12428	12441	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_015080	AT	8	12524	12539	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_015080	TATT	3	12559	12570	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015080	TAT	4	13805	13816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_015080	AT	9	14036	14052	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_015080	ATTAAT	4	14140	14163	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_015080	ATAA	6	14185	14206	22	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_015080	TAAT	3	14670	14682	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32242244
49	NC_015080	ATT	4	15267	15278	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_015080	GTAT	5	15360	15378	19	25 %	50 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_015080	ATA	4	15386	15396	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_015080	TTA	4	15516	15530	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	32242244
53	NC_015080	ATT	4	15906	15916	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242244
54	NC_015080	TTA	4	15948	15959	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242244
55	NC_015080	ATT	4	16127	16138	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242244
56	NC_015080	TAT	5	16867	16881	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32242244
57	NC_015080	TAT	9	17127	17153	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_015080	TAT	4	17502	17514	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_015080	ATA	6	17764	17780	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32242244
60	NC_015080	GTA	4	17830	17840	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	32242244
61	NC_015080	AT	8	18424	18438	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_015080	TAT	5	18457	18471	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_015080	AAT	9	18463	18489	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_015080	ATT	5	18600	18613	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_015080	TAA	5	18623	18636	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_015080	AGT	4	18894	18905	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_015080	TTAT	3	19810	19821	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_015080	AAATA	3	20245	20258	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_015080	TA	7	20263	20275	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_015080	AT	12	20326	20356	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_015080	AT	13	20339	20375	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_015080	TATTT	4	20778	20797	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	32242244
73	NC_015080	AT	6	20963	20973	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32242244
74	NC_015080	AAC	4	21329	21340	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	32242244
75	NC_015080	TAT	5	21656	21669	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242244
76	NC_015080	TAT	4	22406	22416	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_015080	GAT	4	22623	22635	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_015080	AT	6	22935	22946	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_015080	A	16	23275	23290	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_015080	TAT	4	23433	23445	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_015080	GAATTA	3	24215	24233	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
82	NC_015080	ATTA	3	24683	24694	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_015080	AATT	3	24994	25005	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_015080	AGT	4	25034	25046	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_015080	ATA	4	25435	25446	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_015080	TTA	4	25556	25567	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_015080	TAAAA	3	25606	25619	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_015080	A	19	25621	25639	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
89	NC_015080	CAAG	3	25666	25677	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_015080	TA	6	26344	26355	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_015080	ATT	5	26377	26391	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_015080	TTA	4	26908	26920	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_015080	ATT	4	26950	26960	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_015080	A	15	27820	27834	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	32242244

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